RNA–Protein interactions for RNA: YMR143W

RPS16A, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS16A, Length 432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS16A	YMR143W	TBS1	P38114	1094 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS16A	YMR143W	RGA1	P39083	1007 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS16A	YMR143W	YJR115W	P47152	169 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS16A	YMR143W	VAN1	P23642	535 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS16A	YMR143W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPS16A	YMR143W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPS16A	YMR143W	GCR2	Q01722	534 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS16A	YMR143W	ARG82	P07250	355 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS16A	YMR143W	MCM1	P11746	286 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS16A	YMR143W	SUM1	P46676	1062 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS16A	YMR143W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPS16A	YMR143W	TRS33	Q99394	268 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS16A	YMR143W	SRS2	P12954	1174 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS16A	YMR143W	SSN3	P39073	555 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS16A	YMR143W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS16A	YMR143W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS16A	YMR143W	YML020W	Q03722	664 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS16A	YMR143W	PNP1	Q05788	311 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS16A	YMR143W	MET22	P32179	357 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS16A	YMR143W	HXT5	P38695	592 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS16A	YMR143W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS16A	YMR143W	BOL3	P39724	118 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS16A	YMR143W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS16A	YMR143W	NUP85	P46673	744 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS16A	YMR143W	PUN1	Q06991	263 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS16A	YMR143W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPS16A	YMR143W	VTC4	P47075	721 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS16A	YMR143W	YJR098C	P47139	656 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS16A	YMR143W	MSN5	P52918	1224 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS16A	YMR143W	CAB1	Q04430	367 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS16A	YMR143W	SLA1	P32790	1244 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS16A	YMR143W	DLD1	P32891	587 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS16A	YMR143W	YPL062W	Q02781	134 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS16A	YMR143W	HAT1	Q12341	374 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS16A	YMR143W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS16A	YMR143W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS16A	YMR143W	DAL1	P32375	460 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS16A	YMR143W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS16A	YMR143W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS16A	YMR143W	YBR197C	P38306	217 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS16A	YMR143W	CWH41	P53008	833 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS16A	YMR143W	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS16A	YMR143W	SRF1	Q12516	437 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS16A	YMR143W	LSO1	Q3E827	93 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS16A	YMR143W	ERP5	P38819	212 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS16A	YMR143W	JJJ2	P46997	583 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS16A	YMR143W	LSC2	P53312	427 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS16A	YMR143W	YNL165W	P53891	406 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS16A	YMR143W	KAR5	Q04746	504 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS16A	YMR143W	ATG1	P53104	897 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	APC11	Q12157	165 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	ISC10	P32645	267 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	KTR2	P33550	425 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	SCD5	P34758	872 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	MDJ2	P42834	146 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	YDR444W	Q04093	687 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	TCB1	Q12466	1186 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	MRPL33	P20084	86 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	OPT2	Q06593	877 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
RPS16A	YMR143W	MLF3	P32047	452 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	IRE1	P32361	1115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	RRN6	P32786	894 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	PSH1	Q12161	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	ACF4	P47129	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	ALD2	P47771	506 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	RPB10	P22139	70 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	VMA3	P25515	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	QDR1	P40475	563 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	UBP2	Q01476	1272 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	YDL176W	Q12027	708 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	UBP15	P50101	1230 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	YLR346C	Q06139	101 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS16A	YMR143W	RPC31	P17890	251 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS16A	YMR143W	OSH7	P38755	437 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS16A	YMR143W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPS16A	YMR143W	FRT1	Q99332	602 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS16A	YMR143W	KAP122	P32767	1081 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS16A	YMR143W	SLD2	P34252	453 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS16A	YMR143W	YHL050C	P38721	697 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS16A	YMR143W	YHR219W	P38900	624 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS16A	YMR143W	QDR2	P40474	542 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS16A	YMR143W	SPR3	P41901	512 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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