RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605847.5

NEDD8-MDP1-204, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD8-MDP1, Length 758 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.25■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ABCC5O15440 1437 aa24.25■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.24■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.22■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.22■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NOS1P29475 1434 aa24.21■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LRP6O75581 1613 aa24.2■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DAPK1P53355 1430 aa24.19■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.18■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24.18■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RXRBP28702 533 aa24.18■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.18■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa24.17■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.17■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ATF3P18847 181 aa24.16■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CADPS2Q86UW7 1296 aa24.16■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.13■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TBX22Q9Y458 520 aa24.13■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZFYVE9O95405 1425 aa24.12■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C19orf44Q9H6X5 657 aa24.12■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 APLP2Q06481 763 aa24.1■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.1■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SHPRHQ149N8 1683 aa24.1■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.05■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 AFF2P51816 1311 aa24.04■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 BRINP3Q76B58 766 aa24.03■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PIK3R4Q99570 1358 aa24.03■■□□□ 1.44
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.01■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DIP2AQ14689 1571 aa24.01■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.01■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.98■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.98■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.98■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ADGRL2O95490 1459 aa23.96■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C8orf37Q96NL8 207 aa23.96■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TRPM2O94759 1503 aa23.95■■□□□ 1.43
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DCCP43146 1447 aa23.94■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.94■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.93■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RGS12O14924 1447 aa23.93■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FOXD1Q16676 465 aa23.9■■□□□ 1.42
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NGLY1Q96IV0 654 aa23.89■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PTPRUQ92729 1446 aa23.89■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MST1RQ04912 1400 aa23.87■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NHSL1Q5SYE7 1610 aa23.85■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.84■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PNPLA6Q8IY17 1366 aa23.84■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 UNC13BO14795 1591 aa23.83■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ADAMTS2O95450 1211 aa23.83■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZRANB1Q9UGI0 708 aa23.82■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 E9PCH4 1651 aa23.82■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa23.78■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 USP21Q9UK80 565 aa23.78■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.76■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.75■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 METP08581 1390 aa23.74■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.73■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NUP155O75694 1391 aa23.73■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.73■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.69■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CCDC125Q86Z20 511 aa23.68■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PTCH1Q13635 1447 aa23.67■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NALCNQ8IZF0 1738 aa23.67■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ROCK1Q13464 1354 aa23.65■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ORAI2Q96SN7 254 aa23.65■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ATRNO75882 1429 aa23.63■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LAMC1P11047 1609 aa23.61■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.59■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ITGAEP38570 1179 aa23.56■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.55■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.55■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ROBO2Q9HCK4 1378 aa23.53■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ESCO1Q5FWF5 840 aa23.53■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 BCL9LQ86UU0 1499 aa23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 362.6 ms