RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 ADAMTS8Q9UP79 889 aa27.18■■□□□ 1.94
IMP4-208ENST00000460766 PPP2R1AP30153 589 aa27.17■■□□□ 1.94
IMP4-208ENST00000460766 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
IMP4-208ENST00000460766 ASXL2Q76L83 1435 aa27.16■■□□□ 1.94
IMP4-208ENST00000460766 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP27.14■■□□□ 1.94
IMP4-208ENST00000460766 SYNMO15061 1565 aa27.14■■□□□ 1.94
IMP4-208ENST00000460766 CFAP70Q5T0N1 1121 aa27.13■■□□□ 1.93
IMP4-208ENST00000460766 UGGT1Q9NYU2 1555 aa27.13■■□□□ 1.93
IMP4-208ENST00000460766 MROH1Q8NDA8 1641 aa27.11■■□□□ 1.93
IMP4-208ENST00000460766 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.1■■□□□ 1.93
IMP4-208ENST00000460766 PLIN1O60240 522 aa27.1■■□□□ 1.93
IMP4-208ENST00000460766 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa27.09■■□□□ 1.93
IMP4-208ENST00000460766 NEURL4Q96JN8 1562 aa27.06■■□□□ 1.92
IMP4-208ENST00000460766 MYOM2P54296 1465 aa27.05■■□□□ 1.92
IMP4-208ENST00000460766 EFCAB6Q5THR3 1501 aa27.05■■□□□ 1.92
IMP4-208ENST00000460766 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa27.05■■□□□ 1.92
IMP4-208ENST00000460766 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.04■■□□□ 1.92
IMP4-208ENST00000460766 MYOM1P52179 1685 aa27.03■■□□□ 1.92
IMP4-208ENST00000460766 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.03■■□□□ 1.92
IMP4-208ENST00000460766 ABCA6Q8N139 1617 aa27.02■■□□□ 1.92
IMP4-208ENST00000460766 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.02■■□□□ 1.92
IMP4-208ENST00000460766 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.02■■□□□ 1.92
IMP4-208ENST00000460766 SLC24A1O60721 1099 aa27.01■■□□□ 1.92
IMP4-208ENST00000460766 CHGAP10645 457 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.92
IMP4-208ENST00000460766 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.92
IMP4-208ENST00000460766 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.01■■□□□ 1.91
IMP4-208ENST00000460766 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa27.01■■□□□ 1.91
IMP4-208ENST00000460766 PIK3C2GO75747 1445 aa27.01■■□□□ 1.91
IMP4-208ENST00000460766 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
IMP4-208ENST00000460766 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
IMP4-208ENST00000460766 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
IMP4-208ENST00000460766 ERVK-7P63135 1459 aa26.99■■□□□ 1.91
IMP4-208ENST00000460766 CRBNQ96SW2 442 aa26.99■■□□□ 1.91
IMP4-208ENST00000460766 KIF1BO60333 1816 aa26.97■■□□□ 1.91
IMP4-208ENST00000460766 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
IMP4-208ENST00000460766 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.95■■□□□ 1.91
IMP4-208ENST00000460766 GOLGA2Q08379 1002 aa26.95■■□□□ 1.9
IMP4-208ENST00000460766 GGT6Q6P531 493 aa26.95■■□□□ 1.9
IMP4-208ENST00000460766 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.95■■□□□ 1.9
IMP4-208ENST00000460766 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.94■■□□□ 1.9
IMP4-208ENST00000460766 NOS1P29475 1434 aa26.94■■□□□ 1.9
IMP4-208ENST00000460766 MROH2AA6NES4 1674 aa26.94■■□□□ 1.9
IMP4-208ENST00000460766 ZNF521Q96K83 1311 aa26.93■■□□□ 1.9
IMP4-208ENST00000460766 CARD14Q9BXL6 1004 aa26.93■■□□□ 1.9
IMP4-208ENST00000460766 C20orf194Q5TEA3 1177 aa26.92■■□□□ 1.9
IMP4-208ENST00000460766 CD109Q6YHK3 1445 aa26.92■■□□□ 1.9
IMP4-208ENST00000460766 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
IMP4-208ENST00000460766 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
IMP4-208ENST00000460766 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.91■■□□□ 1.9
IMP4-208ENST00000460766 IFT172Q9UG01 1749 aa26.9■■□□□ 1.9
IMP4-208ENST00000460766 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
IMP4-208ENST00000460766 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.89■■□□□ 1.9
IMP4-208ENST00000460766 ADGRB3O60242 1522 aa26.89■■□□□ 1.9
IMP4-208ENST00000460766 NPATQ14207 1427 aa26.89■■□□□ 1.9
IMP4-208ENST00000460766 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.89■■□□□ 1.89
IMP4-208ENST00000460766 APAF1O14727 1248 aa26.87■■□□□ 1.89
IMP4-208ENST00000460766 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.86■■□□□ 1.89
IMP4-208ENST00000460766 PDE4AP27815 886 aa26.85■■□□□ 1.89
IMP4-208ENST00000460766 SLFN5Q08AF3 891 aa26.85■■□□□ 1.89
IMP4-208ENST00000460766 OSCARQ8IYS5 282 aa26.85■■□□□ 1.89
IMP4-208ENST00000460766 MS4A1P11836 297 aa26.84■■□□□ 1.89
IMP4-208ENST00000460766 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
IMP4-208ENST00000460766 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.84■■□□□ 1.89
IMP4-208ENST00000460766 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.84■■□□□ 1.89
IMP4-208ENST00000460766 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
IMP4-208ENST00000460766 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
IMP4-208ENST00000460766 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.82■■□□□ 1.88
IMP4-208ENST00000460766 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.82■■□□□ 1.88
IMP4-208ENST00000460766 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.81■■□□□ 1.88
IMP4-208ENST00000460766 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
IMP4-208ENST00000460766 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.81■■□□□ 1.88
IMP4-208ENST00000460766 SKAP1Q86WV1 359 aa26.8■■□□□ 1.88
IMP4-208ENST00000460766 BACH2Q9BYV9 841 aa26.8■■□□□ 1.88
IMP4-208ENST00000460766 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.8■■□□□ 1.88
IMP4-208ENST00000460766 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
IMP4-208ENST00000460766 NSD3Q9BZ95 1437 aa26.77■■□□□ 1.88
IMP4-208ENST00000460766 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
IMP4-208ENST00000460766 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.77■■□□□ 1.88
IMP4-208ENST00000460766 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
IMP4-208ENST00000460766 RAPGEF3O95398 923 aa26.76■■□□□ 1.87
IMP4-208ENST00000460766 NBR1Q14596 966 aa26.76■■□□□ 1.87
IMP4-208ENST00000460766 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.76■■□□□ 1.87
IMP4-208ENST00000460766 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
IMP4-208ENST00000460766 MORC1Q86VD1 984 aa26.76■■□□□ 1.87
IMP4-208ENST00000460766 ABCC3O15438 1527 aa26.75■■□□□ 1.87
IMP4-208ENST00000460766 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
IMP4-208ENST00000460766 E9PSI1 815 aa26.74■■□□□ 1.87
IMP4-208ENST00000460766 ADGRB1O14514 1584 aa26.74■■□□□ 1.87
IMP4-208ENST00000460766 PPLO60437 1756 aa26.74■■□□□ 1.87
IMP4-208ENST00000460766 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
IMP4-208ENST00000460766 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
IMP4-208ENST00000460766 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.72■■□□□ 1.87
IMP4-208ENST00000460766 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
IMP4-208ENST00000460766 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.7■■□□□ 1.87
IMP4-208ENST00000460766 QRICH2Q9H0J4 1663 aa26.7■■□□□ 1.86
IMP4-208ENST00000460766 NGEFQ8N5V2 710 aa26.7■■□□□ 1.86
IMP4-208ENST00000460766 BCAR3O75815 825 aa26.69■■□□□ 1.86
IMP4-208ENST00000460766 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
IMP4-208ENST00000460766 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.65■■□□□ 1.86
IMP4-208ENST00000460766 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
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