RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273598.7

NICN1-201, Transcript of nicolin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NICN1, Length 2,616 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-201ENST00000273598 SLC52A1Q9NWF4 448 aa20.04■□□□□ 0.8
NICN1-201ENST00000273598 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
NICN1-201ENST00000273598 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa20.04■□□□□ 0.8
NICN1-201ENST00000273598 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
NICN1-201ENST00000273598 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
NICN1-201ENST00000273598 DISP3Q9P2K9 1392 aa20.03■□□□□ 0.8
NICN1-201ENST00000273598 MRS2Q9HD23 443 aa20.03■□□□□ 0.8
NICN1-201ENST00000273598 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.03■□□□□ 0.8
NICN1-201ENST00000273598 CCDC184Q52MB2 194 aa20.02■□□□□ 0.8
NICN1-201ENST00000273598 SYNMO15061 1565 aa20.02■□□□□ 0.8
NICN1-201ENST00000273598 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
NICN1-201ENST00000273598 AGLP35573 1532 aa20.01■□□□□ 0.79
NICN1-201ENST00000273598 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
NICN1-201ENST00000273598 REREQ9P2R6 1566 aa20.01■□□□□ 0.79
NICN1-201ENST00000273598 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
NICN1-201ENST00000273598 IFT172Q9UG01 1749 aa19.99■□□□□ 0.79
NICN1-201ENST00000273598 VGFO15240 615 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
NICN1-201ENST00000273598 STAG3Q9UJ98 1225 aa19.99■□□□□ 0.79
NICN1-201ENST00000273598 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa19.98■□□□□ 0.79
NICN1-201ENST00000273598 IQGAP1P46940 1657 aa19.98■□□□□ 0.79
NICN1-201ENST00000273598 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa19.98■□□□□ 0.79
NICN1-201ENST00000273598 FAM9BQ8IZU0 186 aa19.97■□□□□ 0.79
NICN1-201ENST00000273598 PIK3C2BO00750 1634 aa19.97■□□□□ 0.79
NICN1-201ENST00000273598 NRXN1Q9ULB1 1477 aa19.96■□□□□ 0.79
NICN1-201ENST00000273598 CDCA8Q53HL2 280 aa19.96■□□□□ 0.79
NICN1-201ENST00000273598 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
NICN1-201ENST00000273598 PREX1Q8TCU6 1659 aa19.96■□□□□ 0.79
NICN1-201ENST00000273598 PPLO60437 1756 aa19.95■□□□□ 0.78
NICN1-201ENST00000273598 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
NICN1-201ENST00000273598 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP19.95■□□□□ 0.78
NICN1-201ENST00000273598 TMEM132EQ6IEE7 984 aa19.94■□□□□ 0.78
NICN1-201ENST00000273598 PIK3C2GO75747 1445 aa19.94■□□□□ 0.78
NICN1-201ENST00000273598 PANK3Q9H999 370 aa19.94■□□□□ 0.78
NICN1-201ENST00000273598 TRAK1Q9UPV9 953 aa19.93■□□□□ 0.78
NICN1-201ENST00000273598 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
NICN1-201ENST00000273598 ERVK-7P63135 1459 aa19.93■□□□□ 0.78
NICN1-201ENST00000273598 SLC24A1O60721 1099 aa19.91■□□□□ 0.78
NICN1-201ENST00000273598 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa19.89■□□□□ 0.77
NICN1-201ENST00000273598 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
NICN1-201ENST00000273598 RALBP1Q15311 655 aa19.89■□□□□ 0.77
NICN1-201ENST00000273598 TMC1Q8TDI8 760 aa19.89■□□□□ 0.77
NICN1-201ENST00000273598 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
NICN1-201ENST00000273598 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
NICN1-201ENST00000273598 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
NICN1-201ENST00000273598 ZMYM3Q14202 1370 aa19.87■□□□□ 0.77
NICN1-201ENST00000273598 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa19.86■□□□□ 0.77
NICN1-201ENST00000273598 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa19.86■□□□□ 0.77
NICN1-201ENST00000273598 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
NICN1-201ENST00000273598 MYO5BQ9ULV0 1848 aa19.85■□□□□ 0.77
NICN1-201ENST00000273598 KNSTRNQ9Y448 316 aa19.84■□□□□ 0.77
NICN1-201ENST00000273598 ZFYVE9O95405 1425 aa19.83■□□□□ 0.76
NICN1-201ENST00000273598 STK26Q9P289 416 aa19.82■□□□□ 0.76
NICN1-201ENST00000273598 ADGRB1O14514 1584 aa19.82■□□□□ 0.76
NICN1-201ENST00000273598 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa19.81■□□□□ 0.76
NICN1-201ENST00000273598 PARD3Q8TEW0 1356 aa19.79■□□□□ 0.76
NICN1-201ENST00000273598 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP19.78■□□□□ 0.76
NICN1-201ENST00000273598 NLRP13Q86W25 1043 aa19.78■□□□□ 0.76
NICN1-201ENST00000273598 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa19.78■□□□□ 0.76
NICN1-201ENST00000273598 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
NICN1-201ENST00000273598 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
NICN1-201ENST00000273598 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.76■□□□□ 0.75
NICN1-201ENST00000273598 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
NICN1-201ENST00000273598 A2ML1A8K2U0 1454 aa19.76■□□□□ 0.75
NICN1-201ENST00000273598 MYO3AQ8NEV4 1616 aa19.76■□□□□ 0.75
NICN1-201ENST00000273598 TNRQ92752 1358 aa19.75■□□□□ 0.75
NICN1-201ENST00000273598 RIMS2Q9UQ26 1411 aa19.74■□□□□ 0.75
NICN1-201ENST00000273598 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
NICN1-201ENST00000273598 QRICH2Q9H0J4 1663 aa19.72■□□□□ 0.75
NICN1-201ENST00000273598 POGKQ9P215 609 aa19.72■□□□□ 0.75
NICN1-201ENST00000273598 EVC2Q86UK5 1308 aa19.72■□□□□ 0.75
NICN1-201ENST00000273598 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
NICN1-201ENST00000273598 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP19.71■□□□□ 0.75
NICN1-201ENST00000273598 HDGFP51858 240 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
NICN1-201ENST00000273598 BCANQ96GW7 911 aa19.71■□□□□ 0.75
NICN1-201ENST00000273598 ZBED9Q6R2W3 1325 aa19.7■□□□□ 0.74
NICN1-201ENST00000273598 MYOM1P52179 1685 aa19.7■□□□□ 0.74
NICN1-201ENST00000273598 PRAM1Q96QH2 718 aa19.69■□□□□ 0.74
NICN1-201ENST00000273598 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
NICN1-201ENST00000273598 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa19.69■□□□□ 0.74
NICN1-201ENST00000273598 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa19.69■□□□□ 0.74
NICN1-201ENST00000273598 ALKQ9UM73 1620 aa19.68■□□□□ 0.74
NICN1-201ENST00000273598 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa19.68■□□□□ 0.74
NICN1-201ENST00000273598 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
NICN1-201ENST00000273598 CARD14Q9BXL6 1004 aa19.67■□□□□ 0.74
NICN1-201ENST00000273598 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
NICN1-201ENST00000273598 CABP2Q9NPB3 220 aa19.66■□□□□ 0.74
NICN1-201ENST00000273598 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
NICN1-201ENST00000273598 NEFLP07196 543 aa19.65■□□□□ 0.74
NICN1-201ENST00000273598 PPP2R1AP30153 589 aa19.64■□□□□ 0.73
NICN1-201ENST00000273598 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
NICN1-201ENST00000273598 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
NICN1-201ENST00000273598 FKBP8Q14318 412 aa19.62■□□□□ 0.73
NICN1-201ENST00000273598 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
NICN1-201ENST00000273598 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa19.61■□□□□ 0.73
NICN1-201ENST00000273598 PTPRMP28827 1452 aa19.61■□□□□ 0.73
NICN1-201ENST00000273598 TMEM2Q9UHN6 1383 aa19.61■□□□□ 0.73
NICN1-201ENST00000273598 TULP4Q9NRJ4 1543 aa19.6■□□□□ 0.73
NICN1-201ENST00000273598 WAPLQ7Z5K2 1190 aa19.59■□□□□ 0.73
NICN1-201ENST00000273598 NSD3Q9BZ95 1437 aa19.59■□□□□ 0.73
NICN1-201ENST00000273598 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 148.2 ms