RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367651.3

CITED2-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED2, Length 2,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-201ENST00000367651 ABCC1P33527 1531 aa24.69■■□□□ 1.54
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CITED2-201ENST00000367651 TRPM2O94759 1503 aa24.67■■□□□ 1.54
CITED2-201ENST00000367651 CEP152O94986 1710 aa24.67■■□□□ 1.54
CITED2-201ENST00000367651 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.67■■□□□ 1.54
CITED2-201ENST00000367651 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
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CITED2-201ENST00000367651 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.65■■□□□ 1.54
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CITED2-201ENST00000367651 C8orf34Q49A92 452 aa24.59■■□□□ 1.53
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CITED2-201ENST00000367651 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.55■■□□□ 1.52
CITED2-201ENST00000367651 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.54■■□□□ 1.52
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CITED2-201ENST00000367651 TET3O43151 1660 aa24.53■■□□□ 1.52
CITED2-201ENST00000367651 FAM161AQ3B820 660 aa24.52■■□□□ 1.52
CITED2-201ENST00000367651 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.52■■□□□ 1.52
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CITED2-201ENST00000367651 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
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CITED2-201ENST00000367651 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.49■■□□□ 1.51
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CITED2-201ENST00000367651 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.49■■□□□ 1.51
CITED2-201ENST00000367651 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.49■■□□□ 1.51
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CITED2-201ENST00000367651 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.47■■□□□ 1.51
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CITED2-201ENST00000367651 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.46■■□□□ 1.51
CITED2-201ENST00000367651 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.45■■□□□ 1.5
CITED2-201ENST00000367651 STAC3Q96MF2 364 aa24.45■■□□□ 1.5
CITED2-201ENST00000367651 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.43■■□□□ 1.5
CITED2-201ENST00000367651 IGHDP01880 384 aa24.43■■□□□ 1.5
CITED2-201ENST00000367651 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
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CITED2-201ENST00000367651 MYOM2P54296 1465 aa24.4■■□□□ 1.5
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CITED2-201ENST00000367651 IFT172Q9UG01 1749 aa24.38■■□□□ 1.49
CITED2-201ENST00000367651 KANK1Q14678 1352 aa24.38■■□□□ 1.49
CITED2-201ENST00000367651 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.38■■□□□ 1.49
CITED2-201ENST00000367651 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
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CITED2-201ENST00000367651 SHPRHQ149N8 1683 aa24.36■■□□□ 1.49
CITED2-201ENST00000367651 GSE1Q14687 1217 aa24.35■■□□□ 1.49
CITED2-201ENST00000367651 PANK1Q8TE04 598 aa24.35■■□□□ 1.49
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CITED2-201ENST00000367651 WWC1Q8IX03 1113 aa24.34■■□□□ 1.49
CITED2-201ENST00000367651 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.34■■□□□ 1.49
CITED2-201ENST00000367651 USP19O94966 1318 aa24.34■■□□□ 1.49
CITED2-201ENST00000367651 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.33■■□□□ 1.49
CITED2-201ENST00000367651 FANCAO15360 1455 aa24.33■■□□□ 1.49
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CITED2-201ENST00000367651 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CITED2-201ENST00000367651 BRPF3Q9ULD4 1205 aa24.31■■□□□ 1.48
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CITED2-201ENST00000367651 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CITED2-201ENST00000367651 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
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CITED2-201ENST00000367651 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
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CITED2-201ENST00000367651 PDE3AQ14432 1141 aa24.29■■□□□ 1.48
CITED2-201ENST00000367651 CLUAP1Q96AJ1 413 aa24.29■■□□□ 1.48
CITED2-201ENST00000367651 NEUROD2Q15784 382 aa24.29■■□□□ 1.48
CITED2-201ENST00000367651 TNNQ9UQP3 1299 aa24.28■■□□□ 1.48
CITED2-201ENST00000367651 NOS1P29475 1434 aa24.27■■□□□ 1.48
CITED2-201ENST00000367651 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.27■■□□□ 1.48
CITED2-201ENST00000367651 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.26■■□□□ 1.47
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