RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 UBAP1LF5GYI3 381 aa35.87■■■■□ 3.33
SH3BP5-208ENST00000459627 BCANQ96GW7 911 aa35.87■■■■□ 3.33
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
SH3BP5-208ENST00000459627 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
SH3BP5-208ENST00000459627 FOXD1Q16676 465 aa35.8■■■■□ 3.32
SH3BP5-208ENST00000459627 CLTCL1P53675 1640 aa35.79■■■■□ 3.32
SH3BP5-208ENST00000459627 LRRC7Q96NW7 1537 aa35.78■■■■□ 3.32
SH3BP5-208ENST00000459627 TRPM2O94759 1503 aa35.76■■■■□ 3.31
SH3BP5-208ENST00000459627 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa35.75■■■■□ 3.31
SH3BP5-208ENST00000459627 HDGFP51858 240 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
SH3BP5-208ENST00000459627 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP35.72■■■■□ 3.31
SH3BP5-208ENST00000459627 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.72■■■■□ 3.31
SH3BP5-208ENST00000459627 PIP4K2BP78356 416 aa35.7■■■■□ 3.31
SH3BP5-208ENST00000459627 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
SH3BP5-208ENST00000459627 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
SH3BP5-208ENST00000459627 KCNA6P17658 529 aa35.66■■■■□ 3.3
SH3BP5-208ENST00000459627 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.66■■■■□ 3.3
SH3BP5-208ENST00000459627 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
SH3BP5-208ENST00000459627 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa35.63■■■■□ 3.29
SH3BP5-208ENST00000459627 KIF1BO60333 1816 aa35.62■■■■□ 3.29
SH3BP5-208ENST00000459627 ALKQ9UM73 1620 aa35.62■■■■□ 3.29
SH3BP5-208ENST00000459627 TOM1O60784 492 aa35.62■■■■□ 3.29
SH3BP5-208ENST00000459627 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.62■■■■□ 3.29
SH3BP5-208ENST00000459627 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
SH3BP5-208ENST00000459627 DISP3Q9P2K9 1392 aa35.59■■■■□ 3.29
SH3BP5-208ENST00000459627 TBX22Q9Y458 520 aa35.58■■■■□ 3.29
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM94Q12767 1356 aa35.58■■■■□ 3.29
SH3BP5-208ENST00000459627 NWD1Q149M9 1564 aa35.57■■■■□ 3.28
SH3BP5-208ENST00000459627 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa35.57■■■■□ 3.28
SH3BP5-208ENST00000459627 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
SH3BP5-208ENST00000459627 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa35.53■■■■□ 3.28
SH3BP5-208ENST00000459627 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP35.49■■■■□ 3.27
SH3BP5-208ENST00000459627 DIP2AQ14689 1571 aa35.49■■■■□ 3.27
SH3BP5-208ENST00000459627 HSPA1LP34931 641 aa35.47■■■■□ 3.27
SH3BP5-208ENST00000459627 PTPRUQ92729 1446 aa35.47■■■■□ 3.27
SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC144AA2RUR9 1427 aa35.46■■■■□ 3.27
SH3BP5-208ENST00000459627 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa35.46■■■■□ 3.27
SH3BP5-208ENST00000459627 RGL3Q3MIN7 710 aa35.43■■■■□ 3.26
SH3BP5-208ENST00000459627 ILDR2Q71H61 639 aa35.43■■■■□ 3.26
SH3BP5-208ENST00000459627 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa35.42■■■■□ 3.26
SH3BP5-208ENST00000459627 METP08581 1390 aa35.4■■■■□ 3.26
SH3BP5-208ENST00000459627 PIK3R4Q99570 1358 aa35.38■■■■□ 3.26
SH3BP5-208ENST00000459627 PPLO60437 1756 aa35.38■■■■□ 3.25
SH3BP5-208ENST00000459627 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa35.35■■■■□ 3.25
SH3BP5-208ENST00000459627 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
SH3BP5-208ENST00000459627 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa35.35■■■■□ 3.25
SH3BP5-208ENST00000459627 VGFO15240 615 aaPredicted RBP35.35■■■■□ 3.25
SH3BP5-208ENST00000459627 C14orf37Q86TY3 774 aa35.33■■■■□ 3.25
SH3BP5-208ENST00000459627 MSH6P52701 1360 aa35.33■■■■□ 3.25
SH3BP5-208ENST00000459627 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
SH3BP5-208ENST00000459627 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa35.3■■■■□ 3.24
SH3BP5-208ENST00000459627 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.24
SH3BP5-208ENST00000459627 IFT172Q9UG01 1749 aa35.23■■■■□ 3.23
SH3BP5-208ENST00000459627 HRCP23327 699 aa35.23■■■■□ 3.23
SH3BP5-208ENST00000459627 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP35.21■■■■□ 3.23
SH3BP5-208ENST00000459627 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa35.21■■■■□ 3.23
SH3BP5-208ENST00000459627 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa35.21■■■■□ 3.23
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM135BQ49AJ0 1406 aa35.19■■■■□ 3.22
SH3BP5-208ENST00000459627 SLAIN2Q9P270 581 aa35.19■■■■□ 3.22
SH3BP5-208ENST00000459627 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa35.19■■■■□ 3.22
SH3BP5-208ENST00000459627 C19orf44Q9H6X5 657 aa35.16■■■■□ 3.22
SH3BP5-208ENST00000459627 ATF3P18847 181 aa35.13■■■■□ 3.21
SH3BP5-208ENST00000459627 SOCS7O14512 581 aa35.12■■■■□ 3.21
SH3BP5-208ENST00000459627 ROBO2Q9HCK4 1378 aa35.12■■■■□ 3.21
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM132EQ6IEE7 984 aa35.09■■■■□ 3.21
SH3BP5-208ENST00000459627 CADPS2Q86UW7 1296 aa35.09■■■■□ 3.21
SH3BP5-208ENST00000459627 STK26Q9P289 416 aa35.08■■■■□ 3.21
SH3BP5-208ENST00000459627 PIK3C2GO75747 1445 aa35.07■■■■□ 3.21
SH3BP5-208ENST00000459627 NALCNQ8IZF0 1738 aa35.06■■■■□ 3.2
SH3BP5-208ENST00000459627 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa35.06■■■■□ 3.2
SH3BP5-208ENST00000459627 PTCH1Q13635 1447 aa35.04■■■■□ 3.2
SH3BP5-208ENST00000459627 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa35.04■■■■□ 3.2
SH3BP5-208ENST00000459627 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
SH3BP5-208ENST00000459627 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa35.02■■■■□ 3.2
SH3BP5-208ENST00000459627 CFAP70Q5T0N1 1121 aa35.01■■■■□ 3.2
SH3BP5-208ENST00000459627 MYOM2P54296 1465 aa34.99■■■■□ 3.19
SH3BP5-208ENST00000459627 PHLPP1O60346 1717 aa34.99■■■■□ 3.19
SH3BP5-208ENST00000459627 DCCP43146 1447 aa34.98■■■■□ 3.19
SH3BP5-208ENST00000459627 NRXN1Q9ULB1 1477 aa34.98■■■■□ 3.19
SH3BP5-208ENST00000459627 MST1RQ04912 1400 aa34.98■■■■□ 3.19
SH3BP5-208ENST00000459627 WAPLQ7Z5K2 1190 aa34.96■■■■□ 3.19
SH3BP5-208ENST00000459627 DCAF11Q8TEB1 546 aa34.96■■■■□ 3.19
SH3BP5-208ENST00000459627 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
SH3BP5-208ENST00000459627 BRINP3Q76B58 766 aa34.95■■■■□ 3.19
SH3BP5-208ENST00000459627 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP34.95■■■■□ 3.19
SH3BP5-208ENST00000459627 PRAG1Q86YV5 1406 aa34.95■■■■□ 3.19
SH3BP5-208ENST00000459627 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
SH3BP5-208ENST00000459627 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa34.92■■■■□ 3.18
SH3BP5-208ENST00000459627 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP34.91■■■■□ 3.18
SH3BP5-208ENST00000459627 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP34.88■■■■□ 3.17
SH3BP5-208ENST00000459627 ABCC11Q96J66 1382 aa34.87■■■■□ 3.17
SH3BP5-208ENST00000459627 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP34.87■■■■□ 3.17
SH3BP5-208ENST00000459627 TECPR2O15040 1411 aa34.87■■■■□ 3.17
SH3BP5-208ENST00000459627 KNDC1Q76NI1 1749 aa34.86■■■■□ 3.17
SH3BP5-208ENST00000459627 LAMC1P11047 1609 aa34.84■■■■□ 3.17
SH3BP5-208ENST00000459627 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP34.84■■■■□ 3.17
SH3BP5-208ENST00000459627 C1orf167Q5SNV9 1468 aa34.84■■■■□ 3.17
SH3BP5-208ENST00000459627 ORAI2Q96SN7 254 aa34.81■■■■□ 3.16
SH3BP5-208ENST00000459627 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP34.81■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms