RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		10.12	□□□□□ -0.79
LETMD1-238	ENST00000623495	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		10.12	□□□□□ -0.79
LETMD1-238	ENST00000623495	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		10.12	□□□□□ -0.79
LETMD1-238	ENST00000623495	PZP	P20742	1482 aa		10.12	□□□□□ -0.79
LETMD1-238	ENST00000623495	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
LETMD1-238	ENST00000623495	CEP152	O94986	1710 aa		10.12	□□□□□ -0.79
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		10.11	□□□□□ -0.79
LETMD1-238	ENST00000623495	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
LETMD1-238	ENST00000623495	TONSL	Q96HA7	1378 aa		10.1	□□□□□ -0.79
LETMD1-238	ENST00000623495	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
LETMD1-238	ENST00000623495	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		10.1	□□□□□ -0.79
LETMD1-238	ENST00000623495	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		10.1	□□□□□ -0.79
LETMD1-238	ENST00000623495	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
LETMD1-238	ENST00000623495	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
LETMD1-238	ENST00000623495	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNA6	P17658	529 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LETMD1-238	ENST00000623495	NOS1	P29475	1434 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-238	ENST00000623495	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-238	ENST00000623495	C3	P01024	1663 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-238	ENST00000623495	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-238	ENST00000623495	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-238	ENST00000623495	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-238	ENST00000623495	PLA2R1	Q13018	1463 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-238	ENST00000623495	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-238	ENST00000623495	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-238	ENST00000623495	POGK	Q9P215	609 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-238	ENST00000623495	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-238	ENST00000623495	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-238	ENST00000623495	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-238	ENST00000623495	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LETMD1-238	ENST00000623495	RERE	Q9P2R6	1566 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LETMD1-238	ENST00000623495	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	10.05	□□□□□ -0.8
LETMD1-238	ENST00000623495	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LETMD1-238	ENST00000623495	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-238	ENST00000623495	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-238	ENST00000623495	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-238	ENST00000623495	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
LETMD1-238	ENST00000623495	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		10.02	□□□□□ -0.8
LETMD1-238	ENST00000623495	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-238	ENST00000623495	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LETMD1-238	ENST00000623495	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-238	ENST00000623495	NLRP1	Q9C000	1473 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-238	ENST00000623495	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-238	ENST00000623495	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-238	ENST00000623495	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-238	ENST00000623495	PRAM1	Q96QH2	718 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-238	ENST00000623495		E9PCH4	1651 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LETMD1-238	ENST00000623495	SYNM	O15061	1565 aa		10	□□□□□ -0.81
LETMD1-238	ENST00000623495	MET	P08581	1390 aa		10	□□□□□ -0.81
LETMD1-238	ENST00000623495	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
LETMD1-238	ENST00000623495	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		10	□□□□□ -0.81
LETMD1-238	ENST00000623495	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
LETMD1-238	ENST00000623495	PIK3C2B	O00750	1634 aa		9.99	□□□□□ -0.81
LETMD1-238	ENST00000623495	UNC13B	O14795	1591 aa		9.99	□□□□□ -0.81
LETMD1-238	ENST00000623495	CERK	Q8TCT0	537 aa		9.99	□□□□□ -0.81
LETMD1-238	ENST00000623495	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
LETMD1-238	ENST00000623495	ATF3	P18847	181 aa		9.98	□□□□□ -0.81
LETMD1-238	ENST00000623495	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		9.98	□□□□□ -0.81
LETMD1-238	ENST00000623495	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		9.98	□□□□□ -0.81
LETMD1-238	ENST00000623495	TET3	O43151	1660 aa		9.97	□□□□□ -0.81
LETMD1-238	ENST00000623495	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		9.97	□□□□□ -0.81
LETMD1-238	ENST00000623495	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		9.97	□□□□□ -0.81
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM94	Q12767	1356 aa		9.97	□□□□□ -0.81
LETMD1-238	ENST00000623495	SOX12	O15370	315 aa		9.97	□□□□□ -0.81
LETMD1-238	ENST00000623495	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
LETMD1-238	ENST00000623495	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		9.97	□□□□□ -0.81
LETMD1-238	ENST00000623495	PTPRT	O14522	1441 aa		9.97	□□□□□ -0.81
LETMD1-238	ENST00000623495	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
LETMD1-238	ENST00000623495	TMC1	Q8TDI8	760 aa		9.96	□□□□□ -0.81
LETMD1-238	ENST00000623495	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.81
LETMD1-238	ENST00000623495	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		9.96	□□□□□ -0.81
LETMD1-238	ENST00000623495	DEPDC5	O75140	1603 aa		9.96	□□□□□ -0.81
LETMD1-238	ENST00000623495	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		9.96	□□□□□ -0.81
LETMD1-238	ENST00000623495	CLTCL1	P53675	1640 aa		9.96	□□□□□ -0.82
LETMD1-238	ENST00000623495	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		9.96	□□□□□ -0.82
LETMD1-238	ENST00000623495	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		9.95	□□□□□ -0.82
LETMD1-238	ENST00000623495	TBX22	Q9Y458	520 aa		9.95	□□□□□ -0.82
LETMD1-238	ENST00000623495	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	9.95	□□□□□ -0.82
LETMD1-238	ENST00000623495	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		9.94	□□□□□ -0.82
LETMD1-238	ENST00000623495	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		9.94	□□□□□ -0.82
LETMD1-238	ENST00000623495	FOXO3	O43524	673 aa		9.94	□□□□□ -0.82
LETMD1-238	ENST00000623495	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		9.94	□□□□□ -0.82
LETMD1-238	ENST00000623495	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	9.94	□□□□□ -0.82
LETMD1-238	ENST00000623495	MIER1	Q8N108	512 aa		9.93	□□□□□ -0.82
LETMD1-238	ENST00000623495	CABP2	Q9NPB3	220 aa		9.93	□□□□□ -0.82
LETMD1-238	ENST00000623495	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	9.93	□□□□□ -0.82
LETMD1-238	ENST00000623495	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	9.93	□□□□□ -0.82
LETMD1-238	ENST00000623495	ORAI2	Q96SN7	254 aa		9.93	□□□□□ -0.82
LETMD1-238	ENST00000623495	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		9.93	□□□□□ -0.82
LETMD1-238	ENST00000623495	TRPM2	O94759	1503 aa		9.93	□□□□□ -0.82
LETMD1-238	ENST00000623495	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		9.93	□□□□□ -0.82
LETMD1-238	ENST00000623495	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	9.93	□□□□□ -0.82
LETMD1-238	ENST00000623495	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	9.93	□□□□□ -0.82
LETMD1-238	ENST00000623495	TOM1	O60784	492 aa		9.93	□□□□□ -0.82
LETMD1-238	ENST00000623495	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	9.93	□□□□□ -0.82
LETMD1-238	ENST00000623495	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	9.93	□□□□□ -0.82
LETMD1-238	ENST00000623495	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		9.92	□□□□□ -0.82
LETMD1-238	ENST00000623495	ADGRB3	O60242	1522 aa		9.92	□□□□□ -0.82

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