RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253968.10

BARX1-201, Transcript of BARX homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BARX1, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX1-201ENST00000253968 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa37.64■■■■□ 3.62
BARX1-201ENST00000253968 PPLO60437 1756 aa37.64■■■■□ 3.62
BARX1-201ENST00000253968 IFT172Q9UG01 1749 aa37.63■■■■□ 3.62
BARX1-201ENST00000253968 TONSLQ96HA7 1378 aa37.61■■■■□ 3.61
BARX1-201ENST00000253968 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP37.56■■■■□ 3.6
BARX1-201ENST00000253968 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP37.56■■■■□ 3.6
BARX1-201ENST00000253968 L3MBTL2Q969R5 705 aa37.56■■■■□ 3.6
BARX1-201ENST00000253968 EID1Q9Y6B2 187 aa37.56■■■■□ 3.6
BARX1-201ENST00000253968 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP37.56■■■■□ 3.6
BARX1-201ENST00000253968 HDGFP51858 240 aaKnown RBP37.56■■■■□ 3.6
BARX1-201ENST00000253968 LTKP29376 864 aa37.55■■■■□ 3.6
BARX1-201ENST00000253968 TXNDC2Q86VQ3 553 aa37.55■■■■□ 3.6
BARX1-201ENST00000253968 ANKLE2Q86XL3 938 aa37.55■■■■□ 3.6
BARX1-201ENST00000253968 DCAF11Q8TEB1 546 aa37.55■■■■□ 3.6
BARX1-201ENST00000253968 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP37.55■■■■□ 3.6
BARX1-201ENST00000253968 MYOM2P54296 1465 aa37.52■■■■□ 3.6
BARX1-201ENST00000253968 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP37.51■■■■□ 3.6
BARX1-201ENST00000253968 VGFO15240 615 aaPredicted RBP37.5■■■■□ 3.59
BARX1-201ENST00000253968 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa37.49■■■■□ 3.59
BARX1-201ENST00000253968 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa37.49■■■■□ 3.59
BARX1-201ENST00000253968 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa37.47■■■■□ 3.59
BARX1-201ENST00000253968 STRCQ7RTU9 1775 aa37.47■■■■□ 3.59
BARX1-201ENST00000253968 STAC3Q96MF2 364 aa37.46■■■■□ 3.59
BARX1-201ENST00000253968 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa37.45■■■■□ 3.59
BARX1-201ENST00000253968 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa37.44■■■■□ 3.58
BARX1-201ENST00000253968 MED14O60244 1454 aa37.43■■■■□ 3.58
BARX1-201ENST00000253968 NRXN1Q9ULB1 1477 aa37.43■■■■□ 3.58
BARX1-201ENST00000253968 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP37.4■■■■□ 3.58
BARX1-201ENST00000253968 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP37.39■■■■□ 3.58
BARX1-201ENST00000253968 IQGAP1P46940 1657 aa37.38■■■■□ 3.57
BARX1-201ENST00000253968 PIK3C2GO75747 1445 aa37.38■■■■□ 3.57
BARX1-201ENST00000253968 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa37.37■■■■□ 3.57
BARX1-201ENST00000253968 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa37.36■■■■□ 3.57
BARX1-201ENST00000253968 PRAG1Q86YV5 1406 aa37.35■■■■□ 3.57
BARX1-201ENST00000253968 BCANQ96GW7 911 aa37.35■■■■□ 3.57
BARX1-201ENST00000253968 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa37.3■■■■□ 3.56
BARX1-201ENST00000253968 ALKQ9UM73 1620 aa37.27■■■■□ 3.56
BARX1-201ENST00000253968 DIP2AQ14689 1571 aa37.27■■■■□ 3.56
BARX1-201ENST00000253968 LAMC1P11047 1609 aa37.26■■■■□ 3.56
BARX1-201ENST00000253968 SLC26A8Q96RN1 970 aa37.26■■■■□ 3.55
BARX1-201ENST00000253968 NBPF8Q3BBV2 869 aa37.25■■■■□ 3.55
BARX1-201ENST00000253968 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP37.24■■■■□ 3.55
BARX1-201ENST00000253968 CFAP70Q5T0N1 1121 aa37.22■■■■□ 3.55
BARX1-201ENST00000253968 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP37.22■■■■□ 3.55
BARX1-201ENST00000253968 DMRT2Q9Y5R5 561 aa37.22■■■■□ 3.55
BARX1-201ENST00000253968 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa37.22■■■■□ 3.55
BARX1-201ENST00000253968 TBX22Q9Y458 520 aa37.2■■■■□ 3.55
BARX1-201ENST00000253968 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa37.2■■■■□ 3.55
BARX1-201ENST00000253968 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa37.15■■■■□ 3.54
BARX1-201ENST00000253968 METP08581 1390 aa37.14■■■■□ 3.54
BARX1-201ENST00000253968 RALGAPBQ86X10 1494 aa37.13■■■■□ 3.53
BARX1-201ENST00000253968 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP37.11■■■■□ 3.53
BARX1-201ENST00000253968 ADGRB1O14514 1584 aa37.11■■■■□ 3.53
BARX1-201ENST00000253968 NBPF1Q3BBV0 1214 aa37.1■■■■□ 3.53
BARX1-201ENST00000253968 PIK3R4Q99570 1358 aa37.09■■■■□ 3.53
BARX1-201ENST00000253968 TMEM132EQ6IEE7 984 aa37.09■■■■□ 3.53
BARX1-201ENST00000253968 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP37.07■■■■□ 3.53
BARX1-201ENST00000253968 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP37.05■■■■□ 3.52
BARX1-201ENST00000253968 PTPRUQ92729 1446 aa37.04■■■■□ 3.52
BARX1-201ENST00000253968 GPRASP1Q5JY77 1395 aa37.02■■■■□ 3.52
BARX1-201ENST00000253968 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP37.01■■■■□ 3.52
BARX1-201ENST00000253968 NWD1Q149M9 1564 aa37■■■■□ 3.51
BARX1-201ENST00000253968 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP36.99■■■■□ 3.51
BARX1-201ENST00000253968 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP36.99■■■■□ 3.51
BARX1-201ENST00000253968 KCNA6P17658 529 aa36.97■■■■□ 3.51
BARX1-201ENST00000253968 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa36.97■■■■□ 3.51
BARX1-201ENST00000253968 STK26Q9P289 416 aa36.96■■■■□ 3.51
BARX1-201ENST00000253968 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP36.96■■■■□ 3.51
BARX1-201ENST00000253968 STRCP1A6NGW2 1772 aa36.96■■■■□ 3.51
BARX1-201ENST00000253968 CARD11Q9BXL7 1154 aa36.95■■■■□ 3.51
BARX1-201ENST00000253968 KNDC1Q76NI1 1749 aa36.95■■■■□ 3.51
BARX1-201ENST00000253968 ABCC11Q96J66 1382 aa36.93■■■■□ 3.5
BARX1-201ENST00000253968 TECPR2O15040 1411 aa36.92■■■■□ 3.5
BARX1-201ENST00000253968 CPS1P31327 1500 aa36.9■■■■□ 3.5
BARX1-201ENST00000253968 TRAK1Q9UPV9 953 aa36.9■■■■□ 3.5
BARX1-201ENST00000253968 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP36.89■■■■□ 3.5
BARX1-201ENST00000253968 PTCH1Q13635 1447 aa36.88■■■■□ 3.49
BARX1-201ENST00000253968 DLC1Q96QB1 1528 aa36.87■■■■□ 3.49
BARX1-201ENST00000253968 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP36.87■■■■□ 3.49
BARX1-201ENST00000253968 ROBO2Q9HCK4 1378 aa36.86■■■■□ 3.49
BARX1-201ENST00000253968 FAM135BQ49AJ0 1406 aa36.8■■■■□ 3.48
BARX1-201ENST00000253968 LTBP4Q8N2S1 1624 aa36.8■■■■□ 3.48
BARX1-201ENST00000253968 SIRT1Q96EB6 747 aa36.8■■■■□ 3.48
BARX1-201ENST00000253968 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP36.79■■■■□ 3.48
BARX1-201ENST00000253968 USP47Q96K76 1375 aa36.78■■■■□ 3.48
BARX1-201ENST00000253968 PRAM1Q96QH2 718 aa36.77■■■■□ 3.48
BARX1-201ENST00000253968 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.48
BARX1-201ENST00000253968 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa36.76■■■■□ 3.47
BARX1-201ENST00000253968 WAPLQ7Z5K2 1190 aa36.75■■■■□ 3.47
BARX1-201ENST00000253968 LRRC7Q96NW7 1537 aa36.74■■■■□ 3.47
BARX1-201ENST00000253968 POGKQ9P215 609 aa36.74■■■■□ 3.47
BARX1-201ENST00000253968 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
BARX1-201ENST00000253968 TMEM94Q12767 1356 aa36.71■■■■□ 3.47
BARX1-201ENST00000253968 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.47
BARX1-201ENST00000253968 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP36.69■■■■□ 3.46
BARX1-201ENST00000253968 QRICH2Q9H0J4 1663 aa36.69■■■■□ 3.46
BARX1-201ENST00000253968 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
BARX1-201ENST00000253968 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP36.68■■■■□ 3.46
BARX1-201ENST00000253968 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP36.66■■■■□ 3.46
BARX1-201ENST00000253968 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa36.65■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.5 ms