RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561518.5

RNPS1-204, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene RNPS1, Length 1,092 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-204ENST00000561518 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
RNPS1-204ENST00000561518 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.23■■□□□ 1.63
RNPS1-204ENST00000561518 ZFYVE9O95405 1425 aa25.22■■□□□ 1.63
RNPS1-204ENST00000561518 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.22■■□□□ 1.63
RNPS1-204ENST00000561518 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.21■■□□□ 1.63
RNPS1-204ENST00000561518 SLIT1O75093 1534 aa25.21■■□□□ 1.63
RNPS1-204ENST00000561518 LTKP29376 864 aa25.2■■□□□ 1.62
RNPS1-204ENST00000561518 PPLO60437 1756 aa25.2■■□□□ 1.62
RNPS1-204ENST00000561518 IFT172Q9UG01 1749 aa25.2■■□□□ 1.62
RNPS1-204ENST00000561518 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
RNPS1-204ENST00000561518 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.18■■□□□ 1.62
RNPS1-204ENST00000561518 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.16■■□□□ 1.62
RNPS1-204ENST00000561518 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
RNPS1-204ENST00000561518 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.16■■□□□ 1.62
RNPS1-204ENST00000561518 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.62
RNPS1-204ENST00000561518 EID1Q9Y6B2 187 aa25.15■■□□□ 1.62
RNPS1-204ENST00000561518 MYOM2P54296 1465 aa25.14■■□□□ 1.61
RNPS1-204ENST00000561518 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.13■■□□□ 1.61
RNPS1-204ENST00000561518 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
RNPS1-204ENST00000561518 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
RNPS1-204ENST00000561518 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.13■■□□□ 1.61
RNPS1-204ENST00000561518 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
RNPS1-204ENST00000561518 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.09■■□□□ 1.61
RNPS1-204ENST00000561518 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.09■■□□□ 1.61
RNPS1-204ENST00000561518 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.07■■□□□ 1.6
RNPS1-204ENST00000561518 BCANQ96GW7 911 aa25.07■■□□□ 1.6
RNPS1-204ENST00000561518 STAC3Q96MF2 364 aa25.07■■□□□ 1.6
RNPS1-204ENST00000561518 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.06■■□□□ 1.6
RNPS1-204ENST00000561518 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
RNPS1-204ENST00000561518 PIK3C2GO75747 1445 aa25.05■■□□□ 1.6
RNPS1-204ENST00000561518 STRCQ7RTU9 1775 aa25.03■■□□□ 1.6
RNPS1-204ENST00000561518 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
RNPS1-204ENST00000561518 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.02■■□□□ 1.6
RNPS1-204ENST00000561518 IQGAP1P46940 1657 aa25.02■■□□□ 1.6
RNPS1-204ENST00000561518 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.02■■□□□ 1.6
RNPS1-204ENST00000561518 MED14O60244 1454 aa25.02■■□□□ 1.6
RNPS1-204ENST00000561518 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.01■■□□□ 1.59
RNPS1-204ENST00000561518 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
RNPS1-204ENST00000561518 SLC26A8Q96RN1 970 aa25■■□□□ 1.59
RNPS1-204ENST00000561518 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25■■□□□ 1.59
RNPS1-204ENST00000561518 ALKQ9UM73 1620 aa24.98■■□□□ 1.59
RNPS1-204ENST00000561518 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
RNPS1-204ENST00000561518 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.96■■□□□ 1.59
RNPS1-204ENST00000561518 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.96■■□□□ 1.59
RNPS1-204ENST00000561518 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
RNPS1-204ENST00000561518 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.93■■□□□ 1.58
RNPS1-204ENST00000561518 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.92■■□□□ 1.58
RNPS1-204ENST00000561518 TBX22Q9Y458 520 aa24.92■■□□□ 1.58
RNPS1-204ENST00000561518 METP08581 1390 aa24.92■■□□□ 1.58
RNPS1-204ENST00000561518 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.91■■□□□ 1.58
RNPS1-204ENST00000561518 LAMC1P11047 1609 aa24.91■■□□□ 1.58
RNPS1-204ENST00000561518 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.91■■□□□ 1.58
RNPS1-204ENST00000561518 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
RNPS1-204ENST00000561518 DIP2AQ14689 1571 aa24.89■■□□□ 1.58
RNPS1-204ENST00000561518 ADGRB1O14514 1584 aa24.88■■□□□ 1.57
RNPS1-204ENST00000561518 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.85■■□□□ 1.57
RNPS1-204ENST00000561518 PTPRUQ92729 1446 aa24.85■■□□□ 1.57
RNPS1-204ENST00000561518 STK26Q9P289 416 aa24.84■■□□□ 1.57
RNPS1-204ENST00000561518 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.83■■□□□ 1.57
RNPS1-204ENST00000561518 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.83■■□□□ 1.57
RNPS1-204ENST00000561518 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
RNPS1-204ENST00000561518 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.8■■□□□ 1.56
RNPS1-204ENST00000561518 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
RNPS1-204ENST00000561518 PIK3R4Q99570 1358 aa24.8■■□□□ 1.56
RNPS1-204ENST00000561518 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.79■■□□□ 1.56
RNPS1-204ENST00000561518 KCNA6P17658 529 aa24.76■■□□□ 1.55
RNPS1-204ENST00000561518 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
RNPS1-204ENST00000561518 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
RNPS1-204ENST00000561518 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
RNPS1-204ENST00000561518 ABCC11Q96J66 1382 aa24.75■■□□□ 1.55
RNPS1-204ENST00000561518 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.73■■□□□ 1.55
RNPS1-204ENST00000561518 NWD1Q149M9 1564 aa24.73■■□□□ 1.55
RNPS1-204ENST00000561518 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.73■■□□□ 1.55
RNPS1-204ENST00000561518 TECPR2O15040 1411 aa24.72■■□□□ 1.55
RNPS1-204ENST00000561518 USP47Q96K76 1375 aa24.72■■□□□ 1.55
RNPS1-204ENST00000561518 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.71■■□□□ 1.55
RNPS1-204ENST00000561518 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.7■■□□□ 1.55
RNPS1-204ENST00000561518 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.7■■□□□ 1.54
RNPS1-204ENST00000561518 CPS1P31327 1500 aa24.7■■□□□ 1.54
RNPS1-204ENST00000561518 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
RNPS1-204ENST00000561518 PRAM1Q96QH2 718 aa24.69■■□□□ 1.54
RNPS1-204ENST00000561518 DLC1Q96QB1 1528 aa24.69■■□□□ 1.54
RNPS1-204ENST00000561518 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.68■■□□□ 1.54
RNPS1-204ENST00000561518 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
RNPS1-204ENST00000561518 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
RNPS1-204ENST00000561518 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
RNPS1-204ENST00000561518 PTCH1Q13635 1447 aa24.67■■□□□ 1.54
RNPS1-204ENST00000561518 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.66■■□□□ 1.54
RNPS1-204ENST00000561518 POGKQ9P215 609 aa24.66■■□□□ 1.54
RNPS1-204ENST00000561518 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.65■■□□□ 1.54
RNPS1-204ENST00000561518 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
RNPS1-204ENST00000561518 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
RNPS1-204ENST00000561518 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
RNPS1-204ENST00000561518 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.64■■□□□ 1.54
RNPS1-204ENST00000561518 SIRT1Q96EB6 747 aa24.64■■□□□ 1.54
RNPS1-204ENST00000561518 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
RNPS1-204ENST00000561518 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.6■■□□□ 1.53
RNPS1-204ENST00000561518 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.59■■□□□ 1.53
RNPS1-204ENST00000561518 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.59■■□□□ 1.53
RNPS1-204ENST00000561518 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms