RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
CS-211ENST00000548041 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
CS-211ENST00000548041 DMRT2Q9Y5R5 561 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-211ENST00000548041 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
CS-211ENST00000548041 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
CS-211ENST00000548041 TXNDC2Q86VQ3 553 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-211ENST00000548041 CCDC144AA2RUR9 1427 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-211ENST00000548041 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
CS-211ENST00000548041 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
CS-211ENST00000548041 HRCP23327 699 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-211ENST00000548041 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
CS-211ENST00000548041 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
CS-211ENST00000548041 DIP2AQ14689 1571 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-211ENST00000548041 EID1Q9Y6B2 187 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-211ENST00000548041 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-211ENST00000548041 NWD1Q149M9 1564 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-211ENST00000548041 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-211ENST00000548041 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-211ENST00000548041 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
CS-211ENST00000548041 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-211ENST00000548041 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
CS-211ENST00000548041 CPS1P31327 1500 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-211ENST00000548041 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-211ENST00000548041 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.38
CS-211ENST00000548041 SLC26A8Q96RN1 970 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-211ENST00000548041 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP12.69□□□□□ -0.38
CS-211ENST00000548041 BCANQ96GW7 911 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-211ENST00000548041 ALKQ9UM73 1620 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-211ENST00000548041 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CS-211ENST00000548041 LRRC7Q96NW7 1537 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-211ENST00000548041 RGL3Q3MIN7 710 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-211ENST00000548041 CERKQ8TCT0 537 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-211ENST00000548041 LAMC1P11047 1609 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-211ENST00000548041 IQSEC2Q5JU85 1478 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-211ENST00000548041 HDGFP51858 240 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
CS-211ENST00000548041 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
CS-211ENST00000548041 MYOM2P54296 1465 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-211ENST00000548041 PTPRUQ92729 1446 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-211ENST00000548041 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-211ENST00000548041 KNDC1Q76NI1 1749 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-211ENST00000548041 PCGF6Q9BYE7 350 aa12.64□□□□□ -0.39
CS-211ENST00000548041 NALCNQ8IZF0 1738 aa12.64□□□□□ -0.39
CS-211ENST00000548041 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-211ENST00000548041 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-211ENST00000548041 PIK3C2GO75747 1445 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-211ENST00000548041 NRXN1Q9ULB1 1477 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-211ENST00000548041 METP08581 1390 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-211ENST00000548041 VGFO15240 615 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
CS-211ENST00000548041 TBX22Q9Y458 520 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-211ENST00000548041 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
CS-211ENST00000548041 PIK3R4Q99570 1358 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-211ENST00000548041 KCNA6P17658 529 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-211ENST00000548041 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
CS-211ENST00000548041 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-211ENST00000548041 SIN3AQ96ST3 1273 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-211ENST00000548041 TMEM94Q12767 1356 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-211ENST00000548041 FBXO41Q8TF61 875 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-211ENST00000548041 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
CS-211ENST00000548041 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-211ENST00000548041 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
CS-211ENST00000548041 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-211ENST00000548041 ADGRB1O14514 1584 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-211ENST00000548041 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
CS-211ENST00000548041 DCAF11Q8TEB1 546 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-211ENST00000548041 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-211ENST00000548041 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-211ENST00000548041 PTCH1Q13635 1447 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-211ENST00000548041 NEUROD1Q13562 356 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-211ENST00000548041 PRAG1Q86YV5 1406 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-211ENST00000548041 ROBO2Q9HCK4 1378 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-211ENST00000548041 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
CS-211ENST00000548041 UBAP1LF5GYI3 381 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-211ENST00000548041 CFAP70Q5T0N1 1121 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-211ENST00000548041 TMEM132EQ6IEE7 984 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-211ENST00000548041 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
CS-211ENST00000548041 MSH6P52701 1360 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-211ENST00000548041 TECPR2O15040 1411 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-211ENST00000548041 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
CS-211ENST00000548041 FMN2Q9NZ56 1722 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-211ENST00000548041 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-211ENST00000548041 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-211ENST00000548041 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
CS-211ENST00000548041 L3MBTL2Q969R5 705 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-211ENST00000548041 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-211ENST00000548041 DLC1Q96QB1 1528 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-211ENST00000548041 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-211ENST00000548041 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
CS-211ENST00000548041 PIP4K2BP78356 416 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-211ENST00000548041 STK26Q9P289 416 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-211ENST00000548041 PHLPP1O60346 1717 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-211ENST00000548041 QRICH2Q9H0J4 1663 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-211ENST00000548041 TOM1O60784 492 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-211ENST00000548041 C14orf37Q86TY3 774 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-211ENST00000548041 NHSL1Q5SYE7 1610 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-211ENST00000548041 DCCP43146 1447 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-211ENST00000548041 ABCC11Q96J66 1382 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-211ENST00000548041 ADGRB2O60241 1585 aa12.46□□□□□ -0.42
CS-211ENST00000548041 TONSLQ96HA7 1378 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-211ENST00000548041 STAC3Q96MF2 364 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-211ENST00000548041 WAPLQ7Z5K2 1190 aa12.44□□□□□ -0.42
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