RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 ERBINQ96RT1 1412 aa21■□□□□ 0.95
CCSAP-204ENST00000483092 CFAP70Q5T0N1 1121 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-204ENST00000483092 C20orf194Q5TEA3 1177 aa20.99■□□□□ 0.95
CCSAP-204ENST00000483092 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.98■□□□□ 0.95
CCSAP-204ENST00000483092 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-204ENST00000483092 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-204ENST00000483092 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-204ENST00000483092 DUOX2Q9NRD8 1548 aa20.95■□□□□ 0.95
CCSAP-204ENST00000483092 FAM161AQ3B820 660 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-204ENST00000483092 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-204ENST00000483092 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-204ENST00000483092 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-204ENST00000483092 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-204ENST00000483092 ZMYND15Q9H091 742 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-204ENST00000483092 PARD3Q8TEW0 1356 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-204ENST00000483092 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-204ENST00000483092 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-204ENST00000483092 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-204ENST00000483092 KANK1Q14678 1352 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-204ENST00000483092 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-204ENST00000483092 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.89■□□□□ 0.94
CCSAP-204ENST00000483092 SHROOM2Q13796 1616 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-204ENST00000483092 FANCAO15360 1455 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-204ENST00000483092 TRAK1Q9UPV9 953 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-204ENST00000483092 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-204ENST00000483092 PPP2R1AP30153 589 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-204ENST00000483092 GPRASP1Q5JY77 1395 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-204ENST00000483092 UNC13BO14795 1591 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-204ENST00000483092 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM132EQ6IEE7 984 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-204ENST00000483092 CANXP27824 592 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-204ENST00000483092 MAST1Q9Y2H9 1570 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-204ENST00000483092 ABCC1P33527 1531 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-204ENST00000483092 BECN1Q14457 450 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-204ENST00000483092 UGGT1Q9NYU2 1555 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-204ENST00000483092 NEUROD2Q15784 382 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-204ENST00000483092 IQGAP3Q86VI3 1631 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-204ENST00000483092 PDE3BQ13370 1112 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-204ENST00000483092 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-204ENST00000483092 ADGRL1O94910 1474 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-204ENST00000483092 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
CCSAP-204ENST00000483092 ATP10AO60312 1499 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-204ENST00000483092 PLXNC1O60486 1568 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-204ENST00000483092 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-204ENST00000483092 RAPGEF3O95398 923 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-204ENST00000483092 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-204ENST00000483092 CDCA8Q53HL2 280 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-204ENST00000483092 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-204ENST00000483092 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-204ENST00000483092 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-204ENST00000483092 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-204ENST00000483092 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-204ENST00000483092 C8orf34Q49A92 452 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-204ENST00000483092 ASXL2Q76L83 1435 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-204ENST00000483092 APAF1O14727 1248 aa20.77■□□□□ 0.92
CCSAP-204ENST00000483092 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
CCSAP-204ENST00000483092 PANK2Q9BZ23 570 aa20.77■□□□□ 0.91
CCSAP-204ENST00000483092 E9PCH4 1651 aa20.76■□□□□ 0.91
CCSAP-204ENST00000483092 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.76■□□□□ 0.91
CCSAP-204ENST00000483092 ARID3AQ99856 593 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-204ENST00000483092 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-204ENST00000483092 STK26Q9P289 416 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-204ENST00000483092 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa20.74■□□□□ 0.91
CCSAP-204ENST00000483092 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-204ENST00000483092 ATP7AQ04656 1500 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-204ENST00000483092 OSCARQ8IYS5 282 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-204ENST00000483092 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-204ENST00000483092 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-204ENST00000483092 CARD14Q9BXL6 1004 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-204ENST00000483092 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-204ENST00000483092 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-204ENST00000483092 CLTCL1P53675 1640 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-204ENST00000483092 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-204ENST00000483092 GOLGA2Q08379 1002 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-204ENST00000483092 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-204ENST00000483092 SEC24BO95487 1268 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-204ENST00000483092 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-204ENST00000483092 NOS1P29475 1434 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-204ENST00000483092 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-204ENST00000483092 MORC1Q86VD1 984 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-204ENST00000483092 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-204ENST00000483092 MYH16Q9H6N6 1097 aa20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-204ENST00000483092 TRPM2O94759 1503 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-204ENST00000483092 MADDQ8WXG6 1647 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-204ENST00000483092 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-204ENST00000483092 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-204ENST00000483092 PTPRTO14522 1441 aa20.64■□□□□ 0.9
CCSAP-204ENST00000483092 BCAR3O75815 825 aa20.64■□□□□ 0.9
CCSAP-204ENST00000483092 CD109Q6YHK3 1445 aa20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-204ENST00000483092 COG6Q9Y2V7 657 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-204ENST00000483092 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-204ENST00000483092 CABP2Q9NPB3 220 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-204ENST00000483092 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-204ENST00000483092 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-204ENST00000483092 KDM2BQ8NHM5 1336 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-204ENST00000483092 RRP9O43818 475 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-204ENST00000483092 BCL2L13Q9BXK5 485 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-204ENST00000483092 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms