RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-202ENST00000542324 SYCP2Q9BX26 1530 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-202ENST00000542324 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP13.74□□□□□ -0.21
CS-202ENST00000542324 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-202ENST00000542324 NINLQ9Y2I6 1382 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-202ENST00000542324 NGEFQ8N5V2 710 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-202ENST00000542324 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa13.73□□□□□ -0.21
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CS-202ENST00000542324 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP13.72□□□□□ -0.21
CS-202ENST00000542324 CDCA8Q53HL2 280 aa13.72□□□□□ -0.21
CS-202ENST00000542324 STAC3Q96MF2 364 aa13.72□□□□□ -0.21
CS-202ENST00000542324 MYOM1P52179 1685 aa13.72□□□□□ -0.21
CS-202ENST00000542324 PPP2R1AP30153 589 aa13.72□□□□□ -0.21
CS-202ENST00000542324 ADAMTS8Q9UP79 889 aa13.72□□□□□ -0.21
CS-202ENST00000542324 SCAPERQ9BY12 1400 aa13.71□□□□□ -0.21
CS-202ENST00000542324 CEP152O94986 1710 aa13.71□□□□□ -0.21
CS-202ENST00000542324 C20orf194Q5TEA3 1177 aa13.71□□□□□ -0.21
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CS-202ENST00000542324 SLFN5Q08AF3 891 aa13.7□□□□□ -0.22
CS-202ENST00000542324 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
CS-202ENST00000542324 NEURL4Q96JN8 1562 aa13.69□□□□□ -0.22
CS-202ENST00000542324 ARHGAP5Q13017 1502 aa13.69□□□□□ -0.22
CS-202ENST00000542324 ZMYM3Q14202 1370 aa13.69□□□□□ -0.22
CS-202ENST00000542324 KNSTRNQ9Y448 316 aa13.69□□□□□ -0.22
CS-202ENST00000542324 TTC37Q6PGP7 1564 aa13.68□□□□□ -0.22
CS-202ENST00000542324 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
CS-202ENST00000542324 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
CS-202ENST00000542324 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
CS-202ENST00000542324 RGL3Q3MIN7 710 aa13.67□□□□□ -0.22
CS-202ENST00000542324 TRPM2O94759 1503 aa13.67□□□□□ -0.22
CS-202ENST00000542324 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP13.66□□□□□ -0.222e-20■□□□□ 10.1
CS-202ENST00000542324 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
CS-202ENST00000542324 SKAP1Q86WV1 359 aa13.65□□□□□ -0.22
CS-202ENST00000542324 BRPF3Q9ULD4 1205 aa13.65□□□□□ -0.22
CS-202ENST00000542324 CGNL1Q0VF96 1302 aa13.65□□□□□ -0.22
CS-202ENST00000542324 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa13.65□□□□□ -0.22
CS-202ENST00000542324 SHROOM2Q13796 1616 aa13.65□□□□□ -0.22
CS-202ENST00000542324 SLC24A1O60721 1099 aa13.65□□□□□ -0.22
CS-202ENST00000542324 AAMPQ13685 434 aa13.65□□□□□ -0.22
CS-202ENST00000542324 E9PSI1 815 aa13.63□□□□□ -0.23
CS-202ENST00000542324 PDE3AQ14432 1141 aa13.63□□□□□ -0.23
CS-202ENST00000542324 FAM43AQ8N2R8 423 aa13.63□□□□□ -0.23
CS-202ENST00000542324 DEPDC5O75140 1603 aa13.62□□□□□ -0.23
CS-202ENST00000542324 SLC4A3P48751 1232 aa13.61□□□□□ -0.23
CS-202ENST00000542324 BECN1Q14457 450 aa13.61□□□□□ -0.23
CS-202ENST00000542324 PTPRTO14522 1441 aa13.61□□□□□ -0.23
CS-202ENST00000542324 TET3O43151 1660 aa13.6□□□□□ -0.23
CS-202ENST00000542324 MYO3AQ8NEV4 1616 aa13.6□□□□□ -0.23
CS-202ENST00000542324 CLTCL1P53675 1640 aa13.59□□□□□ -0.23
CS-202ENST00000542324 ABCC1P33527 1531 aa13.59□□□□□ -0.23
CS-202ENST00000542324 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
CS-202ENST00000542324 NLRP1Q9C000 1473 aa13.59□□□□□ -0.23
CS-202ENST00000542324 RGS3P49796 1198 aa13.59□□□□□ -0.23
CS-202ENST00000542324 USP19O94966 1318 aa13.58□□□□□ -0.23
CS-202ENST00000542324 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP13.58□□□□□ -0.246e-9■□□□□ 10
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CS-202ENST00000542324 MYOM2P54296 1465 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-202ENST00000542324 FBLN2P98095 1184 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-202ENST00000542324 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
CS-202ENST00000542324 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
CS-202ENST00000542324 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa13.56□□□□□ -0.24
CS-202ENST00000542324 ARAP3Q8WWN8 1544 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-202ENST00000542324 CLUAP1Q96AJ1 413 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-202ENST00000542324 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-202ENST00000542324 SHPRHQ149N8 1683 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-202ENST00000542324 PLCH2O75038 1416 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-202ENST00000542324 VWDEQ8N2E2 1590 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-202ENST00000542324 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-202ENST00000542324 IFT172Q9UG01 1749 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-202ENST00000542324 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
CS-202ENST00000542324 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-202ENST00000542324 APAF1O14727 1248 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-202ENST00000542324 ERVK-7P63135 1459 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-202ENST00000542324 USP32Q8NFA0 1604 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-202ENST00000542324 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
CS-202ENST00000542324 ABCA6Q8N139 1617 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-202ENST00000542324 IGHDP01880 384 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-202ENST00000542324 IQSEC2Q5JU85 1478 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-202ENST00000542324 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa13.52□□□□□ -0.25
CS-202ENST00000542324 BCAR3O75815 825 aa13.52□□□□□ -0.25
CS-202ENST00000542324 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
CS-202ENST00000542324 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
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CS-202ENST00000542324 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
CS-202ENST00000542324 KANK1Q14678 1352 aa13.51□□□□□ -0.25
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CS-202ENST00000542324 ANTXR1Q9H6X2 564 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-202ENST00000542324 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-202ENST00000542324 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
CS-202ENST00000542324 SOCS7O14512 581 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-202ENST00000542324 CANXP27824 592 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CS-202ENST00000542324 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-202ENST00000542324 TBC1D32Q96NH3 1257 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-202ENST00000542324 CHD1O14646 1710 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-202ENST00000542324 NRXN1Q9ULB1 1477 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-202ENST00000542324 WWC1Q8IX03 1113 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-202ENST00000542324 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
CS-202ENST00000542324 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
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