RNA–Protein interactions for RNA: YJR003C

YJR003C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YJR003C, Length 1,560 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJR003C	YJR003C	YPR204W	Q08995	1032 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJR003C	YJR003C	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YJR003C	YJR003C	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YJR003C	YJR003C	UBP15	P50101	1230 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJR003C	YJR003C	SUM1	P46676	1062 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJR003C	YJR003C	JJJ3	P47138	172 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJR003C	YJR003C	CEM1	P39525	442 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJR003C	YJR003C	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
YJR003C	YJR003C	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YJR003C	YJR003C	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YJR003C	YJR003C	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YJR003C	YJR003C	MDJ1	P35191	511 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJR003C	YJR003C	JJJ2	P46997	583 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJR003C	YJR003C	MRX10	Q05648	414 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJR003C	YJR003C	DIT1	P21623	536 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJR003C	YJR003C	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YJR003C	YJR003C	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YJR003C	YJR003C	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YJR003C	YJR003C	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YJR003C	YJR003C	SWI5	P08153	709 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJR003C	YJR003C	IRE1	P32361	1115 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJR003C	YJR003C	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YJR003C	YJR003C	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YJR003C	YJR003C	SYT1	Q06836	1226 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJR003C	YJR003C	ICP55	P40051	511 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJR003C	YJR003C	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YJR003C	YJR003C	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YJR003C	YJR003C	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YJR003C	YJR003C	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YJR003C	YJR003C	THI72	Q08579	599 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJR003C	YJR003C	NTH2	P35172	780 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJR003C	YJR003C	NSG2	P53898	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJR003C	YJR003C	YPQ2	Q06328	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJR003C	YJR003C	PSH1	Q12161	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJR003C	YJR003C	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YJR003C	YJR003C	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YJR003C	YJR003C	KTR7	P40504	517 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJR003C	YJR003C	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YJR003C	YJR003C	AI1	P03875	834 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YJR003C	YJR003C	MRPL16	P38064	232 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YJR003C	YJR003C	YFL034W	P43564	1073 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YJR003C	YJR003C	PHM7	Q12252	991 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YJR003C	YJR003C	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YJR003C	YJR003C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YJR003C	YJR003C	PEP12	P32854	288 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YJR003C	YJR003C	YFL066C	P43538	392 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YJR003C	YJR003C	YNL165W	P53891	406 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YJR003C	YJR003C	LEO1	P38439	464 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YJR003C	YJR003C	STB3	Q12427	513 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YJR003C	YJR003C	TSC13	Q99190	310 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YJR003C	YJR003C	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YJR003C	YJR003C	FPS1	P23900	669 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YJR003C	YJR003C	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YJR003C	YJR003C	CYT1	P07143	309 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YJR003C	YJR003C	MLF3	P32047	452 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YJR003C	YJR003C	MCM1	P11746	286 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YJR003C	YJR003C	SPR3	P41901	512 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YJR003C	YJR003C	DMA2	P53924	522 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YJR003C	YJR003C	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YJR003C	YJR003C	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YJR003C	YJR003C	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YJR003C	YJR003C	ALD2	P47771	506 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YJR003C	YJR003C	TDA6	Q06466	467 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YJR003C	YJR003C	PHO87	P25360	923 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YJR003C	YJR003C	YTA6	P40328	754 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YJR003C	YJR003C	YNR014W	P53719	212 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YJR003C	YJR003C	RGP1	P16664	663 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YJR003C	YJR003C	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YJR003C	YJR003C	HAP4	P14064	554 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YJR003C	YJR003C	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YJR003C	YJR003C	MSC7	P38694	644 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YJR003C	YJR003C	ROM1	P53046	1155 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YJR003C	YJR003C	MTO1	P53070	669 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YJR003C	YJR003C	YMR187C	Q03236	431 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YJR003C	YJR003C	GAS4	Q08271	471 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YJR003C	YJR003C	GAL2	P13181	574 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YJR003C	YJR003C	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YJR003C	YJR003C	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YJR003C	YJR003C	SIS2	P36024	562 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YJR003C	YJR003C	TTI1	P36097	1038 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YJR003C	YJR003C	BOI2	P39969	1040 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YJR003C	YJR003C	UBP1	P25037	809 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YJR003C	YJR003C	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YJR003C	YJR003C	TGL4	P36165	910 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YJR003C	YJR003C	ECM23	Q02710	187 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YJR003C	YJR003C	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YJR003C	YJR003C	HXT5	P38695	592 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YJR003C	YJR003C	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YJR003C	YJR003C	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YJR003C	YJR003C	CPS1	P27614	576 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YJR003C	YJR003C	SCD5	P34758	872 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YJR003C	YJR003C	SKN7	P38889	622 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YJR003C	YJR003C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YJR003C	YJR003C	VAN1	P23642	535 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YJR003C	YJR003C	KAP122	P32767	1081 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YJR003C	YJR003C	MET1	P36150	593 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YJR003C	YJR003C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YJR003C	YJR003C	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YJR003C	YJR003C	YDR215C	Q12240	137 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YJR003C	YJR003C	UBX7	P38349	436 aa		4.69	□□□□□ -1.66

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