RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594664.1

AC006486.1-201, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene AC006486.1, Length 634 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC006486.1-201ENST00000594664 ZFYVE9O95405 1425 aa41.1■■■■■ 4.17
AC006486.1-201ENST00000594664 LRRC7Q96NW7 1537 aa41.09■■■■■ 4.17
AC006486.1-201ENST00000594664 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP41.09■■■■■ 4.17
AC006486.1-201ENST00000594664 SLC26A8Q96RN1 970 aa41.08■■■■■ 4.17
AC006486.1-201ENST00000594664 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa41.07■■■■■ 4.17
AC006486.1-201ENST00000594664 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.17
AC006486.1-201ENST00000594664 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa41.04■■■■■ 4.16
AC006486.1-201ENST00000594664 PIP4K2BP78356 416 aa41.01■■■■■ 4.16
AC006486.1-201ENST00000594664 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP41■■■■■ 4.15
AC006486.1-201ENST00000594664 KCNA6P17658 529 aa40.99■■■■■ 4.15
AC006486.1-201ENST00000594664 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
AC006486.1-201ENST00000594664 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP40.94■■■■■ 4.14
AC006486.1-201ENST00000594664 TRPM2O94759 1503 aa40.93■■■■■ 4.14
AC006486.1-201ENST00000594664 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
AC006486.1-201ENST00000594664 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
AC006486.1-201ENST00000594664 TBX22Q9Y458 520 aa40.87■■■■■ 4.13
AC006486.1-201ENST00000594664 CLTCL1P53675 1640 aa40.86■■■■■ 4.13
AC006486.1-201ENST00000594664 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
AC006486.1-201ENST00000594664 NWD1Q149M9 1564 aa40.86■■■■■ 4.13
AC006486.1-201ENST00000594664 TMEM94Q12767 1356 aa40.85■■■■■ 4.13
AC006486.1-201ENST00000594664 DIP2AQ14689 1571 aa40.82■■■■■ 4.13
AC006486.1-201ENST00000594664 ALKQ9UM73 1620 aa40.82■■■■■ 4.12
AC006486.1-201ENST00000594664 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
AC006486.1-201ENST00000594664 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa40.79■■■■■ 4.12
AC006486.1-201ENST00000594664 HSPA1LP34931 641 aa40.78■■■■■ 4.12
AC006486.1-201ENST00000594664 KIF1BO60333 1816 aa40.78■■■■■ 4.12
AC006486.1-201ENST00000594664 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.77■■■■■ 4.12
AC006486.1-201ENST00000594664 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
AC006486.1-201ENST00000594664 PIK3R4Q99570 1358 aa40.74■■■■■ 4.11
AC006486.1-201ENST00000594664 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
AC006486.1-201ENST00000594664 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.72■■■■■ 4.11
AC006486.1-201ENST00000594664 DISP3Q9P2K9 1392 aa40.71■■■■■ 4.11
AC006486.1-201ENST00000594664 MPHOSPH9Q99550 1183 aa40.68■■■■■ 4.1
AC006486.1-201ENST00000594664 MSH6P52701 1360 aa40.68■■■■■ 4.1
AC006486.1-201ENST00000594664 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa40.67■■■■■ 4.1
AC006486.1-201ENST00000594664 FOXD1Q16676 465 aa40.67■■■■■ 4.1
AC006486.1-201ENST00000594664 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa40.66■■■■■ 4.1
AC006486.1-201ENST00000594664 C14orf37Q86TY3 774 aa40.61■■■■■ 4.09
AC006486.1-201ENST00000594664 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa40.6■■■■■ 4.09
AC006486.1-201ENST00000594664 CCDC144AA2RUR9 1427 aa40.6■■■■■ 4.09
AC006486.1-201ENST00000594664 VGFO15240 615 aaPredicted RBP40.59■■■■■ 4.09
AC006486.1-201ENST00000594664 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa40.59■■■■■ 4.09
AC006486.1-201ENST00000594664 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa40.59■■■■■ 4.09
AC006486.1-201ENST00000594664 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa40.59■■■■■ 4.09
AC006486.1-201ENST00000594664 FAM135BQ49AJ0 1406 aa40.54■■■■■ 4.08
AC006486.1-201ENST00000594664 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.54■■■■■ 4.08
AC006486.1-201ENST00000594664 PTPRUQ92729 1446 aa40.53■■■■■ 4.08
AC006486.1-201ENST00000594664 METP08581 1390 aa40.49■■■■■ 4.07
AC006486.1-201ENST00000594664 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
AC006486.1-201ENST00000594664 SLAIN2Q9P270 581 aa40.45■■■■■ 4.07
AC006486.1-201ENST00000594664 C19orf44Q9H6X5 657 aa40.44■■■■■ 4.06
AC006486.1-201ENST00000594664 PPLO60437 1756 aa40.43■■■■■ 4.06
AC006486.1-201ENST00000594664 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa40.43■■■■■ 4.06
AC006486.1-201ENST00000594664 ATF3P18847 181 aa40.42■■■■■ 4.06
AC006486.1-201ENST00000594664 RGL3Q3MIN7 710 aa40.42■■■■■ 4.06
AC006486.1-201ENST00000594664 CADPS2Q86UW7 1296 aa40.42■■■■■ 4.06
AC006486.1-201ENST00000594664 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa40.38■■■■■ 4.05
AC006486.1-201ENST00000594664 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP40.36■■■■■ 4.05
AC006486.1-201ENST00000594664 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP40.36■■■■■ 4.05
AC006486.1-201ENST00000594664 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa40.35■■■■■ 4.05
AC006486.1-201ENST00000594664 HRCP23327 699 aa40.3■■■■■ 4.04
AC006486.1-201ENST00000594664 DCCP43146 1447 aa40.3■■■■■ 4.04
AC006486.1-201ENST00000594664 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
AC006486.1-201ENST00000594664 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa40.28■■■■■ 4.04
AC006486.1-201ENST00000594664 PTCH1Q13635 1447 aa40.25■■■■■ 4.03
AC006486.1-201ENST00000594664 ILDR2Q71H61 639 aa40.25■■■■■ 4.03
AC006486.1-201ENST00000594664 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa40.24■■■■■ 4.03
AC006486.1-201ENST00000594664 IFT172Q9UG01 1749 aa40.23■■■■■ 4.03
AC006486.1-201ENST00000594664 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP40.23■■■■■ 4.03
AC006486.1-201ENST00000594664 PHLPP1O60346 1717 aa40.2■■■■■ 4.03
AC006486.1-201ENST00000594664 PRAG1Q86YV5 1406 aa40.17■■■■■ 4.02
AC006486.1-201ENST00000594664 ROBO2Q9HCK4 1378 aa40.17■■■■■ 4.02
AC006486.1-201ENST00000594664 PIK3C2GO75747 1445 aa40.14■■■■■ 4.02
AC006486.1-201ENST00000594664 NALCNQ8IZF0 1738 aa40.13■■■■■ 4.01
AC006486.1-201ENST00000594664 MST1RQ04912 1400 aa40.11■■■■■ 4.01
AC006486.1-201ENST00000594664 BRINP3Q76B58 766 aa40.11■■■■■ 4.01
AC006486.1-201ENST00000594664 JCADQ9P266 1359 aa40.09■■■■■ 4.01
AC006486.1-201ENST00000594664 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP40.08■■■■■ 4.01
AC006486.1-201ENST00000594664 MYOM2P54296 1465 aa40.07■■■■■ 4.01
AC006486.1-201ENST00000594664 STK26Q9P289 416 aa40.07■■■■■ 4.01
AC006486.1-201ENST00000594664 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP40.05■■■■■ 4
AC006486.1-201ENST00000594664 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP40.05■■■■■ 4
AC006486.1-201ENST00000594664 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa40.04■■■■■ 4
AC006486.1-201ENST00000594664 TMEM132EQ6IEE7 984 aa40.02■■■■■ 4
AC006486.1-201ENST00000594664 NRXN1Q9ULB1 1477 aa40■■■■□ 3.99
AC006486.1-201ENST00000594664 TECPR2O15040 1411 aa39.99■■■■□ 3.99
AC006486.1-201ENST00000594664 ABCC11Q96J66 1382 aa39.99■■■■□ 3.99
AC006486.1-201ENST00000594664 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP39.99■■■■□ 3.99
AC006486.1-201ENST00000594664 LAMC1P11047 1609 aa39.98■■■■□ 3.99
AC006486.1-201ENST00000594664 C1orf167Q5SNV9 1468 aa39.96■■■■□ 3.99
AC006486.1-201ENST00000594664 SOCS7O14512 581 aa39.96■■■■□ 3.99
AC006486.1-201ENST00000594664 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP39.96■■■■□ 3.99
AC006486.1-201ENST00000594664 CFAP70Q5T0N1 1121 aa39.95■■■■□ 3.99
AC006486.1-201ENST00000594664 KNDC1Q76NI1 1749 aa39.94■■■■□ 3.98
AC006486.1-201ENST00000594664 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP39.93■■■■□ 3.98
AC006486.1-201ENST00000594664 WAPLQ7Z5K2 1190 aa39.91■■■■□ 3.98
AC006486.1-201ENST00000594664 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa39.91■■■■□ 3.98
AC006486.1-201ENST00000594664 DCAF11Q8TEB1 546 aa39.9■■■■□ 3.98
AC006486.1-201ENST00000594664 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa39.9■■■■□ 3.98
AC006486.1-201ENST00000594664 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa39.89■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms