RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)M

tW(CCA)M, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)M, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)MtW(CCA)M YLR278CQ05854 1341 aa3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M VPS4P52917 437 aa3.35□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M DUS1P53759 423 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M SYF1Q04048 859 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M DIB1Q06819 143 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M GRX6Q12438 231 aa3.35□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M HPR1P17629 752 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M AFG2P32794 780 aa3.34□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M PNT1P38969 423 aa3.34□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M MPP10P47083 593 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M UBP16Q02863 499 aa3.34□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M THI22Q06490 572 aa3.34□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M GAS5Q08193 484 aa3.34□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M TPD3P31383 635 aa3.33□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M GLC3P32775 704 aa3.33□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M TIF4632P39936 914 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M MAM1P40065 302 aa3.33□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M SET4P42948 560 aa3.33□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M GYP7P48365 746 aa3.33□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M RTT109Q07794 436 aa3.33□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M RIM15P43565 1770 aa3.33□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M TRP5P00931 707 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data3.32□□□□□ -1.88not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M KRE2P27809 442 aa3.32□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M NGR1P32831 672 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M NUP133P36161 1157 aa3.32□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M STV1P37296 890 aa3.32□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M PEA2P40091 420 aa3.32□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M YIL089WP40500 205 aa3.32□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M YGR117CP53270 476 aa3.32□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M YGR122WP53272 402 aa3.32□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M RPT4P53549 437 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M TIM50Q02776 476 aa3.32□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M CWC15Q03772 175 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M YOL057WQ08225 711 aa3.32□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M RRG1Q12167 365 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M RPS9BP05755 195 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M CBP1P07252 654 aa3.31□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M SWC3P31376 625 aa3.31□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M MGM1P32266 881 aa3.31□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M ICP55P40051 511 aa3.31□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M EMP47P43555 445 aa3.31□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M ITC1P53125 1264 aa3.31□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M DNM1P54861 757 aa3.31□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M YLR271WQ06152 274 aa3.31□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M TOS4Q06266 489 aa3.31□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M YDL144CQ07589 356 aa3.31□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M PSH1Q12161 406 aa3.31□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M DPH6Q12429 685 aa3.31□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M SWI1P09547 1314 aa3.3□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M SDH2P21801 266 aa3.3□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M ETP1P38748 585 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M SPL2P38839 148 aa3.3□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M CST6P40535 587 aa3.3□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M HXT10P43581 546 aa3.3□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M SRT1Q03175 343 aa3.3□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M CRF1Q04930 467 aa3.3□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M THI3Q07471 609 aa3.3□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M NOP8Q08287 484 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M MRP7P12687 371 aa3.29□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M PAM1P37304 830 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M IRC4Q03036 179 aa3.29□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M SRC1Q03707 834 aa3.29□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M PRP42Q03776 544 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M SNU66Q12420 587 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M TIF6Q12522 245 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M PMD1P32634 1753 aa3.28□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M SSK22P25390 1331 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M LCB1P25045 558 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M RPS7AP26786 190 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M RPT3P33298 428 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M PEX29Q03370 554 aa3.28□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M YDR306CQ06640 478 aa3.28□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M CSR2Q12734 1121 aa3.28□□□□□ -1.88
tW(CCA)MtW(CCA)M RAD24P32641 659 aa3.27□□□□□ -1.89
tW(CCA)MtW(CCA)M SLA1P32790 1244 aa3.27□□□□□ -1.89
tW(CCA)MtW(CCA)M PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data3.27□□□□□ -1.89not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M UBP12P39538 1254 aa3.27□□□□□ -1.89
tW(CCA)MtW(CCA)M JJJ2P46997 583 aa3.27□□□□□ -1.89
tW(CCA)MtW(CCA)M HEF3P53978 1044 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
tW(CCA)MtW(CCA)M SUP35P05453 685 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tW(CCA)MtW(CCA)M HVG1P0CE11 249 aa3.26□□□□□ -1.89
tW(CCA)MtW(CCA)M SPT21P35209 758 aa3.26□□□□□ -1.89
tW(CCA)MtW(CCA)M MTC3P53077 123 aa3.26□□□□□ -1.89
tW(CCA)MtW(CCA)M JIP4Q03361 876 aa3.26□□□□□ -1.89
tW(CCA)MtW(CCA)M PIB1Q06651 286 aa3.26□□□□□ -1.89
tW(CCA)MtW(CCA)M FLO11P08640 1367 aa3.25□□□□□ -1.89
tW(CCA)MtW(CCA)M ARG82P07250 355 aa3.25□□□□□ -1.89
tW(CCA)MtW(CCA)M SUI2P20459 304 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tW(CCA)MtW(CCA)M MAC1P35192 417 aa3.25□□□□□ -1.89
tW(CCA)MtW(CCA)M APE3P37302 537 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tW(CCA)MtW(CCA)M BSD2P38356 321 aa3.25□□□□□ -1.89
tW(CCA)MtW(CCA)M SET1P38827 1080 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tW(CCA)MtW(CCA)M NIT1P40447 199 aa3.25□□□□□ -1.89
tW(CCA)MtW(CCA)M YIR042CP40586 236 aa3.25□□□□□ -1.89
tW(CCA)MtW(CCA)M YJR008WP47085 338 aa3.25□□□□□ -1.89
tW(CCA)MtW(CCA)M NCS6P53088 359 aa3.25□□□□□ -1.89
tW(CCA)MtW(CCA)M RRT6P53117 311 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
tW(CCA)MtW(CCA)M PUS6P53294 404 aa3.25□□□□□ -1.89
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