RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RIMS2Q9UQ26 1411 aa29.12■■■□□ 2.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.12■■■□□ 2.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LTKP29376 864 aa29.1■■■□□ 2.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.09■■■□□ 2.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZFYVE9O95405 1425 aa29.09■■■□□ 2.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.09■■■□□ 2.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.08■■■□□ 2.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARHGAP23Q9P227 1491 aa29.07■■■□□ 2.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLIT1O75093 1534 aa29.06■■■□□ 2.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.06■■■□□ 2.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EID1Q9Y6B2 187 aa29.04■■■□□ 2.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PPLO60437 1756 aa29.02■■■□□ 2.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.02■■■□□ 2.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANKLE2Q86XL3 938 aa29.02■■■□□ 2.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.02■■■□□ 2.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IFT172Q9UG01 1749 aa29■■■□□ 2.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MYOM2P54296 1465 aa28.96■■■□□ 2.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.96■■■□□ 2.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BCANQ96GW7 911 aa28.96■■■□□ 2.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.93■■■□□ 2.22
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.92■■■□□ 2.22
SH3BGRL3-201ENST00000270792 STAC3Q96MF2 364 aa28.92■■■□□ 2.22
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.91■■■□□ 2.22
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PIK3C2GO75747 1445 aa28.9■■■□□ 2.22
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.89■■■□□ 2.21
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.89■■■□□ 2.21
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
SH3BGRL3-201ENST00000270792 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
SH3BGRL3-201ENST00000270792 STRCQ7RTU9 1775 aa28.86■■■□□ 2.21
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.84■■■□□ 2.21
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.84■■■□□ 2.21
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MED14O60244 1454 aa28.84■■■□□ 2.21
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NBPF1Q3BBV0 1214 aa28.83■■■□□ 2.21
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IQGAP1P46940 1657 aa28.83■■■□□ 2.21
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.82■■■□□ 2.2
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.8■■■□□ 2.2
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ALKQ9UM73 1620 aa28.8■■■□□ 2.2
SH3BGRL3-201ENST00000270792 METP08581 1390 aa28.77■■■□□ 2.2
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TBX22Q9Y458 520 aa28.76■■■□□ 2.19
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.74■■■□□ 2.19
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.73■■■□□ 2.19
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.73■■■□□ 2.19
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
SH3BGRL3-201ENST00000270792 STK26Q9P289 416 aa28.7■■■□□ 2.18
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADGRB1O14514 1584 aa28.69■■■□□ 2.18
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.68■■■□□ 2.18
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.68■■■□□ 2.18
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LAMC1P11047 1609 aa28.68■■■□□ 2.18
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DIP2AQ14689 1571 aa28.68■■■□□ 2.18
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.68■■■□□ 2.18
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PTPRUQ92729 1446 aa28.67■■■□□ 2.18
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.64■■■□□ 2.18
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.64■■■□□ 2.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.64■■■□□ 2.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa28.64■■■□□ 2.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KCNA6P17658 529 aa28.6■■■□□ 2.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PIK3R4Q99570 1358 aa28.59■■■□□ 2.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ABCC11Q96J66 1382 aa28.56■■■□□ 2.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ROBO2Q9HCK4 1378 aa28.54■■■□□ 2.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 USP47Q96K76 1375 aa28.53■■■□□ 2.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.53■■■□□ 2.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.52■■■□□ 2.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.51■■■□□ 2.15
SH3BGRL3-201ENST00000270792 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRAM1Q96QH2 718 aa28.51■■■□□ 2.15
SH3BGRL3-201ENST00000270792 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.5■■■□□ 2.15
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TECPR2O15040 1411 aa28.5■■■□□ 2.15
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NWD1Q149M9 1564 aa28.49■■■□□ 2.15
SH3BGRL3-201ENST00000270792 POGKQ9P215 609 aa28.48■■■□□ 2.15
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa28.47■■■□□ 2.15
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PTCH1Q13635 1447 aa28.46■■■□□ 2.15
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CPS1P31327 1500 aa28.45■■■□□ 2.15
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.15
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DLC1Q96QB1 1528 aa28.45■■■□□ 2.14
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.45■■■□□ 2.14
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SIRT1Q96EB6 747 aa28.42■■■□□ 2.14
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.42■■■□□ 2.14
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMEM94Q12767 1356 aa28.39■■■□□ 2.14
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