RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 MROH1Q8NDA8 1641 aa21.79■■□□□ 1.08
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SHQ1-201ENST00000325599 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
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SHQ1-201ENST00000325599 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa21.77■■□□□ 1.08
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SHQ1-201ENST00000325599 MROH2AA6NES4 1674 aa21.68■■□□□ 1.06
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SHQ1-201ENST00000325599 C20orf194Q5TEA3 1177 aa21.59■■□□□ 1.05
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SHQ1-201ENST00000325599 PIK3C2GO75747 1445 aa21.59■■□□□ 1.05
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SHQ1-201ENST00000325599 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SHQ1-201ENST00000325599 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.47■■□□□ 1.03
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SHQ1-201ENST00000325599 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
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SHQ1-201ENST00000325599 ADGRB1O14514 1584 aa21.45■■□□□ 1.03
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SHQ1-201ENST00000325599 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SHQ1-201ENST00000325599 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SHQ1-201ENST00000325599 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa21.41■■□□□ 1.02
SHQ1-201ENST00000325599 MORC1Q86VD1 984 aa21.41■■□□□ 1.02
SHQ1-201ENST00000325599 BACH2Q9BYV9 841 aa21.41■■□□□ 1.02
SHQ1-201ENST00000325599 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa21.4■■□□□ 1.02
SHQ1-201ENST00000325599 BCAR3O75815 825 aa21.39■■□□□ 1.01
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