RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
ACTB-207ENST00000462494 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
ACTB-207ENST00000462494 PLIN1O60240 522 aa22.45■■□□□ 1.18
ACTB-207ENST00000462494 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.44■■□□□ 1.18
ACTB-207ENST00000462494 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.44■■□□□ 1.18
ACTB-207ENST00000462494 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.44■■□□□ 1.18
ACTB-207ENST00000462494 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.44■■□□□ 1.18
ACTB-207ENST00000462494 ASXL2Q76L83 1435 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-207ENST00000462494 SYNMO15061 1565 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-207ENST00000462494 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-207ENST00000462494 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.39■■□□□ 1.18
ACTB-207ENST00000462494 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.39■■□□□ 1.17
ACTB-207ENST00000462494 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
ACTB-207ENST00000462494 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
ACTB-207ENST00000462494 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
ACTB-207ENST00000462494 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-207ENST00000462494 MYOM1P52179 1685 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-207ENST00000462494 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-207ENST00000462494 CRBNQ96SW2 442 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-207ENST00000462494 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
ACTB-207ENST00000462494 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-207ENST00000462494 KIF1BO60333 1816 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-207ENST00000462494 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-207ENST00000462494 ABCA6Q8N139 1617 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-207ENST00000462494 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.33■■□□□ 1.17
ACTB-207ENST00000462494 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.17
ACTB-207ENST00000462494 MYOM2P54296 1465 aa22.33■■□□□ 1.17
ACTB-207ENST00000462494 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-207ENST00000462494 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-207ENST00000462494 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
ACTB-207ENST00000462494 PIK3C2GO75747 1445 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-207ENST00000462494 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
ACTB-207ENST00000462494 ERVK-7P63135 1459 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-207ENST00000462494 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-207ENST00000462494 SLC24A1O60721 1099 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-207ENST00000462494 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
ACTB-207ENST00000462494 GGT6Q6P531 493 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-207ENST00000462494 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-207ENST00000462494 GOLGA2Q08379 1002 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-207ENST00000462494 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-207ENST00000462494 MROH2AA6NES4 1674 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-207ENST00000462494 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-207ENST00000462494 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
ACTB-207ENST00000462494 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.27■■□□□ 1.16
ACTB-207ENST00000462494 NOS1P29475 1434 aa22.27■■□□□ 1.16
ACTB-207ENST00000462494 ZNF521Q96K83 1311 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-207ENST00000462494 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
ACTB-207ENST00000462494 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
ACTB-207ENST00000462494 IFT172Q9UG01 1749 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-207ENST00000462494 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-207ENST00000462494 CD109Q6YHK3 1445 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-207ENST00000462494 APAF1O14727 1248 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-207ENST00000462494 PDE4AP27815 886 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-207ENST00000462494 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
ACTB-207ENST00000462494 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-207ENST00000462494 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
ACTB-207ENST00000462494 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-207ENST00000462494 SLFN5Q08AF3 891 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTB-207ENST00000462494 SKAP1Q86WV1 359 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTB-207ENST00000462494 NPATQ14207 1427 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTB-207ENST00000462494 ADGRB3O60242 1522 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-207ENST00000462494 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-207ENST00000462494 MS4A1P11836 297 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-207ENST00000462494 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-207ENST00000462494 NBR1Q14596 966 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-207ENST00000462494 OSCARQ8IYS5 282 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-207ENST00000462494 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
ACTB-207ENST00000462494 BACH2Q9BYV9 841 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-207ENST00000462494 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
ACTB-207ENST00000462494 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
ACTB-207ENST00000462494 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ACTB-207ENST00000462494 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-207ENST00000462494 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-207ENST00000462494 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-207ENST00000462494 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ACTB-207ENST00000462494 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTB-207ENST00000462494 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTB-207ENST00000462494 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-207ENST00000462494 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-207ENST00000462494 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-207ENST00000462494 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-207ENST00000462494 MORC1Q86VD1 984 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-207ENST00000462494 RAPGEF3O95398 923 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-207ENST00000462494 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ACTB-207ENST00000462494 PPLO60437 1756 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-207ENST00000462494 E9PSI1 815 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-207ENST00000462494 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
ACTB-207ENST00000462494 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-207ENST00000462494 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-207ENST00000462494 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-207ENST00000462494 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-207ENST00000462494 ABCC3O15438 1527 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-207ENST00000462494 BCAR3O75815 825 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-207ENST00000462494 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ACTB-207ENST00000462494 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ACTB-207ENST00000462494 ADGRB1O14514 1584 aa22.08■■□□□ 1.12
ACTB-207ENST00000462494 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ACTB-207ENST00000462494 NEUROD2Q15784 382 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-207ENST00000462494 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
ACTB-207ENST00000462494 NGEFQ8N5V2 710 aa22.04■■□□□ 1.12
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