RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060956.12

Trappc1-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ltbp4Q8K4G1 1666 aa9.1□□□□□ -0.95
Trappc1-201ENSMUST00000060956 LipiF6YQT7 476 aa9.1□□□□□ -0.95
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa9.09□□□□□ -0.95
Trappc1-201ENSMUST00000060956 E2f4Q8R0K9 410 aa9.09□□□□□ -0.95
Trappc1-201ENSMUST00000060956 OvosQ3UU35 1456 aa9.08□□□□□ -0.96
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
Trappc1-201ENSMUST00000060956 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa9.08□□□□□ -0.96
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Prex2Q3LAC4 1598 aa9.07□□□□□ -0.96
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lhx8O35652 367 aa9.07□□□□□ -0.96
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Adnp2Q8CHC8 1165 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
Trappc1-201ENSMUST00000060956 EdaraddQ8VHX2 208 aa9.07□□□□□ -0.96
Trappc1-201ENSMUST00000060956 BlmO88700 1416 aa9.06□□□□□ -0.96
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Masp1P98064 704 aa9.06□□□□□ -0.96
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cul9Q80TT8 1865 aa9.05□□□□□ -0.96
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dip2cE9PWR4 1557 aa9.05□□□□□ -0.96
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ankrd26Q811D2 1581 aa9.05□□□□□ -0.96
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Magi1Q6RHR9 1471 aa9.05□□□□□ -0.96
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc12a5Q91V14 1138 aa9.05□□□□□ -0.96
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kif7B7ZNG0 1348 aa9.05□□□□□ -0.96
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Clip1Q922J3 1391 aa9.04□□□□□ -0.96
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hoxa2P31245 372 aa9.04□□□□□ -0.96
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Foxd4Q60688 444 aa9.04□□□□□ -0.96
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Aebp1Q640N1 1128 aa9.04□□□□□ -0.96
Trappc1-201ENSMUST00000060956 OscarQ8VBT3 265 aa9.04□□□□□ -0.96
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc24a3Q99PD7 645 aa9.04□□□□□ -0.96
Trappc1-201ENSMUST00000060956 JmyQ9QXM1 983 aa9.04□□□□□ -0.96
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fyco1Q8VDC1 1437 aa9.04□□□□□ -0.96
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ncoa3O09000 1398 aa9.03□□□□□ -0.96
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa9.03□□□□□ -0.96
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Afap1Q80YS6 731 aa9.03□□□□□ -0.96
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lemd3Q9WU40 921 aa9.03□□□□□ -0.96
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Arap1Q4LDD4 1452 aa9.02□□□□□ -0.96
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ncoa2Q61026 1462 aa9.02□□□□□ -0.96
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa9.02□□□□□ -0.97
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Topaz1E5FYH1 1653 aa9.01□□□□□ -0.97
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pde8bE9Q4S1 865 aa9.01□□□□□ -0.97
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ncoa1P70365 1447 aa9.01□□□□□ -0.97
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Scarf1Q5ND28 820 aa9.01□□□□□ -0.97
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Prrt3Q6PE13 971 aa9.01□□□□□ -0.97
Trappc1-201ENSMUST00000060956 RereQ80TZ9 1558 aa9□□□□□ -0.97
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tpcn2Q8BWC0 731 aa9□□□□□ -0.97
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Bcl11bQ99PV8 884 aa9□□□□□ -0.97
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Erich3F6QRE9 1637 aa9□□□□□ -0.97
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kif27Q7M6Z4 1394 aa8.99□□□□□ -0.97
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Abca6Q8K441 1624 aa8.99□□□□□ -0.97
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cfap65Q3V0B4 1847 aa8.99□□□□□ -0.97
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lrfn2Q80TG9 788 aa8.99□□□□□ -0.97
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Crim1Q9JLL0 1037 aa8.99□□□□□ -0.97
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Myom2Q14BI5 1463 aa8.98□□□□□ -0.97
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vsig10D3YX43 558 aa8.98□□□□□ -0.97
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Myt1lP97500 1187 aa8.98□□□□□ -0.97
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kidins220E9Q9B7 1793 aa8.97□□□□□ -0.97
Trappc1-201ENSMUST00000060956 RydenQ8CAK3 290 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dip2bQ3UH60 1574 aa8.97□□□□□ -0.97
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa8.96□□□□□ -0.97
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gli3Q61602 1583 aa8.96□□□□□ -0.97
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Irf6P97431 467 aa8.96□□□□□ -0.98
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pdcd7Q9WTY1 482 aa8.96□□□□□ -0.98
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kdm5cP41230 1554 aa8.95□□□□□ -0.98
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hmx1O70218 332 aa8.95□□□□□ -0.98
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Apba2P98084 750 aa8.95□□□□□ -0.98
Trappc1-201ENSMUST00000060956 GnpatP98192 678 aa8.95□□□□□ -0.98
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trappc8E9PWG2 1437 aa8.95□□□□□ -0.98
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa8.95□□□□□ -0.98
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Iqsec2Q5DU25 1478 aa8.95□□□□□ -0.98
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Talpid3E9PV87 1520 aa8.95□□□□□ -0.98
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lhx6Q9R1R0 363 aa8.93□□□□□ -0.98
Trappc1-201ENSMUST00000060956 XpcP51612 930 aa8.92□□□□□ -0.98
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Klra4Q60651 263 aa8.92□□□□□ -0.98
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slain2Q8CI08 581 aa8.92□□□□□ -0.98
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ak7Q9D2H2 614 aa8.92□□□□□ -0.98
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hecw1Q8K4P8 1604 aa8.91□□□□□ -0.98
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Arhgap5P97393 1501 aa8.91□□□□□ -0.98
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mug1P28665 1476 aa8.91□□□□□ -0.98
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Unc5aQ8K1S4 898 aa8.91□□□□□ -0.98
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmem132aQ922P8 1018 aa8.91□□□□□ -0.98
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa8.91□□□□□ -0.98
Trappc1-201ENSMUST00000060956 AlkP97793 1621 aa8.9□□□□□ -0.99
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa8.9□□□□□ -0.99
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cep162Q6ZQ06 1403 aa8.89□□□□□ -0.99
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Prr7Q3V0I2 269 aa8.89□□□□□ -0.99
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cypt2Q6P924 180 aa8.89□□□□□ -0.99
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rapgef3Q8VCC8 918 aa8.89□□□□□ -0.99
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pbx2O35984 430 aa8.88□□□□□ -0.99
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Psen1P49769 467 aa8.88□□□□□ -0.99
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa8.88□□□□□ -0.99
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zbtb38Q3LR78 1197 aa8.87□□□□□ -0.99
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rasgrp4Q8BTM9 673 aa8.87□□□□□ -0.99
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Bcl9Q9D219 1425 aa8.87□□□□□ -0.99
Trappc1-201ENSMUST00000060956 ElnP54320 860 aa8.86□□□□□ -0.99
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hs1bp3Q3TC93 395 aa8.86□□□□□ -0.99
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fmr1nbQ80ZA7 238 aa8.86□□□□□ -0.99
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sall2Q9QX96 1004 aa8.86□□□□□ -0.99
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trpm2Q91YD4 1506 aa8.85□□□□□ -0.99
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tdrd9Q14BI7 1383 aa8.85□□□□□ -0.99
Trappc1-201ENSMUST00000060956 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 38.7 ms