RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 NOS1P29475 1434 aa31.28■■■□□ 2.6
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HOXD9-201ENST00000249499 DISP3Q9P2K9 1392 aa31.27■■■□□ 2.6
HOXD9-201ENST00000249499 YEATS2Q9ULM3 1422 aa31.25■■■□□ 2.59
HOXD9-201ENST00000249499 SLC24A1O60721 1099 aa31.24■■■□□ 2.59
HOXD9-201ENST00000249499 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa31.23■■■□□ 2.59
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HOXD9-201ENST00000249499 PIK3C2BO00750 1634 aa31.22■■■□□ 2.59
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HOXD9-201ENST00000249499 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa31.16■■■□□ 2.58
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HOXD9-201ENST00000249499 RNF123Q5XPI4 1314 aa30.58■■■□□ 2.49
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HOXD9-201ENST00000249499 RIMS2Q9UQ26 1411 aa30.55■■■□□ 2.48
HOXD9-201ENST00000249499 NSD3Q9BZ95 1437 aa30.53■■■□□ 2.48
HOXD9-201ENST00000249499 DLC1Q96QB1 1528 aa30.53■■■□□ 2.48
HOXD9-201ENST00000249499 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP30.52■■■□□ 2.48
HOXD9-201ENST00000249499 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa30.52■■■□□ 2.48
HOXD9-201ENST00000249499 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP30.51■■■□□ 2.47
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