RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295083.7

PQLC3-201, Transcript of PQ loop repeat containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PQLC3, Length 1,830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC3-201ENST00000295083 ZFYVE9O95405 1425 aa35.68■■■■□ 3.3
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PQLC3-201ENST00000295083 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.67■■■■□ 3.3
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PQLC3-201ENST00000295083 LTKP29376 864 aa35.67■■■■□ 3.3
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PQLC3-201ENST00000295083 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP35.57■■■■□ 3.29
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PQLC3-201ENST00000295083 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
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PQLC3-201ENST00000295083 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
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PQLC3-201ENST00000295083 STRCQ7RTU9 1775 aa35.45■■■■□ 3.27
PQLC3-201ENST00000295083 PRAG1Q86YV5 1406 aa35.45■■■■□ 3.27
PQLC3-201ENST00000295083 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa35.45■■■■□ 3.27
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PQLC3-201ENST00000295083 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa35.39■■■■□ 3.26
PQLC3-201ENST00000295083 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
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PQLC3-201ENST00000295083 SLC26A8Q96RN1 970 aa35.38■■■■□ 3.25
PQLC3-201ENST00000295083 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa35.37■■■■□ 3.25
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PQLC3-201ENST00000295083 ALKQ9UM73 1620 aa35.32■■■■□ 3.25
PQLC3-201ENST00000295083 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
PQLC3-201ENST00000295083 NBPF1Q3BBV0 1214 aa35.31■■■■□ 3.24
PQLC3-201ENST00000295083 TMEM132EQ6IEE7 984 aa35.27■■■■□ 3.24
PQLC3-201ENST00000295083 TBX22Q9Y458 520 aa35.27■■■■□ 3.24
PQLC3-201ENST00000295083 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
PQLC3-201ENST00000295083 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa35.27■■■■□ 3.24
PQLC3-201ENST00000295083 METP08581 1390 aa35.25■■■■□ 3.23
PQLC3-201ENST00000295083 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa35.23■■■■□ 3.23
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PQLC3-201ENST00000295083 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa35.22■■■■□ 3.23
PQLC3-201ENST00000295083 RALGAPBQ86X10 1494 aa35.21■■■■□ 3.23
PQLC3-201ENST00000295083 DIP2AQ14689 1571 aa35.2■■■■□ 3.23
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PQLC3-201ENST00000295083 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.21
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PQLC3-201ENST00000295083 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
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PQLC3-201ENST00000295083 ABCC11Q96J66 1382 aa35.02■■■■□ 3.2
PQLC3-201ENST00000295083 STRCP1A6NGW2 1772 aa35■■■■□ 3.19
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PQLC3-201ENST00000295083 ROBO2Q9HCK4 1378 aa34.98■■■■□ 3.19
PQLC3-201ENST00000295083 TECPR2O15040 1411 aa34.97■■■■□ 3.19
PQLC3-201ENST00000295083 NWD1Q149M9 1564 aa34.96■■■■□ 3.19
PQLC3-201ENST00000295083 WAPLQ7Z5K2 1190 aa34.95■■■■□ 3.18
PQLC3-201ENST00000295083 USP47Q96K76 1375 aa34.94■■■■□ 3.18
PQLC3-201ENST00000295083 KNDC1Q76NI1 1749 aa34.93■■■■□ 3.18
PQLC3-201ENST00000295083 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
PQLC3-201ENST00000295083 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
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PQLC3-201ENST00000295083 CPS1P31327 1500 aa34.91■■■■□ 3.18
PQLC3-201ENST00000295083 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa34.91■■■■□ 3.18
PQLC3-201ENST00000295083 DLC1Q96QB1 1528 aa34.9■■■■□ 3.18
PQLC3-201ENST00000295083 PTCH1Q13635 1447 aa34.9■■■■□ 3.18
PQLC3-201ENST00000295083 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP34.9■■■■□ 3.18
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PQLC3-201ENST00000295083 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa34.87■■■■□ 3.17
PQLC3-201ENST00000295083 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP34.87■■■■□ 3.17
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PQLC3-201ENST00000295083 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP34.86■■■■□ 3.17
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PQLC3-201ENST00000295083 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP34.85■■■■□ 3.17
PQLC3-201ENST00000295083 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP34.85■■■■□ 3.17
PQLC3-201ENST00000295083 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP34.84■■■■□ 3.17
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PQLC3-201ENST00000295083 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP34.76■■■■□ 3.15
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