RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639482.1

SPIN3-222, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 3

Gene SPIN3, Length 3,719 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-222	ENST00000639482	RALBP1	Q15311	655 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-222	ENST00000639482		E9PCH4	1651 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-222	ENST00000639482	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPIN3-222	ENST00000639482	KANK1	Q14678	1352 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPIN3-222	ENST00000639482	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPIN3-222	ENST00000639482	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
SPIN3-222	ENST00000639482	TESK2	Q96S53	571 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPIN3-222	ENST00000639482	MLEC	Q14165	292 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SPIN3-222	ENST00000639482	PANK3	Q9H999	370 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SPIN3-222	ENST00000639482	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SPIN3-222	ENST00000639482	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
SPIN3-222	ENST00000639482	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SPIN3-222	ENST00000639482	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SPIN3-222	ENST00000639482	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SPIN3-222	ENST00000639482	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
SPIN3-222	ENST00000639482	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SPIN3-222	ENST00000639482	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SPIN3-222	ENST00000639482	NFKBIB	Q15653	356 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SPIN3-222	ENST00000639482	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-222	ENST00000639482	CLTCL1	P53675	1640 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-222	ENST00000639482	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-222	ENST00000639482	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-222	ENST00000639482	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-222	ENST00000639482	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	13.13	□□□□□ -0.31
SPIN3-222	ENST00000639482	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SPIN3-222	ENST00000639482	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SPIN3-222	ENST00000639482	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SPIN3-222	ENST00000639482	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SPIN3-222	ENST00000639482	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-222	ENST00000639482	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-222	ENST00000639482	TMF1	P82094	1093 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-222	ENST00000639482	GSE1	Q14687	1217 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-222	ENST00000639482	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SPIN3-222	ENST00000639482	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-222	ENST00000639482	MS4A1	P11836	297 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-222	ENST00000639482	TSPOAP1	O95153	1857 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-222	ENST00000639482	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-222	ENST00000639482	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-222	ENST00000639482	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SPIN3-222	ENST00000639482	PDE3B	Q13370	1112 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-222	ENST00000639482	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-222	ENST00000639482	NEUROD2	Q15784	382 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SPIN3-222	ENST00000639482	CEP152	O94986	1710 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-222	ENST00000639482	NPAT	Q14207	1427 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-222	ENST00000639482	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-222	ENST00000639482	PTPRT	O14522	1441 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-222	ENST00000639482	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-222	ENST00000639482	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SPIN3-222	ENST00000639482	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPIN3-222	ENST00000639482	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPIN3-222	ENST00000639482	TRPM2	O94759	1503 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPIN3-222	ENST00000639482	USP35	Q9P2H5	1018 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPIN3-222	ENST00000639482	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPIN3-222	ENST00000639482	NOS1	P29475	1434 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPIN3-222	ENST00000639482	STK26	Q9P289	416 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPIN3-222	ENST00000639482	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPIN3-222	ENST00000639482	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
SPIN3-222	ENST00000639482	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
SPIN3-222	ENST00000639482	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPIN3-222	ENST00000639482	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-222	ENST00000639482	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-222	ENST00000639482	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-222	ENST00000639482	ABCA6	Q8N139	1617 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-222	ENST00000639482	IDI1	Q13907	227 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-222	ENST00000639482	TET3	O43151	1660 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-222	ENST00000639482	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
SPIN3-222	ENST00000639482	DEPDC5	O75140	1603 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SPIN3-222	ENST00000639482	BCAR3	O75815	825 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SPIN3-222	ENST00000639482	FAM161A	Q3B820	660 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SPIN3-222	ENST00000639482	MADD	Q8WXG6	1647 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SPIN3-222	ENST00000639482	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
SPIN3-222	ENST00000639482	APAF1	O14727	1248 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SPIN3-222	ENST00000639482	GOLGA2	Q08379	1002 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SPIN3-222	ENST00000639482	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SPIN3-222	ENST00000639482	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SPIN3-222	ENST00000639482	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SPIN3-222	ENST00000639482	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SPIN3-222	ENST00000639482	MROH2A	A6NES4	1674 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SPIN3-222	ENST00000639482	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	13.01	□□□□□ -0.33
SPIN3-222	ENST00000639482	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SPIN3-222	ENST00000639482	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
SPIN3-222	ENST00000639482	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
SPIN3-222	ENST00000639482	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		13	□□□□□ -0.33
SPIN3-222	ENST00000639482	C8orf34	Q49A92	452 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SPIN3-222	ENST00000639482	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
SPIN3-222	ENST00000639482	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SPIN3-222	ENST00000639482	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SPIN3-222	ENST00000639482	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SPIN3-222	ENST00000639482	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
SPIN3-222	ENST00000639482	PPP2R1A	P30153	589 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SPIN3-222	ENST00000639482	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SPIN3-222	ENST00000639482	COG6	Q9Y2V7	657 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SPIN3-222	ENST00000639482	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
SPIN3-222	ENST00000639482	PANK1	Q8TE04	598 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SPIN3-222	ENST00000639482	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SPIN3-222	ENST00000639482	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SPIN3-222	ENST00000639482	ABCC3	O15438	1527 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SPIN3-222	ENST00000639482	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SPIN3-222	ENST00000639482	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33

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