RNA–Protein interactions for RNA: YLR317W

YLR317W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YLR317W, Length 435 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR317W	YLR317W	FLX1	P40464	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	PRM5	P40476	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	PAU4	P53427	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	AVO2	Q04749	426 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	RFU1	Q08003	200 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	YOR186W	Q08560	144 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	FRE7	Q12333	620 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	HUT1	Q12520	339 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	COA6	Q3E846	104 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	YLR415C	O13578	112 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	COX5B	P00425	151 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	PAU19	P0CE85	124 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	PAU21	P0CE86	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	PAU22	P0CE87	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	PAU1	P0CE88	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	PAU14	P0CE89	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	PAU6	P0CE90	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	PAU18	P0CE91	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	PAU8	P0CE92	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	PAU11	P0CE93	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	MDH2	P22133	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	YCR006C	P25350	157 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	PAU3	P25610	124 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	ERV1	P27882	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	MNS1	P32906	549 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	YUH1	P35127	236 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	FIG1	P38224	298 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	PAU13	P38725	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	LTP1	P40347	161 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	RFC2	P40348	353 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	CFD1	P40558	293 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	REE1	P40893	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	MSY1	P48527	492 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	BNS1	P50084	137 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	YGL114W	P53134	725 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	ERV14	P53173	138 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	SKO1	Q02100	647 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	PAU10	Q03050	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	FSH2	Q05015	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	PAU20	Q08322	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	PAU9	Q3E770	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	COA2	Q3E823	68 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	COX1	P00401	534 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	RPB7	P34087	171 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	YBR013C	P38215	129 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	PAC2	P39937	518 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	CUP9	P41817	306 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	YJR096W	P47137	282 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	PDR17	P53844	350 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	FRE8	Q12209	686 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	PRR2	Q12310	699 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	QCR9	P22289	66 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	UPS2	P35200	230 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	MRPL28	P36527	147 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	IRC22	P40006	225 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	PGU1	P47180	361 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	YGL185C	P53100	379 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	PCP1	P53259	346 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	YDC1	Q02896	317 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	TRS23	Q03784	219 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	GIS1	Q03833	894 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	YOR376W	Q08900	122 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	YPL264C	Q08980	353 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	DCN1	Q12395	269 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	YOP1	Q12402	180 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	ERG8	P24521	451 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	AHT1	P29589	182 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	YKL075C	P36083	450 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	YHR210C	P38893	341 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YLR317W	YLR317W	FLO5	P38894	1075 aa		4.84	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.3 ms