RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526055.5

TSPAN4-216, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-216ENST00000526055 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
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TSPAN4-216ENST00000526055 TOM1O60784 492 aa27.65■■■□□ 2.02
TSPAN4-216ENST00000526055 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
TSPAN4-216ENST00000526055 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.65■■■□□ 2.02
TSPAN4-216ENST00000526055 TRPM2O94759 1503 aa27.62■■■□□ 2.01
TSPAN4-216ENST00000526055 KCNA6P17658 529 aa27.62■■■□□ 2.01
TSPAN4-216ENST00000526055 SLC26A8Q96RN1 970 aa27.61■■■□□ 2.01
TSPAN4-216ENST00000526055 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
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TSPAN4-216ENST00000526055 TBX22Q9Y458 520 aa27.57■■■□□ 2
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TSPAN4-216ENST00000526055 CLTCL1P53675 1640 aa27.52■■■□□ 2
TSPAN4-216ENST00000526055 DIP2AQ14689 1571 aa27.52■■■□□ 2
TSPAN4-216ENST00000526055 PIK3R4Q99570 1358 aa27.51■■□□□ 1.99
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TSPAN4-216ENST00000526055 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.5■■□□□ 1.99
TSPAN4-216ENST00000526055 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.5■■□□□ 1.99
TSPAN4-216ENST00000526055 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
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TSPAN4-216ENST00000526055 TMEM94Q12767 1356 aa27.48■■□□□ 1.99
TSPAN4-216ENST00000526055 PIP4K2BP78356 416 aa27.47■■□□□ 1.99
TSPAN4-216ENST00000526055 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
TSPAN4-216ENST00000526055 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.47■■□□□ 1.99
TSPAN4-216ENST00000526055 ALKQ9UM73 1620 aa27.47■■□□□ 1.99
TSPAN4-216ENST00000526055 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
TSPAN4-216ENST00000526055 KIF1BO60333 1816 aa27.46■■□□□ 1.99
TSPAN4-216ENST00000526055 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
TSPAN4-216ENST00000526055 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
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TSPAN4-216ENST00000526055 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa27.41■■□□□ 1.98
TSPAN4-216ENST00000526055 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa27.41■■□□□ 1.98
TSPAN4-216ENST00000526055 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
TSPAN4-216ENST00000526055 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.39■■□□□ 1.97
TSPAN4-216ENST00000526055 VGFO15240 615 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
TSPAN4-216ENST00000526055 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.37■■□□□ 1.97
TSPAN4-216ENST00000526055 HSPA1LP34931 641 aa27.37■■□□□ 1.97
TSPAN4-216ENST00000526055 FOXD1Q16676 465 aa27.37■■□□□ 1.97
TSPAN4-216ENST00000526055 MSH6P52701 1360 aa27.36■■□□□ 1.97
TSPAN4-216ENST00000526055 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa27.36■■□□□ 1.97
TSPAN4-216ENST00000526055 HRCP23327 699 aa27.35■■□□□ 1.97
TSPAN4-216ENST00000526055 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa27.33■■□□□ 1.97
TSPAN4-216ENST00000526055 FAM135BQ49AJ0 1406 aa27.33■■□□□ 1.96
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TSPAN4-216ENST00000526055 PTPRUQ92729 1446 aa27.31■■□□□ 1.96
TSPAN4-216ENST00000526055 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.28■■□□□ 1.96
TSPAN4-216ENST00000526055 METP08581 1390 aa27.27■■□□□ 1.96
TSPAN4-216ENST00000526055 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
TSPAN4-216ENST00000526055 ILDR2Q71H61 639 aa27.25■■□□□ 1.95
TSPAN4-216ENST00000526055 C19orf44Q9H6X5 657 aa27.25■■□□□ 1.95
TSPAN4-216ENST00000526055 PPLO60437 1756 aa27.25■■□□□ 1.95
TSPAN4-216ENST00000526055 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.24■■□□□ 1.95
TSPAN4-216ENST00000526055 C14orf37Q86TY3 774 aa27.24■■□□□ 1.95
TSPAN4-216ENST00000526055 SLAIN2Q9P270 581 aa27.23■■□□□ 1.95
TSPAN4-216ENST00000526055 CADPS2Q86UW7 1296 aa27.22■■□□□ 1.95
TSPAN4-216ENST00000526055 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
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TSPAN4-216ENST00000526055 RGL3Q3MIN7 710 aa27.19■■□□□ 1.94
TSPAN4-216ENST00000526055 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.18■■□□□ 1.94
TSPAN4-216ENST00000526055 ATF3P18847 181 aa27.18■■□□□ 1.94
TSPAN4-216ENST00000526055 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
TSPAN4-216ENST00000526055 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa27.16■■□□□ 1.94
TSPAN4-216ENST00000526055 PTCH1Q13635 1447 aa27.16■■□□□ 1.94
TSPAN4-216ENST00000526055 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
TSPAN4-216ENST00000526055 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.15■■□□□ 1.94
TSPAN4-216ENST00000526055 SOCS7O14512 581 aa27.13■■□□□ 1.93
TSPAN4-216ENST00000526055 IFT172Q9UG01 1749 aa27.13■■□□□ 1.93
TSPAN4-216ENST00000526055 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa27.1■■□□□ 1.93
TSPAN4-216ENST00000526055 PIK3C2GO75747 1445 aa27.09■■□□□ 1.93
TSPAN4-216ENST00000526055 MYOM2P54296 1465 aa27.07■■□□□ 1.92
TSPAN4-216ENST00000526055 ROBO2Q9HCK4 1378 aa27.06■■□□□ 1.92
TSPAN4-216ENST00000526055 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.05■■□□□ 1.92
TSPAN4-216ENST00000526055 STAC3Q96MF2 364 aa27.03■■□□□ 1.92
TSPAN4-216ENST00000526055 TECPR2O15040 1411 aa27.02■■□□□ 1.92
TSPAN4-216ENST00000526055 MST1RQ04912 1400 aa27.02■■□□□ 1.92
TSPAN4-216ENST00000526055 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
TSPAN4-216ENST00000526055 ABCC11Q96J66 1382 aa27.01■■□□□ 1.91
TSPAN4-216ENST00000526055 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
TSPAN4-216ENST00000526055 BRINP3Q76B58 766 aa27■■□□□ 1.91
TSPAN4-216ENST00000526055 PHLPP1O60346 1717 aa26.99■■□□□ 1.91
TSPAN4-216ENST00000526055 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.99■■□□□ 1.91
TSPAN4-216ENST00000526055 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
TSPAN4-216ENST00000526055 LAMC1P11047 1609 aa26.97■■□□□ 1.91
TSPAN4-216ENST00000526055 JCADQ9P266 1359 aa26.97■■□□□ 1.91
TSPAN4-216ENST00000526055 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.95■■□□□ 1.91
TSPAN4-216ENST00000526055 SIRT1Q96EB6 747 aa26.95■■□□□ 1.9
TSPAN4-216ENST00000526055 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
TSPAN4-216ENST00000526055 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
TSPAN4-216ENST00000526055 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
TSPAN4-216ENST00000526055 KNDC1Q76NI1 1749 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPAN4-216ENST00000526055 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPAN4-216ENST00000526055 STK26Q9P289 416 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPAN4-216ENST00000526055 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
TSPAN4-216ENST00000526055 C1orf167Q5SNV9 1468 aa26.92■■□□□ 1.9
TSPAN4-216ENST00000526055 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.91■■□□□ 1.9
TSPAN4-216ENST00000526055 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.89■■□□□ 1.9
TSPAN4-216ENST00000526055 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa26.88■■□□□ 1.89
TSPAN4-216ENST00000526055 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa26.87■■□□□ 1.89
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