RNA–Protein interactions for RNA: YOL013C

HRD1, Transcript of Ubiquitin-protein ligase, yeast

Gene HRD1, Length 1,656 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HRD1	YOL013C	SUM1	P46676	1062 aa		5.15	□□□□□ -1.59
HRD1	YOL013C	TSC13	Q99190	310 aa		5.15	□□□□□ -1.59
HRD1	YOL013C	SSN3	P39073	555 aa		5.14	□□□□□ -1.59
HRD1	YOL013C	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
HRD1	YOL013C	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
HRD1	YOL013C	SWI5	P08153	709 aa		5.13	□□□□□ -1.59
HRD1	YOL013C	ROG3	P43602	733 aa		5.13	□□□□□ -1.59
HRD1	YOL013C	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		5.13	□□□□□ -1.59
HRD1	YOL013C	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
HRD1	YOL013C	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
HRD1	YOL013C	KTR7	P40504	517 aa		5.12	□□□□□ -1.59
HRD1	YOL013C	NTH2	P35172	780 aa		5.12	□□□□□ -1.59
HRD1	YOL013C	TTI1	P36097	1038 aa		5.12	□□□□□ -1.59
HRD1	YOL013C	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
HRD1	YOL013C	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
HRD1	YOL013C	PHO87	P25360	923 aa		5.11	□□□□□ -1.59
HRD1	YOL013C	HAP4	P14064	554 aa		5.1	□□□□□ -1.59
HRD1	YOL013C	SLA1	P32790	1244 aa		5.1	□□□□□ -1.59
HRD1	YOL013C	UBP15	P50101	1230 aa		5.1	□□□□□ -1.59
HRD1	YOL013C	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
HRD1	YOL013C	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
HRD1	YOL013C	GAL2	P13181	574 aa		5.08	□□□□□ -1.6
HRD1	YOL013C	JJJ2	P46997	583 aa		5.08	□□□□□ -1.6
HRD1	YOL013C	YGR035C	P53222	116 aa		5.08	□□□□□ -1.6
HRD1	YOL013C	YPQ2	Q06328	317 aa		5.08	□□□□□ -1.6
HRD1	YOL013C	IRE1	P32361	1115 aa		5.08	□□□□□ -1.6
HRD1	YOL013C	TGL4	P36165	910 aa		5.08	□□□□□ -1.6
HRD1	YOL013C	HPF1	Q05164	967 aa		5.08	□□□□□ -1.6
HRD1	YOL013C	GAS4	Q08271	471 aa		5.08	□□□□□ -1.6
HRD1	YOL013C	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		5.08	□□□□□ -1.6
HRD1	YOL013C	CCP1	P00431	361 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HRD1	YOL013C	CYT1	P07143	309 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HRD1	YOL013C	MCM1	P11746	286 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HRD1	YOL013C	YML020W	Q03722	664 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HRD1	YOL013C	CPS1	P27614	576 aa		5.06	□□□□□ -1.6
HRD1	YOL013C	LYS5	P50113	272 aa		5.06	□□□□□ -1.6
HRD1	YOL013C	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
HRD1	YOL013C	CUZ1	P53899	274 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HRD1	YOL013C	DPH6	Q12429	685 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HRD1	YOL013C	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
HRD1	YOL013C	TRK2	P28584	889 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HRD1	YOL013C	ECM23	Q02710	187 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HRD1	YOL013C	IOC4	Q04213	475 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HRD1	YOL013C	DIT1	P21623	536 aa		5.04	□□□□□ -1.6
HRD1	YOL013C	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
HRD1	YOL013C	ROM1	P53046	1155 aa		5.04	□□□□□ -1.6
HRD1	YOL013C	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
HRD1	YOL013C	VAN1	P23642	535 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HRD1	YOL013C	UBP1	P25037	809 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HRD1	YOL013C	CEM1	P39525	442 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HRD1	YOL013C	YTA6	P40328	754 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HRD1	YOL013C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
HRD1	YOL013C	PUP1	P25043	261 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HRD1	YOL013C	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
HRD1	YOL013C	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
HRD1	YOL013C	UBX7	P38349	436 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HRD1	YOL013C	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
HRD1	YOL013C	PSH1	Q12161	406 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HRD1	YOL013C	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
HRD1	YOL013C	CWH41	P53008	833 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HRD1	YOL013C	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
HRD1	YOL013C	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HRD1	YOL013C	JJJ3	P47138	172 aa		5	□□□□□ -1.61
HRD1	YOL013C	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		5	□□□□□ -1.61
HRD1	YOL013C	AIM44	Q99299	758 aa		5	□□□□□ -1.61
HRD1	YOL013C	TRS33	Q99394	268 aa		5	□□□□□ -1.61
HRD1	YOL013C	SCD5	P34758	872 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HRD1	YOL013C	MRPL16	P38064	232 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HRD1	YOL013C	YNL165W	P53891	406 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HRD1	YOL013C	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
HRD1	YOL013C	SYT1	Q06836	1226 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HRD1	YOL013C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
HRD1	YOL013C	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
HRD1	YOL013C	MLF3	P32047	452 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HRD1	YOL013C	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
HRD1	YOL013C	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HRD1	YOL013C	STB3	Q12427	513 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HRD1	YOL013C	FPS1	P23900	669 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HRD1	YOL013C	HXT5	P38695	592 aa		4.96	□□□□□ -1.61
HRD1	YOL013C	RGP1	P16664	663 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HRD1	YOL013C	SPR3	P41901	512 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HRD1	YOL013C	ALD2	P47771	506 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HRD1	YOL013C	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HRD1	YOL013C	MTO1	P53070	669 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HRD1	YOL013C	YML083C	Q04526	418 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HRD1	YOL013C	PUN1	Q06991	263 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HRD1	YOL013C	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HRD1	YOL013C	SUV3	P32580	737 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HRD1	YOL013C	KAP122	P32767	1081 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HRD1	YOL013C	AI1	P03875	834 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HRD1	YOL013C	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HRD1	YOL013C	CAB1	Q04430	367 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HRD1	YOL013C	SRS2	P12954	1174 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HRD1	YOL013C	GEF1	P37020	779 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HRD1	YOL013C	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HRD1	YOL013C	YBR197C	P38306	217 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HRD1	YOL013C	ICP55	P40051	511 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HRD1	YOL013C	SKP1	P52286	194 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HRD1	YOL013C	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HRD1	YOL013C	MRPL33	P20084	86 aa		4.9	□□□□□ -1.62

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