RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442166.2

PCOLCE-AS1-201, PCOLCE antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PCOLCE-AS1, Length 2,537 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 MYOM2P54296 1465 aa25.41■■□□□ 1.66
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.41■■□□□ 1.66
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 NOS1P29475 1434 aa25.37■■□□□ 1.65
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 FKBP8Q14318 412 aa25.36■■□□□ 1.65
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 PANK3Q9H999 370 aa25.34■■□□□ 1.65
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 PPLO60437 1756 aa25.34■■□□□ 1.65
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.34■■□□□ 1.65
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 SYNMO15061 1565 aa25.33■■□□□ 1.65
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.33■■□□□ 1.65
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 RALBP1Q15311 655 aa25.32■■□□□ 1.64
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 TMC1Q8TDI8 760 aa25.32■■□□□ 1.64
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.31■■□□□ 1.64
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.3■■□□□ 1.64
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 BCANQ96GW7 911 aa25.3■■□□□ 1.64
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 PIK3C2BO00750 1634 aa25.29■■□□□ 1.64
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.27■■□□□ 1.64
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.26■■□□□ 1.63
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.26■■□□□ 1.63
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 PIK3C2GO75747 1445 aa25.25■■□□□ 1.63
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 NEFLP07196 543 aa25.24■■□□□ 1.63
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 MYOM1P52179 1685 aa25.23■■□□□ 1.63
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 IDI1Q13907 227 aa25.22■■□□□ 1.63
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.22■■□□□ 1.63
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.21■■□□□ 1.63
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 NLRP13Q86W25 1043 aa25.2■■□□□ 1.62
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.2■■□□□ 1.62
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ERVK-7P63135 1459 aa25.19■■□□□ 1.62
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CDCA8Q53HL2 280 aa25.19■■□□□ 1.62
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.19■■□□□ 1.62
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.19■■□□□ 1.62
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.18■■□□□ 1.62
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ADGRB1O14514 1584 aa25.18■■□□□ 1.62
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.17■■□□□ 1.62
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.17■■□□□ 1.62
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 KNSTRNQ9Y448 316 aa25.13■■□□□ 1.61
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.13■■□□□ 1.61
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 REREQ9P2R6 1566 aa25.12■■□□□ 1.61
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 MYT1Q01538 1121 aa25.11■■□□□ 1.61
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.11■■□□□ 1.61
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 AGLP35573 1532 aa25.1■■□□□ 1.61
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 QRICH2Q9H0J4 1663 aa25.1■■□□□ 1.61
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 MLECQ14165 292 aa25.09■■□□□ 1.61
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.09■■□□□ 1.61
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.06■■□□□ 1.6
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.04■■□□□ 1.6
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 SLC24A1O60721 1099 aa25.04■■□□□ 1.6
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.02■■□□□ 1.6
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 PPP2R1AP30153 589 aa25.01■■□□□ 1.59
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ZFYVE9O95405 1425 aa25.01■■□□□ 1.59
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 NUDCQ9Y266 331 aa24.99■■□□□ 1.59
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.97■■□□□ 1.59
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.95■■□□□ 1.58
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.95■■□□□ 1.58
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 STK26Q9P289 416 aa24.95■■□□□ 1.58
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.95■■□□□ 1.58
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.94■■□□□ 1.58
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.94■■□□□ 1.58
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.93■■□□□ 1.58
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.91■■□□□ 1.58
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.89■■□□□ 1.58
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.88■■□□□ 1.57
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ALKQ9UM73 1620 aa24.87■■□□□ 1.57
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 EVC2Q86UK5 1308 aa24.86■■□□□ 1.57
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ZMYM3Q14202 1370 aa24.86■■□□□ 1.57
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 PTPRMP28827 1452 aa24.86■■□□□ 1.57
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CABP2Q9NPB3 220 aa24.85■■□□□ 1.57
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 INSRP06213 1382 aa24.85■■□□□ 1.57
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.83■■□□□ 1.57
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.82■■□□□ 1.56
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 PRAM1Q96QH2 718 aa24.82■■□□□ 1.56
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.82■■□□□ 1.56
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.81■■□□□ 1.56
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.81■■□□□ 1.56
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.8 ms