RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325897.4

CLVS1-201, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS1, Length 3,486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-201ENST00000325897 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa6.42□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 GPATCH11Q8N954 259 aa6.42□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 CLASP1Q7Z460 1538 aa6.42□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 KIF15Q9NS87 1388 aa6.42□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 NUP155O75694 1391 aa6.41□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 ADGRL2O95490 1459 aa6.41□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 ADGBQ8N7X0 1667 aa6.41□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 PKD2Q13563 968 aa6.41□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 L3MBTL2Q969R5 705 aa6.41□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 CCDC141Q6ZP82 1450 aa6.41□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 SHANK2Q9UPX8 1470 aa6.41□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 TPM2P07951 284 aa6.4□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa6.4□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 SOX12O15370 315 aa6.4□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa6.4□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 OSCARQ8IYS5 282 aa6.4□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 CEP120Q8N960 986 aa6.4□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa6.4□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 CROCC2H7BZ55 1655 aa6.4□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 CLCN1P35523 988 aa6.4□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 TAF3Q5VWG9 929 aa6.4□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 MAP7D2Q96T17 732 aa6.4□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 PREX2Q70Z35 1606 aa6.39□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 TTC37Q6PGP7 1564 aa6.39□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 CARD10Q9BWT7 1032 aa6.39□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 SLC20A2Q08357 652 aa6.39□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 DMTNQ08495 405 aa6.39□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 NBPF20Q3BBV1 942 aa6.39□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 SYCP2Q9BX26 1530 aa6.39□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 KIF20AO95235 890 aa6.38□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP6.38□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa6.38□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa6.38□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa6.38□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 PZPP20742 1482 aa6.38□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa6.38□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 MBD5Q9P267 1494 aa6.38□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 EGFL6Q8IUX8 553 aa6.38□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 KDM5BQ9UGL1 1544 aa6.38□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 ARHGEF5Q12774 1597 aa6.38□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa6.38□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 MYO5CQ9NQX4 1742 aa6.37□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 ANP32CO43423 234 aa6.37□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 PLCH2O75038 1416 aa6.36□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 YY1AP1Q9H869 796 aa6.36□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa6.36□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 RALBP1Q15311 655 aa6.35□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa6.35□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 WDR7Q9Y4E6 1490 aa6.35□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 NBPF1Q3BBV0 1214 aa6.35□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 NBPF11Q86T75 865 aa6.35□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 DCAF11Q8TEB1 546 aa6.34□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 NBPF8Q3BBV2 869 aa6.34□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 TEX14Q8IWB6 1497 aa6.34□□□□□ -1.39
CLVS1-201ENST00000325897 TTC36A6NLP5 189 aa6.34□□□□□ -1.4
CLVS1-201ENST00000325897 CCDC27Q2M243 656 aa6.34□□□□□ -1.4
CLVS1-201ENST00000325897 AFAP1Q8N556 730 aa6.34□□□□□ -1.4
CLVS1-201ENST00000325897 NGEFQ8N5V2 710 aa6.33□□□□□ -1.4
CLVS1-201ENST00000325897 ASXL2Q76L83 1435 aa6.33□□□□□ -1.4
CLVS1-201ENST00000325897 CCDC144AA2RUR9 1427 aa6.32□□□□□ -1.4
CLVS1-201ENST00000325897 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa6.32□□□□□ -1.4
CLVS1-201ENST00000325897 FAM135AQ9P2D6 1515 aa6.32□□□□□ -1.4
CLVS1-201ENST00000325897 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CLVS1-201ENST00000325897 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CLVS1-201ENST00000325897 FANCAO15360 1455 aa6.32□□□□□ -1.4
CLVS1-201ENST00000325897 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa6.32□□□□□ -1.4
CLVS1-201ENST00000325897 RGL3Q3MIN7 710 aa6.32□□□□□ -1.4
CLVS1-201ENST00000325897 ABCC1P33527 1531 aa6.32□□□□□ -1.4
CLVS1-201ENST00000325897 NECTIN2Q92692 538 aa6.31□□□□□ -1.4
CLVS1-201ENST00000325897 KDM5DQ9BY66 1539 aa6.31□□□□□ -1.4
CLVS1-201ENST00000325897 DUOX2Q9NRD8 1548 aa6.31□□□□□ -1.4
CLVS1-201ENST00000325897 MAST1Q9Y2H9 1570 aa6.31□□□□□ -1.4
CLVS1-201ENST00000325897 E9PSI1 815 aa6.31□□□□□ -1.4
CLVS1-201ENST00000325897 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa6.31□□□□□ -1.4
CLVS1-201ENST00000325897 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CLVS1-201ENST00000325897 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CLVS1-201ENST00000325897 SEMA3FQ13275 785 aa6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.5 ms