RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317008.4

AC068473.1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AC068473.1, Length 1,111 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC068473.1-201ENST00000317008 CPS1P31327 1500 aa30.03■■■□□ 2.4
AC068473.1-201ENST00000317008 FBXO41Q8TF61 875 aa30.03■■■□□ 2.4
AC068473.1-201ENST00000317008 FOXD1Q16676 465 aa30.02■■■□□ 2.4
AC068473.1-201ENST00000317008 IQSEC2Q5JU85 1478 aa30.01■■■□□ 2.4
AC068473.1-201ENST00000317008 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
AC068473.1-201ENST00000317008 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
AC068473.1-201ENST00000317008 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.98■■■□□ 2.39
AC068473.1-201ENST00000317008 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.97■■■□□ 2.39
AC068473.1-201ENST00000317008 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
AC068473.1-201ENST00000317008 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa29.96■■■□□ 2.39
AC068473.1-201ENST00000317008 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.95■■■□□ 2.39
AC068473.1-201ENST00000317008 NWD1Q149M9 1564 aa29.94■■■□□ 2.38
AC068473.1-201ENST00000317008 PPLO60437 1756 aa29.93■■■□□ 2.38
AC068473.1-201ENST00000317008 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
AC068473.1-201ENST00000317008 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.91■■■□□ 2.38
AC068473.1-201ENST00000317008 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
AC068473.1-201ENST00000317008 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.91■■■□□ 2.38
AC068473.1-201ENST00000317008 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.89■■■□□ 2.38
AC068473.1-201ENST00000317008 DIP2AQ14689 1571 aa29.89■■■□□ 2.38
AC068473.1-201ENST00000317008 IFT172Q9UG01 1749 aa29.88■■■□□ 2.37
AC068473.1-201ENST00000317008 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.86■■■□□ 2.37
AC068473.1-201ENST00000317008 ALKQ9UM73 1620 aa29.85■■■□□ 2.37
AC068473.1-201ENST00000317008 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
AC068473.1-201ENST00000317008 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.85■■■□□ 2.37
AC068473.1-201ENST00000317008 BCANQ96GW7 911 aa29.84■■■□□ 2.37
AC068473.1-201ENST00000317008 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
AC068473.1-201ENST00000317008 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.83■■■□□ 2.37
AC068473.1-201ENST00000317008 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
AC068473.1-201ENST00000317008 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
AC068473.1-201ENST00000317008 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.79■■■□□ 2.36
AC068473.1-201ENST00000317008 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.36
AC068473.1-201ENST00000317008 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.36
AC068473.1-201ENST00000317008 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.73■■■□□ 2.35
AC068473.1-201ENST00000317008 KCNA6P17658 529 aa29.73■■■□□ 2.35
AC068473.1-201ENST00000317008 PTPRUQ92729 1446 aa29.72■■■□□ 2.35
AC068473.1-201ENST00000317008 TMEM94Q12767 1356 aa29.7■■■□□ 2.35
AC068473.1-201ENST00000317008 TBX22Q9Y458 520 aa29.7■■■□□ 2.35
AC068473.1-201ENST00000317008 HRCP23327 699 aa29.69■■■□□ 2.34
AC068473.1-201ENST00000317008 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
AC068473.1-201ENST00000317008 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.68■■■□□ 2.34
AC068473.1-201ENST00000317008 METP08581 1390 aa29.66■■■□□ 2.34
AC068473.1-201ENST00000317008 PIK3R4Q99570 1358 aa29.64■■■□□ 2.34
AC068473.1-201ENST00000317008 RGL3Q3MIN7 710 aa29.64■■■□□ 2.34
AC068473.1-201ENST00000317008 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.63■■■□□ 2.33
AC068473.1-201ENST00000317008 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
AC068473.1-201ENST00000317008 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.59■■■□□ 2.33
AC068473.1-201ENST00000317008 PIP4K2BP78356 416 aa29.58■■■□□ 2.33
AC068473.1-201ENST00000317008 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa29.58■■■□□ 2.33
AC068473.1-201ENST00000317008 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
AC068473.1-201ENST00000317008 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
AC068473.1-201ENST00000317008 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
AC068473.1-201ENST00000317008 NALCNQ8IZF0 1738 aa29.57■■■□□ 2.32
AC068473.1-201ENST00000317008 TOM1O60784 492 aa29.56■■■□□ 2.32
AC068473.1-201ENST00000317008 PIK3C2GO75747 1445 aa29.55■■■□□ 2.32
AC068473.1-201ENST00000317008 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.55■■■□□ 2.32
AC068473.1-201ENST00000317008 MYOM2P54296 1465 aa29.55■■■□□ 2.32
AC068473.1-201ENST00000317008 NRXN1Q9ULB1 1477 aa29.53■■■□□ 2.32
AC068473.1-201ENST00000317008 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa29.51■■■□□ 2.31
AC068473.1-201ENST00000317008 LAMC1P11047 1609 aa29.5■■■□□ 2.31
AC068473.1-201ENST00000317008 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.49■■■□□ 2.31
AC068473.1-201ENST00000317008 MSH6P52701 1360 aa29.49■■■□□ 2.31
AC068473.1-201ENST00000317008 PTCH1Q13635 1447 aa29.45■■■□□ 2.31
AC068473.1-201ENST00000317008 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.45■■■□□ 2.31
AC068473.1-201ENST00000317008 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa29.45■■■□□ 2.3
AC068473.1-201ENST00000317008 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
AC068473.1-201ENST00000317008 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.43■■■□□ 2.3
AC068473.1-201ENST00000317008 HSPA1LP34931 641 aa29.43■■■□□ 2.3
AC068473.1-201ENST00000317008 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
AC068473.1-201ENST00000317008 C14orf37Q86TY3 774 aa29.4■■■□□ 2.3
AC068473.1-201ENST00000317008 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa29.39■■■□□ 2.3
AC068473.1-201ENST00000317008 TECPR2O15040 1411 aa29.35■■■□□ 2.29
AC068473.1-201ENST00000317008 DCCP43146 1447 aa29.35■■■□□ 2.29
AC068473.1-201ENST00000317008 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.35■■■□□ 2.29
AC068473.1-201ENST00000317008 ADGRB1O14514 1584 aa29.35■■■□□ 2.29
AC068473.1-201ENST00000317008 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.34■■■□□ 2.29
AC068473.1-201ENST00000317008 PHLPP1O60346 1717 aa29.33■■■□□ 2.29
AC068473.1-201ENST00000317008 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
AC068473.1-201ENST00000317008 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
AC068473.1-201ENST00000317008 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.32■■■□□ 2.28
AC068473.1-201ENST00000317008 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.32■■■□□ 2.28
AC068473.1-201ENST00000317008 C19orf44Q9H6X5 657 aa29.31■■■□□ 2.28
AC068473.1-201ENST00000317008 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.31■■■□□ 2.28
AC068473.1-201ENST00000317008 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
AC068473.1-201ENST00000317008 MST1RQ04912 1400 aa29.29■■■□□ 2.28
AC068473.1-201ENST00000317008 SLAIN2Q9P270 581 aa29.29■■■□□ 2.28
AC068473.1-201ENST00000317008 STK26Q9P289 416 aa29.29■■■□□ 2.28
AC068473.1-201ENST00000317008 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa29.27■■■□□ 2.28
AC068473.1-201ENST00000317008 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.27■■■□□ 2.28
AC068473.1-201ENST00000317008 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
AC068473.1-201ENST00000317008 ATF3P18847 181 aa29.25■■■□□ 2.27
AC068473.1-201ENST00000317008 CADPS2Q86UW7 1296 aa29.25■■■□□ 2.27
AC068473.1-201ENST00000317008 ABCC11Q96J66 1382 aa29.25■■■□□ 2.27
AC068473.1-201ENST00000317008 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.24■■■□□ 2.27
AC068473.1-201ENST00000317008 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa29.24■■■□□ 2.27
AC068473.1-201ENST00000317008 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
AC068473.1-201ENST00000317008 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
AC068473.1-201ENST00000317008 NHSL1Q5SYE7 1610 aa29.23■■■□□ 2.27
AC068473.1-201ENST00000317008 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
AC068473.1-201ENST00000317008 FMN2Q9NZ56 1722 aa29.21■■■□□ 2.27
AC068473.1-201ENST00000317008 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms