RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285681.6

USP25-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,216 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-202ENST00000285681 TPM4P67936 248 aa25.02■■□□□ 1.6
USP25-202ENST00000285681 NECTIN2Q92692 538 aa25.02■■□□□ 1.6
USP25-202ENST00000285681 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.01■■□□□ 1.59
USP25-202ENST00000285681 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.01■■□□□ 1.59
USP25-202ENST00000285681 CABP2Q9NPB3 220 aa25.01■■□□□ 1.59
USP25-202ENST00000285681 FOXD4L1Q9NU39 408 aa25.01■■□□□ 1.59
USP25-202ENST00000285681 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.01■■□□□ 1.59
USP25-202ENST00000285681 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.01■■□□□ 1.59
USP25-202ENST00000285681 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
USP25-202ENST00000285681 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
USP25-202ENST00000285681 NLRP6P59044 892 aa24.98■■□□□ 1.59
USP25-202ENST00000285681 CRBNQ96SW2 442 aa24.98■■□□□ 1.59
USP25-202ENST00000285681 NLRP2Q9NX02 1062 aa24.98■■□□□ 1.59
USP25-202ENST00000285681 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.98■■□□□ 1.59
USP25-202ENST00000285681 GNAI1P63096 354 aa24.98■■□□□ 1.59
USP25-202ENST00000285681 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.98■■□□□ 1.59
USP25-202ENST00000285681 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
USP25-202ENST00000285681 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
USP25-202ENST00000285681 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa24.97■■□□□ 1.59
USP25-202ENST00000285681 IFT140Q96RY7 1462 aa24.97■■□□□ 1.59
USP25-202ENST00000285681 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.97■■□□□ 1.59
USP25-202ENST00000285681 HMOX1P09601 288 aa24.97■■□□□ 1.59
USP25-202ENST00000285681 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.96■■□□□ 1.59
USP25-202ENST00000285681 CCDC7Q96M83 1385 aa24.96■■□□□ 1.59
USP25-202ENST00000285681 NESP48681 1621 aa24.96■■□□□ 1.59
USP25-202ENST00000285681 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
USP25-202ENST00000285681 CHMP4CQ96CF2 233 aa24.96■■□□□ 1.59
USP25-202ENST00000285681 MARCH6O60337 910 aa24.95■■□□□ 1.58
USP25-202ENST00000285681 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.95■■□□□ 1.58
USP25-202ENST00000285681 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.95■■□□□ 1.58
USP25-202ENST00000285681 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
USP25-202ENST00000285681 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
USP25-202ENST00000285681 DEKP35659 375 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
USP25-202ENST00000285681 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
USP25-202ENST00000285681 RUFY2Q8WXA3 655 aa24.92■■□□□ 1.58
USP25-202ENST00000285681 ROCK1Q13464 1354 aa24.92■■□□□ 1.58
USP25-202ENST00000285681 FAM161AQ3B820 660 aa24.92■■□□□ 1.58
USP25-202ENST00000285681 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
USP25-202ENST00000285681 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.91■■□□□ 1.58
USP25-202ENST00000285681 VPS53Q5VIR6 699 aa24.9■■□□□ 1.58
USP25-202ENST00000285681 H3BQV1 296 aa24.9■■□□□ 1.58
USP25-202ENST00000285681 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
USP25-202ENST00000285681 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.58
USP25-202ENST00000285681 IFFO2Q5TF58 517 aa24.9■■□□□ 1.58
USP25-202ENST00000285681 FAM184AQ8NB25 1140 aa24.89■■□□□ 1.58
USP25-202ENST00000285681 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.89■■□□□ 1.58
USP25-202ENST00000285681 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa24.89■■□□□ 1.57
USP25-202ENST00000285681 AMOTL1Q8IY63 956 aa24.89■■□□□ 1.57
USP25-202ENST00000285681 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
USP25-202ENST00000285681 VPS37DQ86XT2 251 aa24.88■■□□□ 1.57
USP25-202ENST00000285681 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
USP25-202ENST00000285681 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
USP25-202ENST00000285681 REC8O95072 547 aa24.86■■□□□ 1.57
USP25-202ENST00000285681 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
USP25-202ENST00000285681 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
USP25-202ENST00000285681 ABTB2Q8N961 1025 aa24.86■■□□□ 1.57
USP25-202ENST00000285681 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
USP25-202ENST00000285681 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.86■■□□□ 1.57
USP25-202ENST00000285681 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa24.86■■□□□ 1.57
USP25-202ENST00000285681 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.85■■□□□ 1.57
USP25-202ENST00000285681 PDE4AP27815 886 aa24.85■■□□□ 1.57
USP25-202ENST00000285681 ARAP1Q96P48 1450 aa24.85■■□□□ 1.57
USP25-202ENST00000285681 MTHFSP49914 203 aa24.85■■□□□ 1.57
USP25-202ENST00000285681 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.84■■□□□ 1.57
USP25-202ENST00000285681 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.84■■□□□ 1.57
USP25-202ENST00000285681 HFM1A2PYH4 1435 aa24.84■■□□□ 1.57
USP25-202ENST00000285681 PHF14O94880 888 aa24.83■■□□□ 1.57
USP25-202ENST00000285681 CREBRFQ8IUR6 639 aa24.83■■□□□ 1.57
USP25-202ENST00000285681 TOPBP1Q92547 1522 aa24.83■■□□□ 1.57
USP25-202ENST00000285681 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa24.83■■□□□ 1.57
USP25-202ENST00000285681 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.83■■□□□ 1.57
USP25-202ENST00000285681 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa24.83■■□□□ 1.57
USP25-202ENST00000285681 PRAM1Q96QH2 718 aa24.83■■□□□ 1.56
USP25-202ENST00000285681 APPP05067 770 aa24.82■■□□□ 1.56
USP25-202ENST00000285681 TRIM34Q9BYJ4 488 aa24.82■■□□□ 1.56
USP25-202ENST00000285681 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.82■■□□□ 1.56
USP25-202ENST00000285681 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.8■■□□□ 1.56
USP25-202ENST00000285681 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.8■■□□□ 1.56
USP25-202ENST00000285681 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
USP25-202ENST00000285681 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.8■■□□□ 1.56
USP25-202ENST00000285681 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
USP25-202ENST00000285681 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.79■■□□□ 1.56
USP25-202ENST00000285681 SYNJ1O43426 1573 aa24.79■■□□□ 1.56
USP25-202ENST00000285681 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.79■■□□□ 1.56
USP25-202ENST00000285681 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
USP25-202ENST00000285681 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.78■■□□□ 1.56
USP25-202ENST00000285681 DDX11L8A8MPP1 907 aa24.77■■□□□ 1.56
USP25-202ENST00000285681 RAD21O60216 631 aa24.76■■□□□ 1.55
USP25-202ENST00000285681 TRDNQ13061 729 aa24.76■■□□□ 1.55
USP25-202ENST00000285681 RNF20Q5VTR2 975 aa24.76■■□□□ 1.55
USP25-202ENST00000285681 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
USP25-202ENST00000285681 RAPGEF3O95398 923 aa24.75■■□□□ 1.55
USP25-202ENST00000285681 USP35Q9P2H5 1018 aa24.75■■□□□ 1.55
USP25-202ENST00000285681 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.75■■□□□ 1.55
USP25-202ENST00000285681 ANO2Q9NQ90 1003 aa24.75■■□□□ 1.55
USP25-202ENST00000285681 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.75■■□□□ 1.55
USP25-202ENST00000285681 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
USP25-202ENST00000285681 MCTP1Q6DN14 999 aa24.75■■□□□ 1.55
USP25-202ENST00000285681 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
USP25-202ENST00000285681 FBXW7Q969H0 707 aa24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms