RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376180.7

ITGBL1-202, Transcript of integrin subunit beta like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGBL1, Length 2,494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGBL1-202ENST00000376180 PPP2R1AP30153 589 aa25.47■■□□□ 1.67
ITGBL1-202ENST00000376180 KNSTRNQ9Y448 316 aa25.46■■□□□ 1.67
ITGBL1-202ENST00000376180 CLTCL1P53675 1640 aa25.45■■□□□ 1.67
ITGBL1-202ENST00000376180 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
ITGBL1-202ENST00000376180 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
ITGBL1-202ENST00000376180 AFAP1Q8N556 730 aa25.44■■□□□ 1.66
ITGBL1-202ENST00000376180 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.44■■□□□ 1.66
ITGBL1-202ENST00000376180 SYNMO15061 1565 aa25.43■■□□□ 1.66
ITGBL1-202ENST00000376180 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
ITGBL1-202ENST00000376180 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.43■■□□□ 1.66
ITGBL1-202ENST00000376180 PTPRTO14522 1441 aa25.42■■□□□ 1.66
ITGBL1-202ENST00000376180 C20orf194Q5TEA3 1177 aa25.42■■□□□ 1.66
ITGBL1-202ENST00000376180 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.41■■□□□ 1.66
ITGBL1-202ENST00000376180 SKAP1Q86WV1 359 aa25.41■■□□□ 1.66
ITGBL1-202ENST00000376180 MYOM1P52179 1685 aa25.4■■□□□ 1.66
ITGBL1-202ENST00000376180 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.4■■□□□ 1.66
ITGBL1-202ENST00000376180 DEPDC5O75140 1603 aa25.4■■□□□ 1.66
ITGBL1-202ENST00000376180 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.39■■□□□ 1.66
ITGBL1-202ENST00000376180 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.66
ITGBL1-202ENST00000376180 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.38■■□□□ 1.65
ITGBL1-202ENST00000376180 DDRGK1Q96HY6 314 aa25.38■■□□□ 1.65
ITGBL1-202ENST00000376180 TET3O43151 1660 aa25.37■■□□□ 1.65
ITGBL1-202ENST00000376180 CDCA8Q53HL2 280 aa25.37■■□□□ 1.65
ITGBL1-202ENST00000376180 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.37■■□□□ 1.65
ITGBL1-202ENST00000376180 ZNF521Q96K83 1311 aa25.36■■□□□ 1.65
ITGBL1-202ENST00000376180 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.35■■□□□ 1.65
ITGBL1-202ENST00000376180 STAC3Q96MF2 364 aa25.33■■□□□ 1.65
ITGBL1-202ENST00000376180 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
ITGBL1-202ENST00000376180 PIK3C2GO75747 1445 aa25.32■■□□□ 1.64
ITGBL1-202ENST00000376180 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.32■■□□□ 1.64
ITGBL1-202ENST00000376180 GSE1Q14687 1217 aa25.31■■□□□ 1.64
ITGBL1-202ENST00000376180 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
ITGBL1-202ENST00000376180 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.3■■□□□ 1.64
ITGBL1-202ENST00000376180 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.3■■□□□ 1.64
ITGBL1-202ENST00000376180 GOLGA2Q08379 1002 aa25.3■■□□□ 1.64
ITGBL1-202ENST00000376180 ATP7AQ04656 1500 aa25.3■■□□□ 1.64
ITGBL1-202ENST00000376180 BRPF3Q9ULD4 1205 aa25.29■■□□□ 1.64
ITGBL1-202ENST00000376180 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
ITGBL1-202ENST00000376180 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
ITGBL1-202ENST00000376180 KDM2BQ8NHM5 1336 aa25.29■■□□□ 1.64
ITGBL1-202ENST00000376180 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.27■■□□□ 1.64
ITGBL1-202ENST00000376180 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.27■■□□□ 1.64
ITGBL1-202ENST00000376180 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.27■■□□□ 1.64
ITGBL1-202ENST00000376180 NFKBIBQ15653 356 aa25.27■■□□□ 1.64
ITGBL1-202ENST00000376180 KANK1Q14678 1352 aa25.26■■□□□ 1.64
ITGBL1-202ENST00000376180 KIF3BO15066 747 aa25.26■■□□□ 1.63
ITGBL1-202ENST00000376180 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.25■■□□□ 1.63
ITGBL1-202ENST00000376180 SLFN5Q08AF3 891 aa25.25■■□□□ 1.63
ITGBL1-202ENST00000376180 ABCA6Q8N139 1617 aa25.25■■□□□ 1.63
ITGBL1-202ENST00000376180 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.24■■□□□ 1.63
ITGBL1-202ENST00000376180 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.24■■□□□ 1.63
ITGBL1-202ENST00000376180 FANCAO15360 1455 aa25.24■■□□□ 1.63
ITGBL1-202ENST00000376180 ERVK-7P63135 1459 aa25.24■■□□□ 1.63
ITGBL1-202ENST00000376180 SLC4A3P48751 1232 aa25.23■■□□□ 1.63
ITGBL1-202ENST00000376180 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
ITGBL1-202ENST00000376180 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.23■■□□□ 1.63
ITGBL1-202ENST00000376180 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.22■■□□□ 1.63
ITGBL1-202ENST00000376180 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.22■■□□□ 1.63
ITGBL1-202ENST00000376180 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
ITGBL1-202ENST00000376180 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
ITGBL1-202ENST00000376180 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
ITGBL1-202ENST00000376180 APAF1O14727 1248 aa25.2■■□□□ 1.62
ITGBL1-202ENST00000376180 MYOM2P54296 1465 aa25.2■■□□□ 1.62
ITGBL1-202ENST00000376180 KIF1BO60333 1816 aa25.19■■□□□ 1.62
ITGBL1-202ENST00000376180 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.19■■□□□ 1.62
ITGBL1-202ENST00000376180 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
ITGBL1-202ENST00000376180 IFT172Q9UG01 1749 aa25.18■■□□□ 1.62
ITGBL1-202ENST00000376180 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
ITGBL1-202ENST00000376180 MROH2AA6NES4 1674 aa25.17■■□□□ 1.62
ITGBL1-202ENST00000376180 ADGRL1O94910 1474 aa25.16■■□□□ 1.62
ITGBL1-202ENST00000376180 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
ITGBL1-202ENST00000376180 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.13■■□□□ 1.61
ITGBL1-202ENST00000376180 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.12■■□□□ 1.61
ITGBL1-202ENST00000376180 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
ITGBL1-202ENST00000376180 BCAR3O75815 825 aa25.11■■□□□ 1.61
ITGBL1-202ENST00000376180 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.1■■□□□ 1.61
ITGBL1-202ENST00000376180 SLC24A1O60721 1099 aa25.1■■□□□ 1.61
ITGBL1-202ENST00000376180 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.09■■□□□ 1.61
ITGBL1-202ENST00000376180 FAM161AQ3B820 660 aa25.09■■□□□ 1.61
ITGBL1-202ENST00000376180 E9PSI1 815 aa25.08■■□□□ 1.61
ITGBL1-202ENST00000376180 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.08■■□□□ 1.61
ITGBL1-202ENST00000376180 C8orf34Q49A92 452 aa25.08■■□□□ 1.61
ITGBL1-202ENST00000376180 NOS1P29475 1434 aa25.05■■□□□ 1.6
ITGBL1-202ENST00000376180 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.05■■□□□ 1.6
ITGBL1-202ENST00000376180 RGS3P49796 1198 aa25.04■■□□□ 1.6
ITGBL1-202ENST00000376180 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
ITGBL1-202ENST00000376180 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
ITGBL1-202ENST00000376180 ADGRB3O60242 1522 aa25.02■■□□□ 1.6
ITGBL1-202ENST00000376180 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
ITGBL1-202ENST00000376180 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
ITGBL1-202ENST00000376180 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
ITGBL1-202ENST00000376180 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.01■■□□□ 1.59
ITGBL1-202ENST00000376180 SHPRHQ149N8 1683 aa25.01■■□□□ 1.59
ITGBL1-202ENST00000376180 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
ITGBL1-202ENST00000376180 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.01■■□□□ 1.59
ITGBL1-202ENST00000376180 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.01■■□□□ 1.59
ITGBL1-202ENST00000376180 TRAK1Q9UPV9 953 aa25■■□□□ 1.59
ITGBL1-202ENST00000376180 ASXL2Q76L83 1435 aa25■■□□□ 1.59
ITGBL1-202ENST00000376180 WWC1Q8IX03 1113 aa25■■□□□ 1.59
ITGBL1-202ENST00000376180 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.5 ms