RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W ARC19P33204 171 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W HXT5P38695 592 aa5.81□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W FAF1P40546 346 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W SUM1P46676 1062 aa5.81□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W KEL2P50090 882 aa5.81□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W YGL140CP53120 1219 aa5.81□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W YAF9P53930 226 aa5.81□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W REX2P54964 269 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W ADE12P80210 433 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W TIM11P81449 96 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W CTF4Q01454 927 aa5.81□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W YMR102CQ03177 834 aa5.81□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W PCL8Q08966 492 aa5.81□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W CDC3P32457 520 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W BLI1P35727 113 aa5.8□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W VPS24P36095 224 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W PMC1P38929 1173 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W BUD14P27637 709 aa5.8□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W PET100P38958 111 aa5.8□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W VPS27P40343 622 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W YRB1P41920 201 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W INP52P50942 1183 aa5.8□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W IST1P53843 298 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W ELA1P53861 379 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W YNL058CP53947 316 aa5.8□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W HOS3Q02959 697 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W ESC2Q06340 456 aa5.8□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W CDC45Q08032 650 aa5.8□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W WHI5Q12416 295 aa5.8□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W KIN1P13185 1064 aa5.79□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W YEL1P34225 687 aa5.79□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W ERC1P38767 581 aa5.79□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W RIO2P40160 425 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W TFB4Q12004 338 aa5.79□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W OCA1P50946 238 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W DSL1P53847 754 aa5.79□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W MSH6Q03834 1242 aa5.79□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W SIN3P22579 1536 aa5.79□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W UGA3P26370 528 aa5.78□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W COY1P34237 679 aa5.78□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W TOM20P35180 183 aa5.78□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W UBP13P38187 747 aa5.78□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W SHC1P39000 512 aa5.78□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W YIR042CP40586 236 aa5.78□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W ALD4P46367 519 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W MRS2Q01926 470 aa5.78□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W ARO80Q04052 950 aa5.78□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W TY4A-HQ6Q5P6 413 aa5.78□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W TRS33Q99394 268 aa5.78□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W RTC1Q08281 1341 aa5.78□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W HMG1P12683 1054 aa5.78□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W HIR2P32480 875 aa5.78□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W MUM2P38236 366 aa5.78□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W ATG14P38270 344 aa5.78□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W SDS3P40505 327 aa5.78□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W RKM4Q12504 494 aa5.78□□□□□ -1.48
CYK3YDL117W MFT1P33441 392 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W UBP12P39538 1254 aa5.77□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W PES4P39684 611 aa5.77□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W UBX2Q04228 584 aa5.77□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W VMS1Q04311 632 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W HMI1Q12039 706 aa5.77□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W RTT107P38850 1070 aa5.77□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W SML1Q04964 104 aa5.77□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W CLP1Q08685 445 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W MAK11P20484 414 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W SEC14P24280 304 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W ERP2P39704 215 aa5.76□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W SAP1P39955 897 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W PWP2P25635 923 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W NOC2P39744 710 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W MAM1P40065 302 aa5.76□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W SPR3P41901 512 aa5.76□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W ERB1Q04660 807 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W BPT1P14772 1559 aa5.76□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W RSM28Q03430 361 aa5.75□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W YHR218WP38899 603 aa5.75□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W VHR2P40041 505 aa5.75□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W VPS20Q04272 221 aa5.75□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W YMR111CQ04461 462 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W NUP145P49687 1317 aa5.75□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W TRM3Q07527 1436 aa5.74□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W MAK16P10962 306 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W RME1P32338 300 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W PPH3P32345 308 aa5.74□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W RRP1P35178 278 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W SSZ1P38788 538 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W BOI2P39969 1040 aa5.74□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W MEP1P40260 492 aa5.74□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W IES1P43579 692 aa5.74□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W MSN5P52918 1224 aa5.74□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W YNL035CP53962 389 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W NOC3Q07896 663 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W SMC4Q12267 1418 aa5.74□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W MPH3P0CE00 602 aa5.74□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W ACP1P32463 125 aa5.74□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W NFU1P32860 256 aa5.74□□□□□ -1.49
CYK3YDL117W SLD2P34252 453 aa5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 78.2 ms