RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 DAPK1P53355 1430 aa13.22□□□□□ -0.29
CTPS1-208ENST00000479480 ERBINQ96RT1 1412 aa13.22□□□□□ -0.29
CTPS1-208ENST00000479480 APLP2Q06481 763 aa13.22□□□□□ -0.29
CTPS1-208ENST00000479480 POTEAQ6S8J7 498 aa13.22□□□□□ -0.29
CTPS1-208ENST00000479480 FAM135BQ49AJ0 1406 aa13.22□□□□□ -0.29
CTPS1-208ENST00000479480 KANK1Q14678 1352 aa13.21□□□□□ -0.29
CTPS1-208ENST00000479480 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
CTPS1-208ENST00000479480 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa13.2□□□□□ -0.3
CTPS1-208ENST00000479480 BCANQ96GW7 911 aa13.19□□□□□ -0.3
CTPS1-208ENST00000479480 PIK3C2BO00750 1634 aa13.19□□□□□ -0.3
CTPS1-208ENST00000479480 FGD6Q6ZV73 1430 aa13.19□□□□□ -0.3
CTPS1-208ENST00000479480 SYNMO15061 1565 aa13.19□□□□□ -0.3
CTPS1-208ENST00000479480 PTPN23Q9H3S7 1636 aa13.18□□□□□ -0.3
CTPS1-208ENST00000479480 SLC52A1Q9NWF4 448 aa13.18□□□□□ -0.3
CTPS1-208ENST00000479480 NOS1P29475 1434 aa13.18□□□□□ -0.3
CTPS1-208ENST00000479480 TET3O43151 1660 aa13.18□□□□□ -0.3
CTPS1-208ENST00000479480 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
CTPS1-208ENST00000479480 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
CTPS1-208ENST00000479480 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
CTPS1-208ENST00000479480 SLAIN2Q9P270 581 aa13.16□□□□□ -0.3
CTPS1-208ENST00000479480 EFCAB6Q5THR3 1501 aa13.16□□□□□ -0.3
CTPS1-208ENST00000479480 LMTK2Q8IWU2 1503 aa13.16□□□□□ -0.3
CTPS1-208ENST00000479480 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
CTPS1-208ENST00000479480 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CTPS1-208ENST00000479480 CROCC2H7BZ55 1655 aa13.12□□□□□ -0.31
CTPS1-208ENST00000479480 CHGAP10645 457 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CTPS1-208ENST00000479480 TBX22Q9Y458 520 aa13.11□□□□□ -0.31
CTPS1-208ENST00000479480 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CTPS1-208ENST00000479480 ZFYVE9O95405 1425 aa13.1□□□□□ -0.31
CTPS1-208ENST00000479480 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa13.1□□□□□ -0.31
CTPS1-208ENST00000479480 RIMS2Q9UQ26 1411 aa13.1□□□□□ -0.31
CTPS1-208ENST00000479480 MSH6P52701 1360 aa13.09□□□□□ -0.31
CTPS1-208ENST00000479480 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa13.09□□□□□ -0.31
CTPS1-208ENST00000479480 HDGFP51858 240 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CTPS1-208ENST00000479480 ADGRL2O95490 1459 aa13.09□□□□□ -0.31
CTPS1-208ENST00000479480 ADGRB3O60242 1522 aa13.08□□□□□ -0.31
CTPS1-208ENST00000479480 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa13.08□□□□□ -0.32
CTPS1-208ENST00000479480 JCADQ9P266 1359 aa13.07□□□□□ -0.32
CTPS1-208ENST00000479480 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
CTPS1-208ENST00000479480 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
CTPS1-208ENST00000479480 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP13.06□□□□□ -0.32
CTPS1-208ENST00000479480 C14orf37Q86TY3 774 aa13.05□□□□□ -0.32
CTPS1-208ENST00000479480 C19orf44Q9H6X5 657 aa13.05□□□□□ -0.32
CTPS1-208ENST00000479480 NWD1Q149M9 1564 aa13.05□□□□□ -0.32
CTPS1-208ENST00000479480 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa13.05□□□□□ -0.32
CTPS1-208ENST00000479480 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
CTPS1-208ENST00000479480 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa13.04□□□□□ -0.32
CTPS1-208ENST00000479480 ATF3P18847 181 aa13.02□□□□□ -0.33
CTPS1-208ENST00000479480 FKBP8Q14318 412 aa13.02□□□□□ -0.33
CTPS1-208ENST00000479480 PTPRUQ92729 1446 aa13.02□□□□□ -0.33
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa13.02□□□□□ -0.33
CTPS1-208ENST00000479480 ITGAEP38570 1179 aa13.01□□□□□ -0.33
CTPS1-208ENST00000479480 CADPS2Q86UW7 1296 aa13.01□□□□□ -0.33
CTPS1-208ENST00000479480 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa13.01□□□□□ -0.33
CTPS1-208ENST00000479480 LRP6O75581 1613 aa13□□□□□ -0.33
CTPS1-208ENST00000479480 BRINP3Q76B58 766 aa13□□□□□ -0.33
CTPS1-208ENST00000479480 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CTPS1-208ENST00000479480 TRIM52Q96A61 297 aa13□□□□□ -0.33
CTPS1-208ENST00000479480 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CTPS1-208ENST00000479480 NUP155O75694 1391 aa12.99□□□□□ -0.33
CTPS1-208ENST00000479480 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa12.99□□□□□ -0.33
CTPS1-208ENST00000479480 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
CTPS1-208ENST00000479480 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
CTPS1-208ENST00000479480 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CTPS1-208ENST00000479480 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
CTPS1-208ENST00000479480 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP12.99□□□□□ -0.33
CTPS1-208ENST00000479480 PHLPP1O60346 1717 aa12.99□□□□□ -0.33
CTPS1-208ENST00000479480 MYO5BQ9ULV0 1848 aa12.97□□□□□ -0.33
CTPS1-208ENST00000479480 PIK3R4Q99570 1358 aa12.97□□□□□ -0.33
CTPS1-208ENST00000479480 CAPN15O75808 1086 aa12.97□□□□□ -0.33
CTPS1-208ENST00000479480 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
CTPS1-208ENST00000479480 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
CTPS1-208ENST00000479480 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
CTPS1-208ENST00000479480 ROCK1Q13464 1354 aa12.96□□□□□ -0.33
CTPS1-208ENST00000479480 GCC2Q8IWJ2 1684 aa12.96□□□□□ -0.33
CTPS1-208ENST00000479480 RXRBP28702 533 aa12.95□□□□□ -0.34
CTPS1-208ENST00000479480 METP08581 1390 aa12.94□□□□□ -0.34
CTPS1-208ENST00000479480 E9PCH4 1651 aa12.94□□□□□ -0.34
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
CTPS1-208ENST00000479480 UNC13BO14795 1591 aa12.94□□□□□ -0.34
CTPS1-208ENST00000479480 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
CTPS1-208ENST00000479480 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
CTPS1-208ENST00000479480 POLA2Q14181 598 aa12.92□□□□□ -0.34
CTPS1-208ENST00000479480 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
CTPS1-208ENST00000479480 AFF2P51816 1311 aa12.91□□□□□ -0.34
CTPS1-208ENST00000479480 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
CTPS1-208ENST00000479480 MST1RQ04912 1400 aa12.9□□□□□ -0.34
CTPS1-208ENST00000479480 TRPM2O94759 1503 aa12.89□□□□□ -0.35
CTPS1-208ENST00000479480 IQGAP3Q86VI3 1631 aa12.89□□□□□ -0.35
CTPS1-208ENST00000479480 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
CTPS1-208ENST00000479480 DIP2AQ14689 1571 aa12.89□□□□□ -0.35
CTPS1-208ENST00000479480 SETD5Q9C0A6 1442 aa12.88□□□□□ -0.35
CTPS1-208ENST00000479480 C8orf37Q96NL8 207 aa12.88□□□□□ -0.35
CTPS1-208ENST00000479480 ORAI2Q96SN7 254 aa12.87□□□□□ -0.35
CTPS1-208ENST00000479480 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa12.87□□□□□ -0.35
CTPS1-208ENST00000479480 DCCP43146 1447 aa12.87□□□□□ -0.35
CTPS1-208ENST00000479480 ADAMTS2O95450 1211 aa12.86□□□□□ -0.35
CTPS1-208ENST00000479480 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa12.86□□□□□ -0.35
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