RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.85■■■■□ 3.33
CAPNS1-214ENST00000592483 ERBINQ96RT1 1412 aa35.84■■■■□ 3.33
CAPNS1-214ENST00000592483 KIF15Q9NS87 1388 aa35.83■■■■□ 3.33
CAPNS1-214ENST00000592483 KANK1Q14678 1352 aa35.81■■■■□ 3.32
CAPNS1-214ENST00000592483 RXRBP28702 533 aa35.81■■■■□ 3.32
CAPNS1-214ENST00000592483 BCANQ96GW7 911 aa35.81■■■■□ 3.32
CAPNS1-214ENST00000592483 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.77■■■■□ 3.32
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.75■■■■□ 3.31
CAPNS1-214ENST00000592483 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa35.74■■■■□ 3.31
CAPNS1-214ENST00000592483 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
CAPNS1-214ENST00000592483 ADGRB3O60242 1522 aa35.73■■■■□ 3.31
CAPNS1-214ENST00000592483 LMTK2Q8IWU2 1503 aa35.73■■■■□ 3.31
CAPNS1-214ENST00000592483 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC52A1Q9NWF4 448 aa35.71■■■■□ 3.31
CAPNS1-214ENST00000592483 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa35.71■■■■□ 3.31
CAPNS1-214ENST00000592483 NOS1P29475 1434 aa35.7■■■■□ 3.31
CAPNS1-214ENST00000592483 SHPRHQ149N8 1683 aa35.7■■■■□ 3.31
CAPNS1-214ENST00000592483 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
CAPNS1-214ENST00000592483 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa35.66■■■■□ 3.3
CAPNS1-214ENST00000592483 CADPS2Q86UW7 1296 aa35.66■■■■□ 3.3
CAPNS1-214ENST00000592483 C14orf37Q86TY3 774 aa35.65■■■■□ 3.3
CAPNS1-214ENST00000592483 ABCC5O15440 1437 aa35.65■■■■□ 3.3
CAPNS1-214ENST00000592483 DAPK1P53355 1430 aa35.65■■■■□ 3.3
CAPNS1-214ENST00000592483 HDGFP51858 240 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
CAPNS1-214ENST00000592483 C19orf44Q9H6X5 657 aa35.63■■■■□ 3.29
CAPNS1-214ENST00000592483 TBX22Q9Y458 520 aa35.62■■■■□ 3.29
CAPNS1-214ENST00000592483 ZFYVE9O95405 1425 aa35.62■■■■□ 3.29
CAPNS1-214ENST00000592483 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.61■■■■□ 3.29
CAPNS1-214ENST00000592483 ATF3P18847 181 aa35.6■■■■□ 3.29
CAPNS1-214ENST00000592483 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
CAPNS1-214ENST00000592483 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
CAPNS1-214ENST00000592483 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
CAPNS1-214ENST00000592483 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
CAPNS1-214ENST00000592483 AFF2P51816 1311 aa35.57■■■■□ 3.28
CAPNS1-214ENST00000592483 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
CAPNS1-214ENST00000592483 RIMS2Q9UQ26 1411 aa35.54■■■■□ 3.28
CAPNS1-214ENST00000592483 DIP2AQ14689 1571 aa35.53■■■■□ 3.28
CAPNS1-214ENST00000592483 BRINP3Q76B58 766 aa35.52■■■■□ 3.28
CAPNS1-214ENST00000592483 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.49■■■■□ 3.27
CAPNS1-214ENST00000592483 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
CAPNS1-214ENST00000592483 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP35.47■■■■□ 3.27
CAPNS1-214ENST00000592483 ADGRL2O95490 1459 aa35.47■■■■□ 3.27
CAPNS1-214ENST00000592483 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
CAPNS1-214ENST00000592483 MYO5BQ9ULV0 1848 aa35.46■■■■□ 3.27
CAPNS1-214ENST00000592483 ROCK1Q13464 1354 aa35.46■■■■□ 3.27
CAPNS1-214ENST00000592483 PIK3R4Q99570 1358 aa35.46■■■■□ 3.27
CAPNS1-214ENST00000592483 RGS12O14924 1447 aa35.46■■■■□ 3.27
CAPNS1-214ENST00000592483 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.27
CAPNS1-214ENST00000592483 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa35.43■■■■□ 3.26
CAPNS1-214ENST00000592483 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.43■■■■□ 3.26
CAPNS1-214ENST00000592483 ITGAEP38570 1179 aa35.42■■■■□ 3.26
CAPNS1-214ENST00000592483 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.42■■■■□ 3.26
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa35.42■■■■□ 3.26
CAPNS1-214ENST00000592483 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
CAPNS1-214ENST00000592483 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.4■■■■□ 3.26
CAPNS1-214ENST00000592483 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
CAPNS1-214ENST00000592483 C8orf37Q96NL8 207 aa35.38■■■■□ 3.25
CAPNS1-214ENST00000592483 DCCP43146 1447 aa35.36■■■■□ 3.25
CAPNS1-214ENST00000592483 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa35.36■■■■□ 3.25
CAPNS1-214ENST00000592483 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa35.35■■■■□ 3.25
CAPNS1-214ENST00000592483 FOXD1Q16676 465 aa35.34■■■■□ 3.25
CAPNS1-214ENST00000592483 NGLY1Q96IV0 654 aa35.33■■■■□ 3.25
CAPNS1-214ENST00000592483 ATAD2Q6PL18 1390 aa35.31■■■■□ 3.24
CAPNS1-214ENST00000592483 CHGAP10645 457 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
CAPNS1-214ENST00000592483 ZRANB1Q9UGI0 708 aa35.3■■■■□ 3.24
CAPNS1-214ENST00000592483 NHSL1Q5SYE7 1610 aa35.28■■■■□ 3.24
CAPNS1-214ENST00000592483 TRPM2O94759 1503 aa35.28■■■■□ 3.24
CAPNS1-214ENST00000592483 HFM1A2PYH4 1435 aa35.28■■■■□ 3.24
CAPNS1-214ENST00000592483 PTPRUQ92729 1446 aa35.27■■■■□ 3.24
CAPNS1-214ENST00000592483 MST1RQ04912 1400 aa35.26■■■■□ 3.24
CAPNS1-214ENST00000592483 PNPLA6Q8IY17 1366 aa35.25■■■■□ 3.23
CAPNS1-214ENST00000592483 NAIPQ13075 1403 aa35.21■■■■□ 3.23
CAPNS1-214ENST00000592483 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.19■■■■□ 3.22
CAPNS1-214ENST00000592483 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
CAPNS1-214ENST00000592483 ADAMTS2O95450 1211 aa35.17■■■■□ 3.22
CAPNS1-214ENST00000592483 UNC13BO14795 1591 aa35.13■■■■□ 3.21
CAPNS1-214ENST00000592483 USP21Q9UK80 565 aa35.13■■■■□ 3.21
CAPNS1-214ENST00000592483 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP35.13■■■■□ 3.21
CAPNS1-214ENST00000592483 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa35.13■■■■□ 3.21
CAPNS1-214ENST00000592483 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC125Q86Z20 511 aa35.12■■■■□ 3.21
CAPNS1-214ENST00000592483 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
CAPNS1-214ENST00000592483 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.1■■■■□ 3.21
CAPNS1-214ENST00000592483 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.2
CAPNS1-214ENST00000592483 EP400Q96L91 3159 aa35.06■■■■□ 3.2
CAPNS1-214ENST00000592483 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa35.06■■■■□ 3.2
CAPNS1-214ENST00000592483 E9PCH4 1651 aa35.05■■■■□ 3.2
CAPNS1-214ENST00000592483 HRCP23327 699 aa35.03■■■■□ 3.2
CAPNS1-214ENST00000592483 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa35.02■■■■□ 3.2
CAPNS1-214ENST00000592483 ATRNO75882 1429 aa35■■■■□ 3.19
CAPNS1-214ENST00000592483 PTCH1Q13635 1447 aa35■■■■□ 3.19
CAPNS1-214ENST00000592483 METP08581 1390 aa35■■■■□ 3.19
CAPNS1-214ENST00000592483 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP34.99■■■■□ 3.19
CAPNS1-214ENST00000592483 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa34.99■■■■□ 3.19
CAPNS1-214ENST00000592483 LAMC1P11047 1609 aa34.98■■■■□ 3.19
CAPNS1-214ENST00000592483 C1orf167Q5SNV9 1468 aa34.97■■■■□ 3.19
CAPNS1-214ENST00000592483 NALCNQ8IZF0 1738 aa34.93■■■■□ 3.18
CAPNS1-214ENST00000592483 ORAI2Q96SN7 254 aa34.89■■■■□ 3.18
CAPNS1-214ENST00000592483 IQGAP3Q86VI3 1631 aa34.88■■■■□ 3.17
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