RNA–Protein interactions for RNA: tT(AGU)C

tT(AGU)C, Transcript of Threonine tRNA (tRNA-Thr), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tT(AGU)C, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tT(AGU)CtT(AGU)C SAP155P43612 1002 aa0.91□□□□□ -2.26
tT(AGU)CtT(AGU)C MPP10P47083 593 aaKnown RBP0.91□□□□□ -2.26
tT(AGU)CtT(AGU)C CWH41P53008 833 aa0.91□□□□□ -2.26
tT(AGU)CtT(AGU)C ITC1P53125 1264 aa0.91□□□□□ -2.26
tT(AGU)CtT(AGU)C YGR117CP53270 476 aa0.91□□□□□ -2.26
tT(AGU)CtT(AGU)C ZDS2P54786 942 aa0.91□□□□□ -2.26
tT(AGU)CtT(AGU)C SRT1Q03175 343 aa0.91□□□□□ -2.26
tT(AGU)CtT(AGU)C DPL1Q05567 589 aa0.91□□□□□ -2.26
tT(AGU)CtT(AGU)C BDF2Q07442 638 aa0.91□□□□□ -2.26
tT(AGU)CtT(AGU)C YDL144CQ07589 356 aa0.91□□□□□ -2.26
tT(AGU)CtT(AGU)C ALE1Q08548 619 aa0.91□□□□□ -2.26
tT(AGU)CtT(AGU)C VPS13Q07878 3144 aa0.91□□□□□ -2.26
tT(AGU)CtT(AGU)C TRP5P00931 707 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C SNF3P10870 884 aa0.9□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C SSA4P22202 642 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C LCB1P25045 558 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data0.9□□□□□ -2.27not detected
tT(AGU)CtT(AGU)C GCD7P32502 381 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C RTG2P32608 588 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C GLC3P32775 704 aa0.9□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C YKU70P32807 602 aa0.9□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C SER1P33330 395 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C NPL4P33755 580 aa0.9□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C UBP12P39538 1254 aa0.9□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C BOI2P39969 1040 aa0.9□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C NUG1P40010 520 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C RTR1P40084 226 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C YER156CP40093 338 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C RRT14P40470 206 aa0.9□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C YIL092WP40497 633 aa0.9□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data0.9□□□□□ -2.27not detected
tT(AGU)CtT(AGU)C HXT10P43581 546 aa0.9□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C HGH1P48362 394 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C PEX21P50091 288 aa0.9□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C MSN5P52918 1224 aa0.9□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C YGL082WP53155 381 aa0.9□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C PAP2P53632 584 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C FCP1Q03254 732 aa0.9□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C ATG20Q07528 640 aa0.9□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C CDC45Q08032 650 aa0.9□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C GAS5Q08193 484 aa0.9□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C DPH6Q12429 685 aa0.9□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C FLO11P08640 1367 aa0.9□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C UTP10P42945 1769 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C RIM15P43565 1770 aa0.89□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C ARG82P07250 355 aa0.89□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C CDC16P09798 840 aa0.89□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C MRP7P12687 371 aa0.89□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C ICL1P28240 557 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C TPD3P31383 635 aa0.89□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C MGM1P32266 881 aa0.89□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C FRD1P32614 470 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C RAD24P32641 659 aa0.89□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C MOT2P34909 587 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C KTR3P38130 404 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C PEA2P40091 420 aa0.89□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C YIL089WP40500 205 aa0.89□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C YPP1P46951 817 aa0.89□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C MTC3P53077 123 aa0.89□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C YGR122WP53272 402 aa0.89□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C HPC2Q01448 625 aa0.89□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C PRP42Q03776 544 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C UBX2Q04228 584 aa0.89□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C CSI1Q04368 295 aa0.89□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C ACK1Q07622 623 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C CTI6Q08923 506 aa0.89□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C WRS1Q12109 432 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C PSF3Q12146 194 aa0.89□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C GYP5Q12344 894 aa0.89□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C GRX6Q12438 231 aa0.89□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C RVB2Q12464 471 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C SRF1Q12516 437 aa0.89□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C FLO1P32768 1537 aa0.89□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C CYB2P00175 591 aa0.88□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C AI2P03876 854 aa0.88□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C SUP35P05453 685 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C PIF1P07271 859 aa0.88□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C HVG1P0CE11 249 aa0.88□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C CAF20P12962 161 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C KIN1P13185 1064 aa0.88□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C DAL5P15365 543 aa0.88□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C SEC18P18759 758 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C GAP1P19145 602 aaPredicted RBP0.88□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C MSM1P22438 575 aa0.88□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C SWC3P31376 625 aa0.88□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C NUP133P36161 1157 aa0.88□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C GEF1P37020 779 aa0.88□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data0.88□□□□□ -2.27not detected
tT(AGU)CtT(AGU)C SSF1P38789 453 aaPredicted RBP0.88□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C ILV3P39522 585 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C EPS1P40557 701 aa0.88□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C AIM21P40563 679 aa0.88□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C FET4P40988 552 aa0.88□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C NOP2P40991 618 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C EMP47P43555 445 aa0.88□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C BBC1P47068 1157 aa0.88□□□□□ -2.27
tT(AGU)CtT(AGU)C YGL242CP53066 181 aa0.88□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 7.5 ms