RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W KIP2P28743 706 aa7.61□□□□□ -1.19
VHS1YDR247W BOL3P39724 118 aa7.61□□□□□ -1.19
VHS1YDR247W ITT1Q04638 464 aa7.61□□□□□ -1.19
VHS1YDR247W ESP1Q03018 1630 aa7.61□□□□□ -1.19
VHS1YDR247W MYO2P19524 1574 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
VHS1YDR247W PAM1P37304 830 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
VHS1YDR247W MET10P39692 1035 aa7.59□□□□□ -1.19
VHS1YDR247W MRF1P30775 413 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.2
VHS1YDR247W NTH2P35172 780 aa7.59□□□□□ -1.2
VHS1YDR247W GLO3P38682 493 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.2
VHS1YDR247W PPX1P38698 397 aa7.59□□□□□ -1.2
VHS1YDR247W ALD4P46367 519 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.2
VHS1YDR247W UBP1P25037 809 aa7.58□□□□□ -1.2
VHS1YDR247W CWH41P53008 833 aa7.58□□□□□ -1.2
VHS1YDR247W QDR1P40475 563 aa7.57□□□□□ -1.2
VHS1YDR247W EMW1P42842 904 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
VHS1YDR247W THI12P42883 340 aa7.57□□□□□ -1.2
VHS1YDR247W THI5P43534 340 aa7.57□□□□□ -1.2
VHS1YDR247W ACF4P47129 309 aa7.57□□□□□ -1.2
VHS1YDR247W THI11P47183 340 aa7.57□□□□□ -1.2
VHS1YDR247W THI13Q07748 340 aa7.57□□□□□ -1.2
VHS1YDR247W STU1P38198 1513 aa7.57□□□□□ -1.2
VHS1YDR247W CYT1P07143 309 aa7.56□□□□□ -1.2
VHS1YDR247W RPS6AP0CX37 236 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
VHS1YDR247W RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
VHS1YDR247W POL32P47110 350 aa7.56□□□□□ -1.2
VHS1YDR247W SYH1Q02875 849 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
VHS1YDR247W APP1P53933 587 aa7.55□□□□□ -1.2
VHS1YDR247W POL1P13382 1468 aa7.54□□□□□ -1.2
VHS1YDR247W SUV3P32580 737 aa7.54□□□□□ -1.2
VHS1YDR247W UTR2P32623 467 aa7.54□□□□□ -1.2
VHS1YDR247W PUS5Q06244 254 aa7.54□□□□□ -1.2
VHS1YDR247W SPT2P06843 333 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
VHS1YDR247W SWI5P08153 709 aa7.53□□□□□ -1.2
VHS1YDR247W BDP1P46678 594 aa7.53□□□□□ -1.2
VHS1YDR247W ALD2P47771 506 aa7.53□□□□□ -1.2
VHS1YDR247W ORC1P54784 914 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
VHS1YDR247W ISU1Q03020 165 aa7.53□□□□□ -1.2
VHS1YDR247W NUT2Q06213 157 aa7.53□□□□□ -1.2
VHS1YDR247W RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
VHS1YDR247W WHI5Q12416 295 aa7.53□□□□□ -1.2
VHS1YDR247W LSO1Q3E827 93 aa7.53□□□□□ -1.2
VHS1YDR247W NGR1P32831 672 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
VHS1YDR247W MKS1P34072 584 aa7.52□□□□□ -1.21
VHS1YDR247W TBS1P38114 1094 aa7.52□□□□□ -1.21
VHS1YDR247W UFD4P33202 1483 aa7.52□□□□□ -1.21
VHS1YDR247W YTA7P40340 1379 aa7.51□□□□□ -1.21
VHS1YDR247W FBP26P32604 452 aa7.51□□□□□ -1.21
VHS1YDR247W DAT1P13483 248 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
VHS1YDR247W ATE1P16639 503 aa7.5□□□□□ -1.21
VHS1YDR247W FRT1Q99332 602 aa7.5□□□□□ -1.21
VHS1YDR247W RPP2BP02400 110 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
VHS1YDR247W SPR3P41901 512 aa7.49□□□□□ -1.21
VHS1YDR247W BPT1P14772 1559 aa7.49□□□□□ -1.21
VHS1YDR247W FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
VHS1YDR247W TRM732Q03496 1420 aa7.48□□□□□ -1.21
VHS1YDR247W MGE1P38523 228 aa7.47□□□□□ -1.21
VHS1YDR247W ISC10P32645 267 aa7.46□□□□□ -1.21
VHS1YDR247W BOI1P38041 980 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
VHS1YDR247W YBR197CP38306 217 aa7.46□□□□□ -1.21
VHS1YDR247W FOX2Q02207 900 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
VHS1YDR247W SDH2P21801 266 aa7.46□□□□□ -1.22
VHS1YDR247W MRT4P33201 236 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
VHS1YDR247W CST6P40535 587 aa7.46□□□□□ -1.22
VHS1YDR247W TRS120Q04183 1289 aa7.46□□□□□ -1.22
VHS1YDR247W WTM2Q12206 467 aa7.46□□□□□ -1.22
VHS1YDR247W BUD4P47136 1447 aa7.45□□□□□ -1.22
VHS1YDR247W ATG2P53855 1592 aa7.45□□□□□ -1.22
VHS1YDR247W YPK9Q12697 1472 aa7.45□□□□□ -1.22
VHS1YDR247W DPS1P04802 557 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
VHS1YDR247W STE6P12866 1290 aa7.45□□□□□ -1.22
VHS1YDR247W OYE2Q03558 400 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
VHS1YDR247W CAB1Q04430 367 aa7.45□□□□□ -1.22
VHS1YDR247W DFG5Q05031 458 aa7.45□□□□□ -1.22
VHS1YDR247W SVF1Q05515 481 aa7.45□□□□□ -1.22
VHS1YDR247W MET4P32389 672 aa7.44□□□□□ -1.22
VHS1YDR247W SEC8P32855 1065 aa7.44□□□□□ -1.22
VHS1YDR247W BDS1Q08347 646 aa7.44□□□□□ -1.22
VHS1YDR247W SCC2Q04002 1493 aa7.43□□□□□ -1.22
VHS1YDR247W YBL086CP38177 466 aa7.43□□□□□ -1.22
VHS1YDR247W APC11Q12157 165 aa7.43□□□□□ -1.22
VHS1YDR247W ECM5Q03214 1411 aa7.43□□□□□ -1.22
VHS1YDR247W RKR1Q04781 1562 aa7.42□□□□□ -1.22
VHS1YDR247W IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
VHS1YDR247W NOP2P40991 618 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
VHS1YDR247W YJR107WP47145 328 aa7.42□□□□□ -1.22
VHS1YDR247W UFD2P54860 961 aa7.42□□□□□ -1.22
VHS1YDR247W STB3Q12427 513 aa7.42□□□□□ -1.22
VHS1YDR247W DNA2P38859 1522 aa7.41□□□□□ -1.22
VHS1YDR247W MCM1P11746 286 aa7.41□□□□□ -1.22
VHS1YDR247W MYO4P32492 1471 aa7.41□□□□□ -1.22
VHS1YDR247W YOR1P53049 1477 aa7.41□□□□□ -1.22
VHS1YDR247W RPB10P22139 70 aa7.4□□□□□ -1.22
VHS1YDR247W DLD3P39976 496 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
VHS1YDR247W HXT5P38695 592 aa7.39□□□□□ -1.23
VHS1YDR247W UTP7P40055 554 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
VHS1YDR247W YPQ2Q06328 317 aa7.39□□□□□ -1.23
VHS1YDR247W SCD5P34758 872 aa7.38□□□□□ -1.23
VHS1YDR247W SUM1P46676 1062 aa7.38□□□□□ -1.23
VHS1YDR247W GPI13Q07830 1017 aa7.38□□□□□ -1.23
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