RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598125.5

TIMM50-211, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 3

Gene TIMM50, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-211ENST00000598125 HRCP23327 699 aa28.2■■■□□ 2.1
TIMM50-211ENST00000598125 FOXD1Q16676 465 aa28.19■■■□□ 2.1
TIMM50-211ENST00000598125 CERKQ8TCT0 537 aa28.19■■■□□ 2.1
TIMM50-211ENST00000598125 CPS1P31327 1500 aa28.18■■■□□ 2.1
TIMM50-211ENST00000598125 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
TIMM50-211ENST00000598125 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.17■■■□□ 2.1
TIMM50-211ENST00000598125 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.16■■■□□ 2.1
TIMM50-211ENST00000598125 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.16■■■□□ 2.1
TIMM50-211ENST00000598125 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.15■■■□□ 2.1
TIMM50-211ENST00000598125 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.15■■■□□ 2.1
TIMM50-211ENST00000598125 PPLO60437 1756 aa28.14■■■□□ 2.1
TIMM50-211ENST00000598125 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
TIMM50-211ENST00000598125 DIP2AQ14689 1571 aa28.12■■■□□ 2.09
TIMM50-211ENST00000598125 IFT172Q9UG01 1749 aa28.1■■■□□ 2.09
TIMM50-211ENST00000598125 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
TIMM50-211ENST00000598125 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.1■■■□□ 2.09
TIMM50-211ENST00000598125 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
TIMM50-211ENST00000598125 NWD1Q149M9 1564 aa28.08■■■□□ 2.09
TIMM50-211ENST00000598125 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.07■■■□□ 2.08
TIMM50-211ENST00000598125 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
TIMM50-211ENST00000598125 BCANQ96GW7 911 aa28.05■■■□□ 2.08
TIMM50-211ENST00000598125 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
TIMM50-211ENST00000598125 FBXO41Q8TF61 875 aa28.04■■■□□ 2.08
TIMM50-211ENST00000598125 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.04■■■□□ 2.08
TIMM50-211ENST00000598125 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.03■■■□□ 2.08
TIMM50-211ENST00000598125 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.02■■■□□ 2.08
TIMM50-211ENST00000598125 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
TIMM50-211ENST00000598125 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
TIMM50-211ENST00000598125 LRRC7Q96NW7 1537 aa28■■■□□ 2.07
TIMM50-211ENST00000598125 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.99■■■□□ 2.07
TIMM50-211ENST00000598125 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.99■■■□□ 2.07
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TIMM50-211ENST00000598125 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
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TIMM50-211ENST00000598125 TBX22Q9Y458 520 aa27.96■■■□□ 2.07
TIMM50-211ENST00000598125 KCNA6P17658 529 aa27.94■■■□□ 2.06
TIMM50-211ENST00000598125 PIK3R4Q99570 1358 aa27.93■■■□□ 2.06
TIMM50-211ENST00000598125 VGFO15240 615 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
TIMM50-211ENST00000598125 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
TIMM50-211ENST00000598125 RGL3Q3MIN7 710 aa27.9■■■□□ 2.06
TIMM50-211ENST00000598125 ALKQ9UM73 1620 aa27.89■■■□□ 2.05
TIMM50-211ENST00000598125 MYOM2P54296 1465 aa27.85■■■□□ 2.05
TIMM50-211ENST00000598125 PTPRUQ92729 1446 aa27.84■■■□□ 2.05
TIMM50-211ENST00000598125 LAMC1P11047 1609 aa27.82■■■□□ 2.04
TIMM50-211ENST00000598125 TMEM94Q12767 1356 aa27.82■■■□□ 2.04
TIMM50-211ENST00000598125 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.81■■■□□ 2.04
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TIMM50-211ENST00000598125 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
TIMM50-211ENST00000598125 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.8■■■□□ 2.04
TIMM50-211ENST00000598125 PIK3C2GO75747 1445 aa27.8■■■□□ 2.04
TIMM50-211ENST00000598125 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.79■■■□□ 2.04
TIMM50-211ENST00000598125 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa27.76■■■□□ 2.03
TIMM50-211ENST00000598125 TOM1O60784 492 aa27.75■■■□□ 2.03
TIMM50-211ENST00000598125 KNDC1Q76NI1 1749 aa27.75■■■□□ 2.03
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TIMM50-211ENST00000598125 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
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TIMM50-211ENST00000598125 PTCH1Q13635 1447 aa27.7■■■□□ 2.03
TIMM50-211ENST00000598125 MSH6P52701 1360 aa27.7■■■□□ 2.02
TIMM50-211ENST00000598125 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.65■■■□□ 2.02
TIMM50-211ENST00000598125 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
TIMM50-211ENST00000598125 PIP4K2BP78356 416 aa27.64■■■□□ 2.02
TIMM50-211ENST00000598125 STAC3Q96MF2 364 aa27.64■■■□□ 2.02
TIMM50-211ENST00000598125 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa27.62■■■□□ 2.01
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TIMM50-211ENST00000598125 C14orf37Q86TY3 774 aa27.61■■■□□ 2.01
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TIMM50-211ENST00000598125 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.6■■■□□ 2.01
TIMM50-211ENST00000598125 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
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TIMM50-211ENST00000598125 ADGRB1O14514 1584 aa27.58■■■□□ 2.01
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TIMM50-211ENST00000598125 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.56■■■□□ 2
TIMM50-211ENST00000598125 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.56■■■□□ 2
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TIMM50-211ENST00000598125 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.54■■■□□ 2
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TIMM50-211ENST00000598125 CADPS2Q86UW7 1296 aa27.52■■■□□ 2
TIMM50-211ENST00000598125 DLC1Q96QB1 1528 aa27.51■■■□□ 2
TIMM50-211ENST00000598125 ATF3P18847 181 aa27.51■■□□□ 1.99
TIMM50-211ENST00000598125 STK26Q9P289 416 aa27.51■■□□□ 1.99
TIMM50-211ENST00000598125 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa27.5■■□□□ 1.99
TIMM50-211ENST00000598125 NEUROD1Q13562 356 aa27.49■■□□□ 1.99
TIMM50-211ENST00000598125 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
TIMM50-211ENST00000598125 SLAIN2Q9P270 581 aa27.48■■□□□ 1.99
TIMM50-211ENST00000598125 MST1RQ04912 1400 aa27.47■■□□□ 1.99
TIMM50-211ENST00000598125 PHLPP1O60346 1717 aa27.47■■□□□ 1.99
TIMM50-211ENST00000598125 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.46■■□□□ 1.99
TIMM50-211ENST00000598125 HSPA1LP34931 641 aa27.46■■□□□ 1.99
TIMM50-211ENST00000598125 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.46■■□□□ 1.99
TIMM50-211ENST00000598125 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.44■■□□□ 1.98
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