RNA–Protein interactions for RNA: YHR171W

ATG7, Transcript of Autophagy-related protein and dual specificity member of the E1 family, yeast

Gene ATG7, Length 1,893 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG7	YHR171W	CAB4	P53332	305 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG7	YHR171W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ATG7	YHR171W	INP1	Q03694	420 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG7	YHR171W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ATG7	YHR171W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG7	YHR171W	MRP49	P32388	137 aa		4.65	□□□□□ -1.66
ATG7	YHR171W	SEC17	P32602	292 aa		4.65	□□□□□ -1.66
ATG7	YHR171W	YPL073C	P40323	161 aa		4.65	□□□□□ -1.66
ATG7	YHR171W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
ATG7	YHR171W	YGL088W	P53151	121 aa		4.65	□□□□□ -1.66
ATG7	YHR171W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
ATG7	YHR171W	CCH1	P50077	2039 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	TKL2	P33315	681 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	MSA2	P36157	363 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	DLS1	P40366	167 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	NDD1	Q08887	554 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	TFC1	P32367	649 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	GGC1	P38988	300 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	AVT1	P47082	602 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	TTI2	P47168	421 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	NKP2	Q06162	153 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	SDH3	P33421	198 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	ZRT3	P34240	503 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	CNL1	Q06333	122 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	YLR462W	O13556	202 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
ATG7	YHR171W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	POP4	P38336	279 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	VMA7	P39111	118 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	YEL075C	P39972	122 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	SNM1	P40993	198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	YFR054C	P43622	192 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	OST2	P46964	130 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	SLM2	P53955	656 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	YDR115W	Q04598	105 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	DGK1	Q12382	290 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	NMT1	P14743	455 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	YGR219W	P53307	113 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	API2	Q04413	109 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	FYV7	Q12247	151 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	SYS1	P41544	203 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	RPE1	P46969	238 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	UFD1	P53044	361 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	BOR1	P53838	576 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	YCR043C	P25361	127 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	YPT53	P36019	220 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	YBR063C	P38083	404 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	FIP1	P45976	327 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	TDA4	P47153	279 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	GEP5	Q12393	293 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	YPL247C	Q12523	523 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	SFC1	P33303	322 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	PGU1	P47180	361 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	YDR366C	P87287	132 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	ECM19	Q06011	112 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	XPT1	P47165	209 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	VPS71	Q03433	280 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	MCP1	Q12106	302 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATG7	YHR171W	TEM1	P38987	245 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG7	YHR171W	HHO1	P53551	258 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG7	YHR171W	APS2	Q00381	147 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG7	YHR171W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATG7	YHR171W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATG7	YHR171W	OM14	P38325	134 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG7	YHR171W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATG7	YHR171W	FCY21	P40039	528 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG7	YHR171W	YGR039W	P53225	103 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG7	YHR171W	PBA1	Q05778	276 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG7	YHR171W	IRC25	Q07951	179 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG7	YHR171W	YPL264C	Q08980	353 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG7	YHR171W	RPB9	P27999	122 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG7	YHR171W	HYM1	P32464	399 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG7	YHR171W	AYR1	P40471	297 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG7	YHR171W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATG7	YHR171W	YLR156W	P0CE96	114 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG7	YHR171W	YLR159W	P0CE97	114 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG7	YHR171W	YLR161W	P0CE98	114 aa		4.56	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 283.4 ms