RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445369.2

CLDN9-201, Transcript of claudin 9, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN9, Length 2,050 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9-201ENST00000445369 MYOM1P52179 1685 aa23.99■■□□□ 1.43
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CLDN9-201ENST00000445369 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
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CLDN9-201ENST00000445369 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.97■■□□□ 1.43
CLDN9-201ENST00000445369 CD109Q6YHK3 1445 aa23.96■■□□□ 1.43
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CLDN9-201ENST00000445369 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.43
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CLDN9-201ENST00000445369 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.89■■□□□ 1.42
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CLDN9-201ENST00000445369 PDE3BQ13370 1112 aa23.87■■□□□ 1.41
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CLDN9-201ENST00000445369 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
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CLDN9-201ENST00000445369 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.85■■□□□ 1.41
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CLDN9-201ENST00000445369 ERVK-7P63135 1459 aa23.84■■□□□ 1.41
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CLDN9-201ENST00000445369 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.78■■□□□ 1.4
CLDN9-201ENST00000445369 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.77■■□□□ 1.4
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CLDN9-201ENST00000445369 RICTORQ6R327 1708 aa23.77■■□□□ 1.4
CLDN9-201ENST00000445369 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.76■■□□□ 1.39
CLDN9-201ENST00000445369 PIK3C2BO00750 1634 aa23.75■■□□□ 1.39
CLDN9-201ENST00000445369 GGT6Q6P531 493 aa23.75■■□□□ 1.39
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CLDN9-201ENST00000445369 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.74■■□□□ 1.39
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CLDN9-201ENST00000445369 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.68■■□□□ 1.38
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CLDN9-201ENST00000445369 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.65■■□□□ 1.38
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CLDN9-201ENST00000445369 MSH5O43196 834 aa23.64■■□□□ 1.37
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CLDN9-201ENST00000445369 GLI2P10070 1586 aa23.63■■□□□ 1.37
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CLDN9-201ENST00000445369 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
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CLDN9-201ENST00000445369 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.59■■□□□ 1.37
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CLDN9-201ENST00000445369 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.54■■□□□ 1.36
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CLDN9-201ENST00000445369 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CLDN9-201ENST00000445369 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.52■■□□□ 1.36
CLDN9-201ENST00000445369 SHPRHQ149N8 1683 aa23.52■■□□□ 1.36
CLDN9-201ENST00000445369 GOLGA2Q08379 1002 aa23.52■■□□□ 1.35
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CLDN9-201ENST00000445369 PLIN1O60240 522 aa23.5■■□□□ 1.35
CLDN9-201ENST00000445369 DIP2BQ9P265 1576 aa23.5■■□□□ 1.35
CLDN9-201ENST00000445369 IDI1Q13907 227 aa23.48■■□□□ 1.35
CLDN9-201ENST00000445369 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.48■■□□□ 1.35
CLDN9-201ENST00000445369 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CLDN9-201ENST00000445369 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.48■■□□□ 1.35
CLDN9-201ENST00000445369 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.48■■□□□ 1.35
CLDN9-201ENST00000445369 SLFN5Q08AF3 891 aa23.47■■□□□ 1.35
CLDN9-201ENST00000445369 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CLDN9-201ENST00000445369 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
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