RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489697.1

RAI1-204, Transcript of retinoic acid induced 1, humanhuman

TSL 3

Gene RAI1, Length 1,570 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI1-204ENST00000489697 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.08■■□□□ 1.29
RAI1-204ENST00000489697 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.07■■□□□ 1.28
RAI1-204ENST00000489697 LTKP29376 864 aa23.07■■□□□ 1.28
RAI1-204ENST00000489697 EID1Q9Y6B2 187 aa23.07■■□□□ 1.28
RAI1-204ENST00000489697 ZFYVE9O95405 1425 aa23.07■■□□□ 1.28
RAI1-204ENST00000489697 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
RAI1-204ENST00000489697 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.28
RAI1-204ENST00000489697 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.05■■□□□ 1.28
RAI1-204ENST00000489697 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
RAI1-204ENST00000489697 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.04■■□□□ 1.28
RAI1-204ENST00000489697 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
RAI1-204ENST00000489697 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.01■■□□□ 1.27
RAI1-204ENST00000489697 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.01■■□□□ 1.27
RAI1-204ENST00000489697 TONSLQ96HA7 1378 aa23■■□□□ 1.27
RAI1-204ENST00000489697 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
RAI1-204ENST00000489697 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
RAI1-204ENST00000489697 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23■■□□□ 1.27
RAI1-204ENST00000489697 PPLO60437 1756 aa22.99■■□□□ 1.27
RAI1-204ENST00000489697 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
RAI1-204ENST00000489697 STRCQ7RTU9 1775 aa22.97■■□□□ 1.27
RAI1-204ENST00000489697 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.97■■□□□ 1.27
RAI1-204ENST00000489697 IFT172Q9UG01 1749 aa22.97■■□□□ 1.27
RAI1-204ENST00000489697 BCANQ96GW7 911 aa22.97■■□□□ 1.27
RAI1-204ENST00000489697 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.95■■□□□ 1.27
RAI1-204ENST00000489697 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.27
RAI1-204ENST00000489697 MED14O60244 1454 aa22.95■■□□□ 1.26
RAI1-204ENST00000489697 STAC3Q96MF2 364 aa22.94■■□□□ 1.26
RAI1-204ENST00000489697 MYOM2P54296 1465 aa22.93■■□□□ 1.26
RAI1-204ENST00000489697 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.91■■□□□ 1.26
RAI1-204ENST00000489697 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.9■■□□□ 1.26
RAI1-204ENST00000489697 IQGAP1P46940 1657 aa22.9■■□□□ 1.26
RAI1-204ENST00000489697 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.89■■□□□ 1.26
RAI1-204ENST00000489697 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.89■■□□□ 1.25
RAI1-204ENST00000489697 PIK3C2GO75747 1445 aa22.88■■□□□ 1.25
RAI1-204ENST00000489697 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.87■■□□□ 1.25
RAI1-204ENST00000489697 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.86■■□□□ 1.25
RAI1-204ENST00000489697 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.85■■□□□ 1.25
RAI1-204ENST00000489697 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.84■■□□□ 1.25
RAI1-204ENST00000489697 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.84■■□□□ 1.25
RAI1-204ENST00000489697 TBX22Q9Y458 520 aa22.84■■□□□ 1.25
RAI1-204ENST00000489697 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
RAI1-204ENST00000489697 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.82■■□□□ 1.24
RAI1-204ENST00000489697 ALKQ9UM73 1620 aa22.82■■□□□ 1.24
RAI1-204ENST00000489697 DIP2AQ14689 1571 aa22.79■■□□□ 1.24
RAI1-204ENST00000489697 METP08581 1390 aa22.78■■□□□ 1.24
RAI1-204ENST00000489697 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.77■■□□□ 1.24
RAI1-204ENST00000489697 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
RAI1-204ENST00000489697 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.75■■□□□ 1.23
RAI1-204ENST00000489697 LAMC1P11047 1609 aa22.75■■□□□ 1.23
RAI1-204ENST00000489697 PIK3R4Q99570 1358 aa22.74■■□□□ 1.23
RAI1-204ENST00000489697 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
RAI1-204ENST00000489697 PTPRUQ92729 1446 aa22.72■■□□□ 1.23
RAI1-204ENST00000489697 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.72■■□□□ 1.23
RAI1-204ENST00000489697 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.72■■□□□ 1.23
RAI1-204ENST00000489697 KCNA6P17658 529 aa22.72■■□□□ 1.23
RAI1-204ENST00000489697 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.72■■□□□ 1.23
RAI1-204ENST00000489697 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.71■■□□□ 1.23
RAI1-204ENST00000489697 ADGRB1O14514 1584 aa22.7■■□□□ 1.22
RAI1-204ENST00000489697 STK26Q9P289 416 aa22.7■■□□□ 1.22
RAI1-204ENST00000489697 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
RAI1-204ENST00000489697 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
RAI1-204ENST00000489697 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
RAI1-204ENST00000489697 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.67■■□□□ 1.22
RAI1-204ENST00000489697 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
RAI1-204ENST00000489697 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.65■■□□□ 1.22
RAI1-204ENST00000489697 NWD1Q149M9 1564 aa22.65■■□□□ 1.22
RAI1-204ENST00000489697 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.64■■□□□ 1.22
RAI1-204ENST00000489697 ABCC11Q96J66 1382 aa22.64■■□□□ 1.21
RAI1-204ENST00000489697 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.63■■□□□ 1.21
RAI1-204ENST00000489697 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.63■■□□□ 1.21
RAI1-204ENST00000489697 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
RAI1-204ENST00000489697 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
RAI1-204ENST00000489697 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
RAI1-204ENST00000489697 TECPR2O15040 1411 aa22.61■■□□□ 1.21
RAI1-204ENST00000489697 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
RAI1-204ENST00000489697 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.6■■□□□ 1.21
RAI1-204ENST00000489697 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.6■■□□□ 1.21
RAI1-204ENST00000489697 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
RAI1-204ENST00000489697 CPS1P31327 1500 aa22.59■■□□□ 1.21
RAI1-204ENST00000489697 PTCH1Q13635 1447 aa22.58■■□□□ 1.21
RAI1-204ENST00000489697 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.58■■□□□ 1.2
RAI1-204ENST00000489697 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.57■■□□□ 1.2
RAI1-204ENST00000489697 SIRT1Q96EB6 747 aa22.56■■□□□ 1.2
RAI1-204ENST00000489697 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.56■■□□□ 1.2
RAI1-204ENST00000489697 DLC1Q96QB1 1528 aa22.56■■□□□ 1.2
RAI1-204ENST00000489697 PRAM1Q96QH2 718 aa22.55■■□□□ 1.2
RAI1-204ENST00000489697 TMEM94Q12767 1356 aa22.55■■□□□ 1.2
RAI1-204ENST00000489697 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.55■■□□□ 1.2
RAI1-204ENST00000489697 POGKQ9P215 609 aa22.55■■□□□ 1.2
RAI1-204ENST00000489697 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.54■■□□□ 1.2
RAI1-204ENST00000489697 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.2
RAI1-204ENST00000489697 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.19
RAI1-204ENST00000489697 C14orf37Q86TY3 774 aa22.5■■□□□ 1.19
RAI1-204ENST00000489697 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
RAI1-204ENST00000489697 USP47Q96K76 1375 aa22.49■■□□□ 1.19
RAI1-204ENST00000489697 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
RAI1-204ENST00000489697 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.48■■□□□ 1.19
RAI1-204ENST00000489697 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
RAI1-204ENST00000489697 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.46■■□□□ 1.19
RAI1-204ENST00000489697 CERKQ8TCT0 537 aa22.46■■□□□ 1.19
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