RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329078.7

SPNS2-201, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS2, Length 3,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-201ENST00000329078 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
SPNS2-201ENST00000329078 MORC1Q86VD1 984 aa25.82■■□□□ 1.72
SPNS2-201ENST00000329078 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.82■■□□□ 1.72
SPNS2-201ENST00000329078 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.82■■□□□ 1.72
SPNS2-201ENST00000329078 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.82■■□□□ 1.72
SPNS2-201ENST00000329078 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.82■■□□□ 1.72
SPNS2-201ENST00000329078 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.82■■□□□ 1.72
SPNS2-201ENST00000329078 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.82■■□□□ 1.72
SPNS2-201ENST00000329078 PKNOX2Q96KN3 472 aa25.8■■□□□ 1.72
SPNS2-201ENST00000329078 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.79■■□□□ 1.72
SPNS2-201ENST00000329078 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
SPNS2-201ENST00000329078 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.78■■□□□ 1.72
SPNS2-201ENST00000329078 COG6Q9Y2V7 657 aa25.78■■□□□ 1.72
SPNS2-201ENST00000329078 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.77■■□□□ 1.72
SPNS2-201ENST00000329078 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.76■■□□□ 1.71
SPNS2-201ENST00000329078 PANK1Q8TE04 598 aa25.76■■□□□ 1.71
SPNS2-201ENST00000329078 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
SPNS2-201ENST00000329078 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
SPNS2-201ENST00000329078 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.73■■□□□ 1.71
SPNS2-201ENST00000329078 PLCH2O75038 1416 aa25.72■■□□□ 1.71
SPNS2-201ENST00000329078 NFKBIBQ15653 356 aa25.72■■□□□ 1.71
SPNS2-201ENST00000329078 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.72■■□□□ 1.71
SPNS2-201ENST00000329078 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.72■■□□□ 1.71
SPNS2-201ENST00000329078 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
SPNS2-201ENST00000329078 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.71■■□□□ 1.71
SPNS2-201ENST00000329078 GSE1Q14687 1217 aa25.7■■□□□ 1.7
SPNS2-201ENST00000329078 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
SPNS2-201ENST00000329078 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.68■■□□□ 1.7
SPNS2-201ENST00000329078 SLFN5Q08AF3 891 aa25.68■■□□□ 1.7
SPNS2-201ENST00000329078 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
SPNS2-201ENST00000329078 PREX2Q70Z35 1606 aa25.67■■□□□ 1.7
SPNS2-201ENST00000329078 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.66■■□□□ 1.7
SPNS2-201ENST00000329078 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.65■■□□□ 1.7
SPNS2-201ENST00000329078 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
SPNS2-201ENST00000329078 MS4A1P11836 297 aa25.64■■□□□ 1.7
SPNS2-201ENST00000329078 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
SPNS2-201ENST00000329078 CABP2Q9NPB3 220 aa25.64■■□□□ 1.7
SPNS2-201ENST00000329078 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
SPNS2-201ENST00000329078 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.69
SPNS2-201ENST00000329078 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
SPNS2-201ENST00000329078 MTHFSP49914 203 aa25.63■■□□□ 1.69
SPNS2-201ENST00000329078 RAPGEF3O95398 923 aa25.63■■□□□ 1.69
SPNS2-201ENST00000329078 CHD1O14646 1710 aa25.62■■□□□ 1.69
SPNS2-201ENST00000329078 TNNQ9UQP3 1299 aa25.62■■□□□ 1.69
SPNS2-201ENST00000329078 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.61■■□□□ 1.69
SPNS2-201ENST00000329078 ABCC2Q92887 1545 aa25.61■■□□□ 1.69
SPNS2-201ENST00000329078 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa25.6■■□□□ 1.69
SPNS2-201ENST00000329078 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.6■■□□□ 1.69
SPNS2-201ENST00000329078 PLEKHG5O94827 1062 aa25.6■■□□□ 1.69
SPNS2-201ENST00000329078 TCP11L2Q8N4U5 519 aa25.6■■□□□ 1.69
SPNS2-201ENST00000329078 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
SPNS2-201ENST00000329078 E9PSI1 815 aa25.59■■□□□ 1.69
SPNS2-201ENST00000329078 DDRGK1Q96HY6 314 aa25.59■■□□□ 1.69
SPNS2-201ENST00000329078 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.58■■□□□ 1.69
SPNS2-201ENST00000329078 USP35Q9P2H5 1018 aa25.58■■□□□ 1.69
SPNS2-201ENST00000329078 VSIG10Q8N0Z9 540 aa25.57■■□□□ 1.68
SPNS2-201ENST00000329078 IGHDP01880 384 aa25.57■■□□□ 1.68
SPNS2-201ENST00000329078 FAM161AQ3B820 660 aa25.57■■□□□ 1.68
SPNS2-201ENST00000329078 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.56■■□□□ 1.68
SPNS2-201ENST00000329078 FANCAO15360 1455 aa25.56■■□□□ 1.68
SPNS2-201ENST00000329078 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
SPNS2-201ENST00000329078 WWC1Q8IX03 1113 aa25.55■■□□□ 1.68
SPNS2-201ENST00000329078 CFAP53Q96M91 514 aa25.55■■□□□ 1.68
SPNS2-201ENST00000329078 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
SPNS2-201ENST00000329078 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
SPNS2-201ENST00000329078 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
SPNS2-201ENST00000329078 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.53■■□□□ 1.68
SPNS2-201ENST00000329078 ATP10AO60312 1499 aa25.53■■□□□ 1.68
SPNS2-201ENST00000329078 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
SPNS2-201ENST00000329078 ADGRL1O94910 1474 aa25.52■■□□□ 1.68
SPNS2-201ENST00000329078 NOS1P29475 1434 aa25.52■■□□□ 1.68
SPNS2-201ENST00000329078 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.52■■□□□ 1.68
SPNS2-201ENST00000329078 POGKQ9P215 609 aa25.52■■□□□ 1.68
SPNS2-201ENST00000329078 MLECQ14165 292 aa25.51■■□□□ 1.68
SPNS2-201ENST00000329078 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.51■■□□□ 1.67
SPNS2-201ENST00000329078 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
SPNS2-201ENST00000329078 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.5■■□□□ 1.67
SPNS2-201ENST00000329078 FBLN1P23142 703 aa25.49■■□□□ 1.67
SPNS2-201ENST00000329078 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.47■■□□□ 1.67
SPNS2-201ENST00000329078 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.46■■□□□ 1.67
SPNS2-201ENST00000329078 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.46■■□□□ 1.67
SPNS2-201ENST00000329078 RUNDC1Q96C34 613 aa25.44■■□□□ 1.66
SPNS2-201ENST00000329078 C8orf34Q49A92 452 aa25.44■■□□□ 1.66
SPNS2-201ENST00000329078 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
SPNS2-201ENST00000329078 KDM2BQ8NHM5 1336 aa25.44■■□□□ 1.66
SPNS2-201ENST00000329078 UNC13BO14795 1591 aa25.43■■□□□ 1.66
SPNS2-201ENST00000329078 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.43■■□□□ 1.66
SPNS2-201ENST00000329078 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.43■■□□□ 1.66
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF521Q96K83 1311 aa25.42■■□□□ 1.66
SPNS2-201ENST00000329078 RLBP1P12271 317 aa25.42■■□□□ 1.66
SPNS2-201ENST00000329078 SEC24BO95487 1268 aa25.41■■□□□ 1.66
SPNS2-201ENST00000329078 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa25.41■■□□□ 1.66
SPNS2-201ENST00000329078 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.41■■□□□ 1.66
SPNS2-201ENST00000329078 E9PCH4 1651 aa25.41■■□□□ 1.66
SPNS2-201ENST00000329078 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.4■■□□□ 1.66
SPNS2-201ENST00000329078 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
SPNS2-201ENST00000329078 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
SPNS2-201ENST00000329078 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
SPNS2-201ENST00000329078 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
SPNS2-201ENST00000329078 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.39■■□□□ 1.66
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