RNA–Protein interactions for RNA: YPR083W

MDM36, Transcript of Mitochondrial protein, yeast

Gene MDM36, Length 1,740 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MDM36	YPR083W	YJR115W	P47152	169 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM36	YPR083W	VAN1	P23642	535 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM36	YPR083W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MDM36	YPR083W	YBL086C	P38177	466 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM36	YPR083W	MDJ2	P42834	146 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM36	YPR083W	SRS2	P12954	1174 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM36	YPR083W	RRN6	P32786	894 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM36	YPR083W	NTH2	P35172	780 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM36	YPR083W	YFL034W	P43564	1073 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM36	YPR083W	YHL050C	P38721	697 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM36	YPR083W	YHR219W	P38900	624 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM36	YPR083W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MDM36	YPR083W	SUV3	P32580	737 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM36	YPR083W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MDM36	YPR083W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MDM36	YPR083W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MDM36	YPR083W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MDM36	YPR083W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MDM36	YPR083W	MKS1	P34072	584 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM36	YPR083W	TRS33	Q99394	268 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM36	YPR083W	SEC20	P28791	383 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM36	YPR083W	ATG1	P53104	897 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM36	YPR083W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MDM36	YPR083W	YDR444W	Q04093	687 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM36	YPR083W	SRF1	Q12516	437 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM36	YPR083W	CYT1	P07143	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM36	YPR083W	SWI5	P08153	709 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM36	YPR083W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MDM36	YPR083W	QDR1	P40475	563 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM36	YPR083W	ISU1	Q03020	165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM36	YPR083W	FBP26	P32604	452 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM36	YPR083W	UTR2	P32623	467 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM36	YPR083W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MDM36	YPR083W	WHI5	Q12416	295 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM36	YPR083W	UBP1	P25037	809 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MDM36	YPR083W	DFG5	Q05031	458 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MDM36	YPR083W	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	ARG82	P07250	355 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	THI12	P42883	340 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	AAD14	P42884	376 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	THI5	P43534	340 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	THI11	P47183	340 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	ALD2	P47771	506 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	THI13	Q07748	340 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	FRT1	Q99332	602 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	ATE1	P16639	503 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	NUP85	P46673	744 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	CWH41	P53008	833 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	NUT2	Q06213	157 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	PPX1	P38698	397 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	POL32	P47110	350 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	ACF4	P47129	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	YDL176W	Q12027	708 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	STE6	P12866	1290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	TBS1	P38114	1094 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	YBR197C	P38306	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	BDS1	Q08347	646 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	LSO1	Q3E827	93 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	ASF1	P32447	279 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	ISC10	P32645	267 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	CAB1	Q04430	367 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	WTM2	Q12206	467 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	MET10	P39692	1035 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	YLR346C	Q06139	101 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	OPT2	Q06593	877 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	LSC2	P53312	427 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	DLD1	P32891	587 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM36	YPR083W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MDM36	YPR083W	RPB10	P22139	70 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM36	YPR083W	MET4	P32389	672 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM36	YPR083W	YJR098C	P47139	656 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM36	YPR083W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MDM36	YPR083W	YPQ2	Q06328	317 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM36	YPR083W	SEC8	P32855	1065 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM36	YPR083W	HXT5	P38695	592 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM36	YPR083W	TRS120	Q04183	1289 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM36	YPR083W	GPI13	Q07830	1017 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM36	YPR083W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MDM36	YPR083W	SPR3	P41901	512 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM36	YPR083W	SUM1	P46676	1062 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM36	YPR083W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MDM36	YPR083W	APC11	Q12157	165 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM36	YPR083W	KTR2	P33550	425 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM36	YPR083W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MDM36	YPR083W	SCW11	P53189	542 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM36	YPR083W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MDM36	YPR083W	UBP2	Q01476	1272 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM36	YPR083W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM36	YPR083W	STB3	Q12427	513 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM36	YPR083W	TCB1	Q12466	1186 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM36	YPR083W	MRPL33	P20084	86 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM36	YPR083W	MNL2	Q12205	849 aa		4.8	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25.2 ms