RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394177.3

ZNF394-202, Transcript of zinc finger protein 394, humanhuman

TSL 5

Gene ZNF394, Length 542 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394-202ENST00000394177 ZFYVE9O95405 1425 aa28.82■■■□□ 2.2
ZNF394-202ENST00000394177 STAC3Q96MF2 364 aa28.81■■■□□ 2.2
ZNF394-202ENST00000394177 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.8■■■□□ 2.2
ZNF394-202ENST00000394177 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
ZNF394-202ENST00000394177 MED14O60244 1454 aa28.79■■■□□ 2.2
ZNF394-202ENST00000394177 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
ZNF394-202ENST00000394177 LTKP29376 864 aa28.79■■■□□ 2.2
ZNF394-202ENST00000394177 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.78■■■□□ 2.2
ZNF394-202ENST00000394177 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
ZNF394-202ENST00000394177 STRCQ7RTU9 1775 aa28.76■■■□□ 2.19
ZNF394-202ENST00000394177 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.75■■■□□ 2.19
ZNF394-202ENST00000394177 RGL3Q3MIN7 710 aa28.73■■■□□ 2.19
ZNF394-202ENST00000394177 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
ZNF394-202ENST00000394177 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
ZNF394-202ENST00000394177 CERKQ8TCT0 537 aa28.71■■■□□ 2.19
ZNF394-202ENST00000394177 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.71■■■□□ 2.19
ZNF394-202ENST00000394177 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.19
ZNF394-202ENST00000394177 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.7■■■□□ 2.19
ZNF394-202ENST00000394177 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.68■■■□□ 2.18
ZNF394-202ENST00000394177 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
ZNF394-202ENST00000394177 PPLO60437 1756 aa28.64■■■□□ 2.18
ZNF394-202ENST00000394177 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.62■■■□□ 2.17
ZNF394-202ENST00000394177 NEUROD1Q13562 356 aa28.62■■■□□ 2.17
ZNF394-202ENST00000394177 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.62■■■□□ 2.17
ZNF394-202ENST00000394177 TBX22Q9Y458 520 aa28.62■■■□□ 2.17
ZNF394-202ENST00000394177 IQGAP1P46940 1657 aa28.61■■■□□ 2.17
ZNF394-202ENST00000394177 MYOM2P54296 1465 aa28.6■■■□□ 2.17
ZNF394-202ENST00000394177 SOCS7O14512 581 aa28.6■■■□□ 2.17
ZNF394-202ENST00000394177 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
ZNF394-202ENST00000394177 ILDR2Q71H61 639 aa28.59■■■□□ 2.17
ZNF394-202ENST00000394177 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.59■■■□□ 2.17
ZNF394-202ENST00000394177 IFT172Q9UG01 1749 aa28.59■■■□□ 2.17
ZNF394-202ENST00000394177 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.58■■■□□ 2.17
ZNF394-202ENST00000394177 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.57■■■□□ 2.16
ZNF394-202ENST00000394177 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.56■■■□□ 2.16
ZNF394-202ENST00000394177 BCANQ96GW7 911 aa28.56■■■□□ 2.16
ZNF394-202ENST00000394177 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.55■■■□□ 2.16
ZNF394-202ENST00000394177 DIP2AQ14689 1571 aa28.54■■■□□ 2.16
ZNF394-202ENST00000394177 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.54■■■□□ 2.16
ZNF394-202ENST00000394177 PIK3R4Q99570 1358 aa28.53■■■□□ 2.16
ZNF394-202ENST00000394177 TONSLQ96HA7 1378 aa28.52■■■□□ 2.16
ZNF394-202ENST00000394177 PIK3C2GO75747 1445 aa28.52■■■□□ 2.16
ZNF394-202ENST00000394177 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.51■■■□□ 2.15
ZNF394-202ENST00000394177 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.5■■■□□ 2.15
ZNF394-202ENST00000394177 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
ZNF394-202ENST00000394177 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.47■■■□□ 2.15
ZNF394-202ENST00000394177 KCNA6P17658 529 aa28.45■■■□□ 2.14
ZNF394-202ENST00000394177 ALKQ9UM73 1620 aa28.44■■■□□ 2.14
ZNF394-202ENST00000394177 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.42■■■□□ 2.14
ZNF394-202ENST00000394177 LAMC1P11047 1609 aa28.4■■■□□ 2.14
ZNF394-202ENST00000394177 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.13
ZNF394-202ENST00000394177 METP08581 1390 aa28.38■■■□□ 2.13
ZNF394-202ENST00000394177 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.38■■■□□ 2.13
ZNF394-202ENST00000394177 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
ZNF394-202ENST00000394177 CPS1P31327 1500 aa28.36■■■□□ 2.13
ZNF394-202ENST00000394177 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
ZNF394-202ENST00000394177 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
ZNF394-202ENST00000394177 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa28.35■■■□□ 2.13
ZNF394-202ENST00000394177 NWD1Q149M9 1564 aa28.34■■■□□ 2.13
ZNF394-202ENST00000394177 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.34■■■□□ 2.13
ZNF394-202ENST00000394177 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.33■■■□□ 2.13
ZNF394-202ENST00000394177 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
ZNF394-202ENST00000394177 SIRT1Q96EB6 747 aa28.31■■■□□ 2.12
ZNF394-202ENST00000394177 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
ZNF394-202ENST00000394177 ABCC11Q96J66 1382 aa28.31■■■□□ 2.12
ZNF394-202ENST00000394177 PTPRUQ92729 1446 aa28.31■■■□□ 2.12
ZNF394-202ENST00000394177 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.28■■■□□ 2.12
ZNF394-202ENST00000394177 TECPR2O15040 1411 aa28.27■■■□□ 2.12
ZNF394-202ENST00000394177 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.27■■■□□ 2.12
ZNF394-202ENST00000394177 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.27■■■□□ 2.12
ZNF394-202ENST00000394177 ADGRB1O14514 1584 aa28.27■■■□□ 2.12
ZNF394-202ENST00000394177 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.12
ZNF394-202ENST00000394177 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
ZNF394-202ENST00000394177 PTCH1Q13635 1447 aa28.25■■■□□ 2.11
ZNF394-202ENST00000394177 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.24■■■□□ 2.11
ZNF394-202ENST00000394177 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.24■■■□□ 2.11
ZNF394-202ENST00000394177 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
ZNF394-202ENST00000394177 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.23■■■□□ 2.11
ZNF394-202ENST00000394177 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.22■■■□□ 2.11
ZNF394-202ENST00000394177 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.22■■■□□ 2.11
ZNF394-202ENST00000394177 NBPF1Q3BBV0 1214 aa28.21■■■□□ 2.11
ZNF394-202ENST00000394177 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.2■■■□□ 2.11
ZNF394-202ENST00000394177 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.2■■■□□ 2.1
ZNF394-202ENST00000394177 DLC1Q96QB1 1528 aa28.19■■■□□ 2.1
ZNF394-202ENST00000394177 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
ZNF394-202ENST00000394177 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.18■■■□□ 2.1
ZNF394-202ENST00000394177 STK26Q9P289 416 aa28.17■■■□□ 2.1
ZNF394-202ENST00000394177 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.17■■■□□ 2.1
ZNF394-202ENST00000394177 TMEM94Q12767 1356 aa28.16■■■□□ 2.1
ZNF394-202ENST00000394177 ROBO2Q9HCK4 1378 aa28.16■■■□□ 2.1
ZNF394-202ENST00000394177 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.12■■■□□ 2.09
ZNF394-202ENST00000394177 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.12■■■□□ 2.09
ZNF394-202ENST00000394177 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.1■■■□□ 2.09
ZNF394-202ENST00000394177 POGKQ9P215 609 aa28.07■■■□□ 2.08
ZNF394-202ENST00000394177 PRAM1Q96QH2 718 aa28.06■■■□□ 2.08
ZNF394-202ENST00000394177 MSH6P52701 1360 aa28.06■■■□□ 2.08
ZNF394-202ENST00000394177 DCCP43146 1447 aa28.06■■■□□ 2.08
ZNF394-202ENST00000394177 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
ZNF394-202ENST00000394177 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
ZNF394-202ENST00000394177 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms