RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 PRDM2Q13029 1718 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP4-202ENST00000392011 MIA2Q96PC5 1412 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP4-202ENST00000392011 MTHFSP49914 203 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP4-202ENST00000392011 PRXQ9BXM0 1461 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP4-202ENST00000392011 NESP48681 1621 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP4-202ENST00000392011 PANK1Q8TE04 598 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP4-202ENST00000392011 GRIN2BQ13224 1484 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP4-202ENST00000392011 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
SH3BP4-202ENST00000392011 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
SH3BP4-202ENST00000392011 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
SH3BP4-202ENST00000392011 KIF16BQ96L93 1317 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP4-202ENST00000392011 USP35Q9P2H5 1018 aa21.27■■□□□ 1
SH3BP4-202ENST00000392011 TOMM22Q9NS69 142 aa21.27■■□□□ 1
SH3BP4-202ENST00000392011 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.27■□□□□ 0.99
SH3BP4-202ENST00000392011 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
SH3BP4-202ENST00000392011 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
SH3BP4-202ENST00000392011 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
SH3BP4-202ENST00000392011 LNPKQ9C0E8 428 aa21.25■□□□□ 0.99
SH3BP4-202ENST00000392011 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
SH3BP4-202ENST00000392011 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.25■□□□□ 0.99
SH3BP4-202ENST00000392011 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
SH3BP4-202ENST00000392011 PSME1Q06323 249 aa21.24■□□□□ 0.99
SH3BP4-202ENST00000392011 PPP2R1AP30153 589 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP4-202ENST00000392011 GNAI1P63096 354 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP4-202ENST00000392011 ARID3AQ99856 593 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP4-202ENST00000392011 DDX11L8A8MPP1 907 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP4-202ENST00000392011 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
SH3BP4-202ENST00000392011 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP21.22■□□□□ 0.99
SH3BP4-202ENST00000392011 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
SH3BP4-202ENST00000392011 NEXNQ0ZGT2 675 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP4-202ENST00000392011 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP4-202ENST00000392011 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP4-202ENST00000392011 NUTM2GQ5VZR2 741 aa21.2■□□□□ 0.98
SH3BP4-202ENST00000392011 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.2■□□□□ 0.98
SH3BP4-202ENST00000392011 TTC5Q8N0Z6 440 aa21.2■□□□□ 0.98
SH3BP4-202ENST00000392011 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.2■□□□□ 0.98
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.2■□□□□ 0.98
SH3BP4-202ENST00000392011 GSE1Q14687 1217 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP4-202ENST00000392011 CLSTN1O94985 981 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP4-202ENST00000392011 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
SH3BP4-202ENST00000392011 REC8O95072 547 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP4-202ENST00000392011 EVA1CP58658 441 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP4-202ENST00000392011 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC184Q52MB2 194 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP4-202ENST00000392011 SYNJ2O15056 1496 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP4-202ENST00000392011 KIF3AQ9Y496 699 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP4-202ENST00000392011 HFM1A2PYH4 1435 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP4-202ENST00000392011 ANO2Q9NQ90 1003 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP4-202ENST00000392011 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
SH3BP4-202ENST00000392011 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP4-202ENST00000392011 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP4-202ENST00000392011 NLRP6P59044 892 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP4-202ENST00000392011 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
SH3BP4-202ENST00000392011 H3BQV1 296 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BP4-202ENST00000392011 IFFO2Q5TF58 517 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BP4-202ENST00000392011 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
SH3BP4-202ENST00000392011 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
SH3BP4-202ENST00000392011 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC34Q96HJ3 373 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BP4-202ENST00000392011 TOPBP1Q92547 1522 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BP4-202ENST00000392011 TPM4P67936 248 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM184AQ8NB25 1140 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BP4-202ENST00000392011 PHF14O94880 888 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BP4-202ENST00000392011 RASSF8Q8NHQ8 419 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BP4-202ENST00000392011 PRAM1Q96QH2 718 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BP4-202ENST00000392011 PRKAR2BP31323 418 aa21.11■□□□□ 0.97
SH3BP4-202ENST00000392011 RUFY2Q8WXA3 655 aa21.11■□□□□ 0.97
SH3BP4-202ENST00000392011 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
SH3BP4-202ENST00000392011 TOP2BQ02880 1626 aa21.11■□□□□ 0.97
SH3BP4-202ENST00000392011 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
SH3BP4-202ENST00000392011 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
SH3BP4-202ENST00000392011 CREBRFQ8IUR6 639 aa21.1■□□□□ 0.97
SH3BP4-202ENST00000392011 C22orf23Q9BZE7 217 aa21.1■□□□□ 0.97
SH3BP4-202ENST00000392011 CHMP5Q9NZZ3 219 aa21.1■□□□□ 0.97
SH3BP4-202ENST00000392011 DDX58O95786 925 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
SH3BP4-202ENST00000392011 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP4-202ENST00000392011 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP4-202ENST00000392011 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP4-202ENST00000392011 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP21.08■□□□□ 0.973e-6■■□□□ 13
SH3BP4-202ENST00000392011 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
SH3BP4-202ENST00000392011 ROCK1Q13464 1354 aa21.08■□□□□ 0.97
SH3BP4-202ENST00000392011 BCAR3O75815 825 aa21.08■□□□□ 0.96
SH3BP4-202ENST00000392011 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
SH3BP4-202ENST00000392011 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa21.08■□□□□ 0.96
SH3BP4-202ENST00000392011 G3V3G9 751 aa21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4-202ENST00000392011 DCAF8Q5TAQ9 597 aa21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4-202ENST00000392011 MCTP1Q6DN14 999 aa21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4-202ENST00000392011 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4-202ENST00000392011 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4-202ENST00000392011 AKNAQ7Z591 1439 aa21.06■□□□□ 0.96
SH3BP4-202ENST00000392011 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.06■□□□□ 0.96
SH3BP4-202ENST00000392011 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.06■□□□□ 0.96
SH3BP4-202ENST00000392011 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
SH3BP4-202ENST00000392011 TIAM1Q13009 1591 aa21.06■□□□□ 0.96
SH3BP4-202ENST00000392011 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.05■□□□□ 0.96
SH3BP4-202ENST00000392011 AAMPQ13685 434 aa21.05■□□□□ 0.96
SH3BP4-202ENST00000392011 CABP1Q9NZU7 370 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP4-202ENST00000392011 RAPGEF3O95398 923 aa21.03■□□□□ 0.96
SH3BP4-202ENST00000392011 DAPK1P53355 1430 aa21.02■□□□□ 0.96
SH3BP4-202ENST00000392011 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.02■□□□□ 0.96
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