RNA–Protein interactions for RNA: YKR104W

YKR104W, Transcript of Putative transporter of the MRP subfamily, yeastyeast

Gene YKR104W, Length 921 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR104WYKR104W SSN3P39073 555 aa8.49□□□□□ -1.05
YKR104WYKR104W UTP7P40055 554 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
YKR104WYKR104W TY1A-MR1Q04215 440 aa8.49□□□□□ -1.05
YKR104WYKR104W AHP1P38013 176 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
YKR104WYKR104W TSC13Q99190 310 aa8.48□□□□□ -1.05
YKR104WYKR104W ALA1P40825 983 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
YKR104WYKR104W SWI5P08153 709 aa8.46□□□□□ -1.06
YKR104WYKR104W UBP15P50101 1230 aa8.46□□□□□ -1.06
YKR104WYKR104W RPS6AP0CX37 236 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
YKR104WYKR104W RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
YKR104WYKR104W PHO87P25360 923 aa8.44□□□□□ -1.06
YKR104WYKR104W NTH2P35172 780 aa8.44□□□□□ -1.06
YKR104WYKR104W HAP4P14064 554 aa8.43□□□□□ -1.06
YKR104WYKR104W PDI1P17967 522 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
YKR104WYKR104W YGR035CP53222 116 aa8.43□□□□□ -1.06
YKR104WYKR104W SLA1P32790 1244 aa8.42□□□□□ -1.06
YKR104WYKR104W TTI1P36097 1038 aa8.42□□□□□ -1.06
YKR104WYKR104W KTR7P40504 517 aa8.42□□□□□ -1.06
YKR104WYKR104W JJJ2P46997 583 aa8.41□□□□□ -1.06
YKR104WYKR104W MCM1P11746 286 aa8.4□□□□□ -1.06
YKR104WYKR104W NAM8Q00539 523 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
YKR104WYKR104W YPQ2Q06328 317 aa8.4□□□□□ -1.06
YKR104WYKR104W GAS4Q08271 471 aa8.4□□□□□ -1.06
YKR104WYKR104W GAL2P13181 574 aa8.39□□□□□ -1.07
YKR104WYKR104W IRE1P32361 1115 aa8.39□□□□□ -1.07
YKR104WYKR104W LYS5P50113 272 aa8.39□□□□□ -1.07
YKR104WYKR104W HPF1Q05164 967 aa8.39□□□□□ -1.07
YKR104WYKR104W CCP1P00431 361 aa8.38□□□□□ -1.07
YKR104WYKR104W CYT1P07143 309 aa8.38□□□□□ -1.07
YKR104WYKR104W ACS2P52910 683 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
YKR104WYKR104W DPH6Q12429 685 aa8.38□□□□□ -1.07
YKR104WYKR104W TY1A-DR3Q12441 440 aa8.38□□□□□ -1.07
YKR104WYKR104W TGL4P36165 910 aa8.37□□□□□ -1.07
YKR104WYKR104W TRK2P28584 889 aa8.35□□□□□ -1.07
YKR104WYKR104W CUZ1P53899 274 aa8.35□□□□□ -1.07
YKR104WYKR104W UBP1P25037 809 aa8.34□□□□□ -1.07
YKR104WYKR104W DIT1P21623 536 aa8.33□□□□□ -1.08
YKR104WYKR104W CPS1P27614 576 aa8.33□□□□□ -1.08
YKR104WYKR104W SHM1P37292 490 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
YKR104WYKR104W YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
YKR104WYKR104W RLF2Q12495 606 aa8.33□□□□□ -1.08
YKR104WYKR104W SSA4P22202 642 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
YKR104WYKR104W CEM1P39525 442 aa8.32□□□□□ -1.08
YKR104WYKR104W RGA2Q06407 1009 aa8.32□□□□□ -1.08
YKR104WYKR104W YTA6P40328 754 aa8.31□□□□□ -1.08
YKR104WYKR104W ECM23Q02710 187 aa8.31□□□□□ -1.08
YKR104WYKR104W VAN1P23642 535 aa8.3□□□□□ -1.08
YKR104WYKR104W PDC6P26263 563 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
YKR104WYKR104W JJJ3P47138 172 aa8.3□□□□□ -1.08
YKR104WYKR104W ROM1P53046 1155 aa8.3□□□□□ -1.08
YKR104WYKR104W PSH1Q12161 406 aa8.29□□□□□ -1.08
YKR104WYKR104W RPP1AP05318 106 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
YKR104WYKR104W RPS31P05759 152 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
YKR104WYKR104W CWH41P53008 833 aa8.28□□□□□ -1.08
YKR104WYKR104W YDR461C-AQ2V2P7 80 aa8.28□□□□□ -1.08
YKR104WYKR104W TRS33Q99394 268 aa8.28□□□□□ -1.08
YKR104WYKR104W NGR1P32831 672 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
YKR104WYKR104W KRE33P53914 1056 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
YKR104WYKR104W PUP1P25043 261 aa8.26□□□□□ -1.09
YKR104WYKR104W SCD5P34758 872 aa8.26□□□□□ -1.09
YKR104WYKR104W SYT1Q06836 1226 aa8.26□□□□□ -1.09
YKR104WYKR104W LEU1P07264 779 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
YKR104WYKR104W UBX7P38349 436 aa8.25□□□□□ -1.09
YKR104WYKR104W ADE12P80210 433 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
YKR104WYKR104W UTP4Q06679 776 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
YKR104WYKR104W Q0182Q9ZZW1 134 aa8.25□□□□□ -1.09
YKR104WYKR104W MRPL16P38064 232 aa8.24□□□□□ -1.09
YKR104WYKR104W YNL165WP53891 406 aa8.24□□□□□ -1.09
YKR104WYKR104W MLF3P32047 452 aa8.23□□□□□ -1.09
YKR104WYKR104W STB3Q12427 513 aa8.23□□□□□ -1.09
YKR104WYKR104W FPS1P23900 669 aa8.22□□□□□ -1.09
YKR104WYKR104W PUF6Q04373 656 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
YKR104WYKR104W RGP1P16664 663 aa8.19□□□□□ -1.1
YKR104WYKR104W HXT5P38695 592 aa8.19□□□□□ -1.1
YKR104WYKR104W SPR3P41901 512 aa8.19□□□□□ -1.1
YKR104WYKR104W ALD2P47771 506 aa8.19□□□□□ -1.1
YKR104WYKR104W MTO1P53070 669 aa8.16□□□□□ -1.1
YKR104WYKR104W NOB1Q08444 459 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
YKR104WYKR104W AI1P03875 834 aa8.15□□□□□ -1.1
YKR104WYKR104W SUV3P32580 737 aa8.14□□□□□ -1.11
YKR104WYKR104W KAP122P32767 1081 aa8.14□□□□□ -1.11
YKR104WYKR104W YML083CQ04526 418 aa8.13□□□□□ -1.11
YKR104WYKR104W PUN1Q06991 263 aa8.13□□□□□ -1.11
YKR104WYKR104W SUB2Q07478 446 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
YKR104WYKR104W SRS2P12954 1174 aa8.12□□□□□ -1.11
YKR104WYKR104W ALD4P46367 519 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
YKR104WYKR104W SKP1P52286 194 aa8.12□□□□□ -1.11
YKR104WYKR104W HEH2Q03281 663 aa8.12□□□□□ -1.11
YKR104WYKR104W CAB1Q04430 367 aa8.12□□□□□ -1.11
YKR104WYKR104W PHM7Q12252 991 aa8.12□□□□□ -1.11
YKR104WYKR104W ICP55P40051 511 aa8.11□□□□□ -1.11
YKR104WYKR104W GPM1P00950 247 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
YKR104WYKR104W CWC15Q03772 175 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
YKR104WYKR104W MRPL33P20084 86 aa8.09□□□□□ -1.11
YKR104WYKR104W NCL1P38205 684 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
YKR104WYKR104W YBR197CP38306 217 aa8.09□□□□□ -1.11
YKR104WYKR104W FOX2Q02207 900 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
YKR104WYKR104W TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
YKR104WYKR104W DYS1P38791 387 aa8.08□□□□□ -1.12
YKR104WYKR104W QDR2P40474 542 aa8.08□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 32.8 ms