RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424161.5

TTC28-AS1-204, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 556 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-204ENST00000424161 IFT172Q9UG01 1749 aa19.4■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-204ENST00000424161 STAC3Q96MF2 364 aa19.4■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RIMS2Q9UQ26 1411 aa19.4■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PPLO60437 1756 aa19.39■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-204ENST00000424161 L3MBTL2Q969R5 705 aa19.39■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-204ENST00000424161 HDGFP51858 240 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MYOM2P54296 1465 aa19.38■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP19.38■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-204ENST00000424161 DCAF11Q8TEB1 546 aa19.36■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-204ENST00000424161 EID1Q9Y6B2 187 aa19.35■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-204ENST00000424161 VGFO15240 615 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-204ENST00000424161 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ANKLE2Q86XL3 938 aa19.33■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TXNDC2Q86VQ3 553 aa19.32■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NRXN1Q9ULB1 1477 aa19.32■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-204ENST00000424161 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-204ENST00000424161 LTKP29376 864 aa19.31■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-204ENST00000424161 HSPA2P54652 639 aa19.3■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-204ENST00000424161 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa19.3■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa19.3■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MED14O60244 1454 aa19.28■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa19.28■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PIK3C2GO75747 1445 aa19.28■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PRAG1Q86YV5 1406 aa19.28■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa19.27■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa19.25■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-204ENST00000424161 LAMC1P11047 1609 aa19.24■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa19.24■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-204ENST00000424161 STRCQ7RTU9 1775 aa19.24■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-204ENST00000424161 IQGAP1P46940 1657 aa19.23■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-204ENST00000424161 DIP2AQ14689 1571 aa19.23■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-204ENST00000424161 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa19.22■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NBPF8Q3BBV2 869 aa19.21■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa19.21■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ALKQ9UM73 1620 aa19.21■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-204ENST00000424161 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa19.2■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-204ENST00000424161 BCANQ96GW7 911 aa19.19■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RALGAPBQ86X10 1494 aa19.19■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TBX22Q9Y458 520 aa19.18■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CFAP70Q5T0N1 1121 aa19.17■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-204ENST00000424161 DMRT2Q9Y5R5 561 aa19.16■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SLC26A8Q96RN1 970 aa19.15■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PIK3R4Q99570 1358 aa19.15■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-204ENST00000424161 GPRASP1Q5JY77 1395 aa19.14■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa19.14■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ADGRB1O14514 1584 aa19.14■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-204ENST00000424161 METP08581 1390 aa19.11■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NBPF1Q3BBV0 1214 aa19.11■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TMEM132EQ6IEE7 984 aa19.08■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-204ENST00000424161 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-204ENST00000424161 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CARD11Q9BXL7 1154 aa19.07■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PTPRUQ92729 1446 aa19.07■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NWD1Q149M9 1564 aa19.06■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TECPR2O15040 1411 aa19.06■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ABCC11Q96J66 1382 aa19.06■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-204ENST00000424161 KNDC1Q76NI1 1749 aa19.05■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-204ENST00000424161 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CPS1P31327 1500 aa19.04■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-204ENST00000424161 DLC1Q96QB1 1528 aa19.04■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-204ENST00000424161 KCNA6P17658 529 aa19.03■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PTCH1Q13635 1447 aa19.02■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-204ENST00000424161 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa19.02■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.63
TTC28-AS1-204ENST00000424161 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SIRT1Q96EB6 747 aa19■□□□□ 0.63
TTC28-AS1-204ENST00000424161 STK26Q9P289 416 aa19■□□□□ 0.63
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TRAK1Q9UPV9 953 aa19■□□□□ 0.63
TTC28-AS1-204ENST00000424161 USP47Q96K76 1375 aa19■□□□□ 0.63
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FAM135BQ49AJ0 1406 aa19■□□□□ 0.63
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ROBO2Q9HCK4 1378 aa18.97■□□□□ 0.63
TTC28-AS1-204ENST00000424161 STRCP1A6NGW2 1772 aa18.97■□□□□ 0.63
TTC28-AS1-204ENST00000424161 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP18.96■□□□□ 0.638e-7■■■■■ 28.7
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PRAM1Q96QH2 718 aa18.94■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-204ENST00000424161 POGKQ9P215 609 aa18.92■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa18.92■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa18.91■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa18.91■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-204ENST00000424161 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-204ENST00000424161 WAPLQ7Z5K2 1190 aa18.91■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-204ENST00000424161 LTBP4Q8N2S1 1624 aa18.91■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-204ENST00000424161 QRICH2Q9H0J4 1663 aa18.91■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa18.91■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-204ENST00000424161 LRRC7Q96NW7 1537 aa18.9■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SLC24A1O60721 1099 aa18.88■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ADGRB2O60241 1585 aa18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10 ms