RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295083.7

PQLC3-201, Transcript of PQ loop repeat containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PQLC3, Length 1,830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC3-201ENST00000295083 ZFYVE9O95405 1425 aa35.68■■■■□ 3.3
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PQLC3-201ENST00000295083 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.67■■■■□ 3.3
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PQLC3-201ENST00000295083 LTKP29376 864 aa35.67■■■■□ 3.3
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PQLC3-201ENST00000295083 STRCQ7RTU9 1775 aa35.45■■■■□ 3.27
PQLC3-201ENST00000295083 PRAG1Q86YV5 1406 aa35.45■■■■□ 3.27
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PQLC3-201ENST00000295083 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa35.37■■■■□ 3.25
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PQLC3-201ENST00000295083 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
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PQLC3-201ENST00000295083 TMEM132EQ6IEE7 984 aa35.27■■■■□ 3.24
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PQLC3-201ENST00000295083 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa35.27■■■■□ 3.24
PQLC3-201ENST00000295083 METP08581 1390 aa35.25■■■■□ 3.23
PQLC3-201ENST00000295083 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa35.23■■■■□ 3.23
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PQLC3-201ENST00000295083 ABCC11Q96J66 1382 aa35.02■■■■□ 3.2
PQLC3-201ENST00000295083 STRCP1A6NGW2 1772 aa35■■■■□ 3.19
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PQLC3-201ENST00000295083 ROBO2Q9HCK4 1378 aa34.98■■■■□ 3.19
PQLC3-201ENST00000295083 TECPR2O15040 1411 aa34.97■■■■□ 3.19
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PQLC3-201ENST00000295083 KNDC1Q76NI1 1749 aa34.93■■■■□ 3.18
PQLC3-201ENST00000295083 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
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PQLC3-201ENST00000295083 CPS1P31327 1500 aa34.91■■■■□ 3.18
PQLC3-201ENST00000295083 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa34.91■■■■□ 3.18
PQLC3-201ENST00000295083 DLC1Q96QB1 1528 aa34.9■■■■□ 3.18
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PQLC3-201ENST00000295083 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP34.9■■■■□ 3.18
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PQLC3-201ENST00000295083 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa34.87■■■■□ 3.17
PQLC3-201ENST00000295083 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP34.87■■■■□ 3.17
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PQLC3-201ENST00000295083 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP34.86■■■■□ 3.17
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PQLC3-201ENST00000295083 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP34.85■■■■□ 3.17
PQLC3-201ENST00000295083 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP34.85■■■■□ 3.17
PQLC3-201ENST00000295083 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP34.84■■■■□ 3.17
PQLC3-201ENST00000295083 LTBP4Q8N2S1 1624 aa34.81■■■■□ 3.16
PQLC3-201ENST00000295083 TMEM94Q12767 1356 aa34.79■■■■□ 3.16
PQLC3-201ENST00000295083 LRRC7Q96NW7 1537 aa34.78■■■■□ 3.16
PQLC3-201ENST00000295083 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP34.76■■■■□ 3.15
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