RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 LTKP29376 864 aa11.63□□□□□ -0.55
SGMS1-201ENST00000361543 SLC52A1Q9NWF4 448 aa11.63□□□□□ -0.55
SGMS1-201ENST00000361543 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SGMS1-201ENST00000361543 HFM1A2PYH4 1435 aa11.62□□□□□ -0.55
SGMS1-201ENST00000361543 TXNDC2Q86VQ3 553 aa11.62□□□□□ -0.55
SGMS1-201ENST00000361543 EID1Q9Y6B2 187 aa11.62□□□□□ -0.55
SGMS1-201ENST00000361543 ZFYVE9O95405 1425 aa11.6□□□□□ -0.55
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC7Q96NW7 1537 aa11.6□□□□□ -0.55
SGMS1-201ENST00000361543 KIF1BO60333 1816 aa11.59□□□□□ -0.55
SGMS1-201ENST00000361543 UBAP1LF5GYI3 381 aa11.59□□□□□ -0.55
SGMS1-201ENST00000361543 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
SGMS1-201ENST00000361543 CLTCL1P53675 1640 aa11.59□□□□□ -0.55
SGMS1-201ENST00000361543 TRPM2O94759 1503 aa11.59□□□□□ -0.55
SGMS1-201ENST00000361543 NWD1Q149M9 1564 aa11.58□□□□□ -0.55
SGMS1-201ENST00000361543 RIMS2Q9UQ26 1411 aa11.58□□□□□ -0.56
SGMS1-201ENST00000361543 ALKQ9UM73 1620 aa11.57□□□□□ -0.56
SGMS1-201ENST00000361543 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
SGMS1-201ENST00000361543 DIP2AQ14689 1571 aa11.57□□□□□ -0.56
SGMS1-201ENST00000361543 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa11.55□□□□□ -0.56
SGMS1-201ENST00000361543 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
SGMS1-201ENST00000361543 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
SGMS1-201ENST00000361543 CHGAP10645 457 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
SGMS1-201ENST00000361543 SLC26A8Q96RN1 970 aa11.53□□□□□ -0.56
SGMS1-201ENST00000361543 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa11.53□□□□□ -0.56
SGMS1-201ENST00000361543 TOM1O60784 492 aa11.52□□□□□ -0.57
SGMS1-201ENST00000361543 BCANQ96GW7 911 aa11.52□□□□□ -0.57
SGMS1-201ENST00000361543 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
SGMS1-201ENST00000361543 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa11.51□□□□□ -0.57
SGMS1-201ENST00000361543 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa11.51□□□□□ -0.57
SGMS1-201ENST00000361543 HDGFP51858 240 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
SGMS1-201ENST00000361543 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP11.51□□□□□ -0.57
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM52Q96A61 297 aa11.51□□□□□ -0.57
SGMS1-201ENST00000361543 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
SGMS1-201ENST00000361543 PPLO60437 1756 aa11.5□□□□□ -0.57
SGMS1-201ENST00000361543 PIP4K2BP78356 416 aa11.5□□□□□ -0.57
SGMS1-201ENST00000361543 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa11.5□□□□□ -0.57
SGMS1-201ENST00000361543 KCNA6P17658 529 aa11.49□□□□□ -0.57
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM94Q12767 1356 aa11.49□□□□□ -0.57
SGMS1-201ENST00000361543 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
SGMS1-201ENST00000361543 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
SGMS1-201ENST00000361543 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
SGMS1-201ENST00000361543 IFT172Q9UG01 1749 aa11.47□□□□□ -0.57
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
SGMS1-201ENST00000361543 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa11.46□□□□□ -0.57
SGMS1-201ENST00000361543 PIK3R4Q99570 1358 aa11.46□□□□□ -0.57
SGMS1-201ENST00000361543 HSPA1LP34931 641 aa11.46□□□□□ -0.57
SGMS1-201ENST00000361543 TBX22Q9Y458 520 aa11.46□□□□□ -0.57
SGMS1-201ENST00000361543 SETD5Q9C0A6 1442 aa11.45□□□□□ -0.58
SGMS1-201ENST00000361543 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
SGMS1-201ENST00000361543 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
SGMS1-201ENST00000361543 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
SGMS1-201ENST00000361543 MSH6P52701 1360 aa11.43□□□□□ -0.58
SGMS1-201ENST00000361543 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC144AA2RUR9 1427 aa11.43□□□□□ -0.58
SGMS1-201ENST00000361543 PTPRUQ92729 1446 aa11.43□□□□□ -0.58
SGMS1-201ENST00000361543 NALCNQ8IZF0 1738 aa11.42□□□□□ -0.58
SGMS1-201ENST00000361543 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa11.41□□□□□ -0.58
SGMS1-201ENST00000361543 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
SGMS1-201ENST00000361543 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa11.41□□□□□ -0.58
SGMS1-201ENST00000361543 PHLPP1O60346 1717 aa11.4□□□□□ -0.58
SGMS1-201ENST00000361543 MPHOSPH9Q99550 1183 aa11.4□□□□□ -0.58
SGMS1-201ENST00000361543 FAM135BQ49AJ0 1406 aa11.4□□□□□ -0.58
SGMS1-201ENST00000361543 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa11.39□□□□□ -0.59
SGMS1-201ENST00000361543 METP08581 1390 aa11.39□□□□□ -0.59
SGMS1-201ENST00000361543 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa11.38□□□□□ -0.59
SGMS1-201ENST00000361543 C14orf37Q86TY3 774 aa11.38□□□□□ -0.59
SGMS1-201ENST00000361543 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa11.38□□□□□ -0.59
SGMS1-201ENST00000361543 VGFO15240 615 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
SGMS1-201ENST00000361543 DCCP43146 1447 aa11.36□□□□□ -0.59
SGMS1-201ENST00000361543 PTCH1Q13635 1447 aa11.36□□□□□ -0.59
SGMS1-201ENST00000361543 LAMC1P11047 1609 aa11.36□□□□□ -0.59
SGMS1-201ENST00000361543 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
SGMS1-201ENST00000361543 KNDC1Q76NI1 1749 aa11.36□□□□□ -0.59
SGMS1-201ENST00000361543 SLAIN2Q9P270 581 aa11.35□□□□□ -0.59
SGMS1-201ENST00000361543 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
SGMS1-201ENST00000361543 PRAG1Q86YV5 1406 aa11.35□□□□□ -0.59
SGMS1-201ENST00000361543 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa11.35□□□□□ -0.59
SGMS1-201ENST00000361543 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa11.34□□□□□ -0.59
SGMS1-201ENST00000361543 NHSL1Q5SYE7 1610 aa11.34□□□□□ -0.59
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SGMS1-201ENST00000361543 C19orf44Q9H6X5 657 aa11.33□□□□□ -0.6
SGMS1-201ENST00000361543 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa11.33□□□□□ -0.6
SGMS1-201ENST00000361543 PIK3C2GO75747 1445 aa11.33□□□□□ -0.6
SGMS1-201ENST00000361543 MYOM2P54296 1465 aa11.32□□□□□ -0.6
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SGMS1-201ENST00000361543 RGL3Q3MIN7 710 aa11.32□□□□□ -0.6
SGMS1-201ENST00000361543 SHPRHQ149N8 1683 aa11.32□□□□□ -0.6
SGMS1-201ENST00000361543 MST1RQ04912 1400 aa11.31□□□□□ -0.6
SGMS1-201ENST00000361543 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa11.31□□□□□ -0.6
SGMS1-201ENST00000361543 NRXN1Q9ULB1 1477 aa11.31□□□□□ -0.6
SGMS1-201ENST00000361543 ROBO2Q9HCK4 1378 aa11.3□□□□□ -0.6
SGMS1-201ENST00000361543 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa11.3□□□□□ -0.6
SGMS1-201ENST00000361543 TECPR2O15040 1411 aa11.28□□□□□ -0.6
SGMS1-201ENST00000361543 HRCP23327 699 aa11.28□□□□□ -0.6
SGMS1-201ENST00000361543 JCADQ9P266 1359 aa11.27□□□□□ -0.61
SGMS1-201ENST00000361543 FMN2Q9NZ56 1722 aa11.26□□□□□ -0.61
SGMS1-201ENST00000361543 BRINP3Q76B58 766 aa11.26□□□□□ -0.61
SGMS1-201ENST00000361543 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
SGMS1-201ENST00000361543 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
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