RNA–Protein interactions for RNA: YJL135W

YJL135W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJL135W, Length 318 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL135W	YJL135W	LCL2	Q08045	131 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	RAD28	Q12021	506 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	GCN3	P14741	305 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.49	□□□□□ -2.33	not detected
YJL135W	YJL135W	SOK1	P40317	901 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	YGR050C	P53231	118 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	CWC27	Q02770	301 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	JLP1	Q12358	412 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	0.48	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	IRC18	P47056	224 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	SEY1	Q99287	776 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	ATP15	P21306	62 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	VMA22	P38784	181 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	TRM5	P38793	499 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	TVP23	P38962	199 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	ERG28	P40030	148 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	MGA1	P53050	456 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	PDR17	P53844	350 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	MDM35	O60200	86 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	STE18	P18852	110 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	ECM4	P36156	370 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	YNL194C	P40169	301 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	YPL073C	P40323	161 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	OTU1	P43558	301 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	COG5	P53951	403 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	PET191	Q02772	108 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	MDM32	Q12171	622 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	HFA1	P32874	2273 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	MER1	P16523	270 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	COQ1	P18900	473 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	SPO13	P23624	291 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	GET1	P53192	235 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	YOL160W	Q08321	113 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	DGA1	Q08650	418 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	NCB2	Q92317	146 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	ODC2	Q99297	307 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	SPS18	P32572	300 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	YFH7	P43591	353 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	RAD17	P48581	401 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	MPC3	P53311	146 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	YNG1	Q08465	219 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	OCH1	P31755	480 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	YCR087C-A	P37263	153 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	MSS2	P40990	351 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	AIM25	P47140	327 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	YMR252C	Q04814	134 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	FUS2	Q05670	677 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	YCL042W	P25572	119 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	STP22	P25604	385 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	IKI1	P38874	309 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	AIM2	P39721	246 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	HPA3	P39979	161 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	YEA4	P40004	342 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	DAD4	P69851	72 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	YMR295C	Q03559	197 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	DYN3	Q04949	312 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	IRC23	Q08416	157 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YJL135W	YJL135W	YPK2	P18961	677 aa		0.41	□□□□□ -2.34

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