RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323081.12

SPNS1-202, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SPNS1, Length 2,102 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-202ENST00000323081 RAPGEF3O95398 923 aa23.78■■□□□ 1.4
SPNS1-202ENST00000323081 NLRP13Q86W25 1043 aa23.78■■□□□ 1.4
SPNS1-202ENST00000323081 NPATQ14207 1427 aa23.78■■□□□ 1.4
SPNS1-202ENST00000323081 PANK3Q9H999 370 aa23.77■■□□□ 1.4
SPNS1-202ENST00000323081 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.77■■□□□ 1.4
SPNS1-202ENST00000323081 NUDCQ9Y266 331 aa23.77■■□□□ 1.4
SPNS1-202ENST00000323081 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.76■■□□□ 1.39
SPNS1-202ENST00000323081 GGT6Q6P531 493 aa23.75■■□□□ 1.39
SPNS1-202ENST00000323081 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
SPNS1-202ENST00000323081 RICTORQ6R327 1708 aa23.75■■□□□ 1.39
SPNS1-202ENST00000323081 ADGRB3O60242 1522 aa23.74■■□□□ 1.39
SPNS1-202ENST00000323081 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.74■■□□□ 1.39
SPNS1-202ENST00000323081 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
SPNS1-202ENST00000323081 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.74■■□□□ 1.39
SPNS1-202ENST00000323081 ABCC3O15438 1527 aa23.73■■□□□ 1.39
SPNS1-202ENST00000323081 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.71■■□□□ 1.39
SPNS1-202ENST00000323081 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.71■■□□□ 1.39
SPNS1-202ENST00000323081 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
SPNS1-202ENST00000323081 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.71■■□□□ 1.39
SPNS1-202ENST00000323081 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.7■■□□□ 1.38
SPNS1-202ENST00000323081 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-202ENST00000323081 GLI2P10070 1586 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-202ENST00000323081 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-202ENST00000323081 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-202ENST00000323081 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-202ENST00000323081 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-202ENST00000323081 SYNMO15061 1565 aa23.66■■□□□ 1.38
SPNS1-202ENST00000323081 NOS1P29475 1434 aa23.66■■□□□ 1.38
SPNS1-202ENST00000323081 MYOM1P52179 1685 aa23.66■■□□□ 1.38
SPNS1-202ENST00000323081 PPLO60437 1756 aa23.66■■□□□ 1.38
SPNS1-202ENST00000323081 CDCA8Q53HL2 280 aa23.65■■□□□ 1.38
SPNS1-202ENST00000323081 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.64■■□□□ 1.37
SPNS1-202ENST00000323081 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-202ENST00000323081 RNF123Q5XPI4 1314 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-202ENST00000323081 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-202ENST00000323081 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-202ENST00000323081 PIK3C2BO00750 1634 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-202ENST00000323081 KNSTRNQ9Y448 316 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-202ENST00000323081 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-202ENST00000323081 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-202ENST00000323081 PIK3C2GO75747 1445 aa23.59■■□□□ 1.37
SPNS1-202ENST00000323081 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SPNS1-202ENST00000323081 ERVK-7P63135 1459 aa23.59■■□□□ 1.37
SPNS1-202ENST00000323081 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
SPNS1-202ENST00000323081 DIP2BQ9P265 1576 aa23.58■■□□□ 1.37
SPNS1-202ENST00000323081 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
SPNS1-202ENST00000323081 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.55■■□□□ 1.36
SPNS1-202ENST00000323081 ADGRB1O14514 1584 aa23.54■■□□□ 1.36
SPNS1-202ENST00000323081 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.54■■□□□ 1.36
SPNS1-202ENST00000323081 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.53■■□□□ 1.36
SPNS1-202ENST00000323081 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.53■■□□□ 1.36
SPNS1-202ENST00000323081 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.53■■□□□ 1.36
SPNS1-202ENST00000323081 PDE3BQ13370 1112 aa23.53■■□□□ 1.36
SPNS1-202ENST00000323081 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SPNS1-202ENST00000323081 INSRP06213 1382 aa23.52■■□□□ 1.36
SPNS1-202ENST00000323081 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.52■■□□□ 1.36
SPNS1-202ENST00000323081 SLC24A1O60721 1099 aa23.51■■□□□ 1.35
SPNS1-202ENST00000323081 TSPOAP1O95153 1857 aa23.5■■□□□ 1.35
SPNS1-202ENST00000323081 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.5■■□□□ 1.35
SPNS1-202ENST00000323081 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SPNS1-202ENST00000323081 PPP2R1AP30153 589 aa23.5■■□□□ 1.35
SPNS1-202ENST00000323081 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa23.47■■□□□ 1.35
SPNS1-202ENST00000323081 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SPNS1-202ENST00000323081 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.47■■□□□ 1.35
SPNS1-202ENST00000323081 QRICH2Q9H0J4 1663 aa23.47■■□□□ 1.35
SPNS1-202ENST00000323081 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.46■■□□□ 1.35
SPNS1-202ENST00000323081 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.46■■□□□ 1.35
SPNS1-202ENST00000323081 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.46■■□□□ 1.35
SPNS1-202ENST00000323081 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.45■■□□□ 1.35
SPNS1-202ENST00000323081 ADAMTS8Q9UP79 889 aa23.45■■□□□ 1.35
SPNS1-202ENST00000323081 IDI1Q13907 227 aa23.45■■□□□ 1.34
SPNS1-202ENST00000323081 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.45■■□□□ 1.34
SPNS1-202ENST00000323081 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-202ENST00000323081 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-202ENST00000323081 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-202ENST00000323081 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-202ENST00000323081 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
SPNS1-202ENST00000323081 CARD14Q9BXL6 1004 aa23.41■■□□□ 1.34
SPNS1-202ENST00000323081 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SPNS1-202ENST00000323081 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.41■■□□□ 1.34
SPNS1-202ENST00000323081 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.4■■□□□ 1.34
SPNS1-202ENST00000323081 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
SPNS1-202ENST00000323081 REREQ9P2R6 1566 aa23.38■■□□□ 1.33
SPNS1-202ENST00000323081 ZFYVE9O95405 1425 aa23.37■■□□□ 1.33
SPNS1-202ENST00000323081 AGLP35573 1532 aa23.34■■□□□ 1.33
SPNS1-202ENST00000323081 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
SPNS1-202ENST00000323081 MSH5O43196 834 aa23.33■■□□□ 1.32
SPNS1-202ENST00000323081 EXOC6Q8TAG9 804 aa23.32■■□□□ 1.32
SPNS1-202ENST00000323081 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.31■■□□□ 1.32
SPNS1-202ENST00000323081 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.31■■□□□ 1.32
SPNS1-202ENST00000323081 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.3■■□□□ 1.32
SPNS1-202ENST00000323081 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SPNS1-202ENST00000323081 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.28■■□□□ 1.32
SPNS1-202ENST00000323081 NSD3Q9BZ95 1437 aa23.28■■□□□ 1.32
SPNS1-202ENST00000323081 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
SPNS1-202ENST00000323081 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.25■■□□□ 1.31
SPNS1-202ENST00000323081 PLIN1O60240 522 aa23.24■■□□□ 1.31
SPNS1-202ENST00000323081 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.24■■□□□ 1.31
SPNS1-202ENST00000323081 USP32Q8NFA0 1604 aa23.24■■□□□ 1.31
SPNS1-202ENST00000323081 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.24■■□□□ 1.31
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