Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Lhx8O35652 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Lhx8O35652 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Lhx8O35652 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lhx8O35652 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Lhx8O35652 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Lhx8O35652 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Lhx8O35652 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
Lhx8O35652 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lhx8O35652 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Lhx8O35652 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lhx8O35652 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Lhx8O35652 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lhx8O35652 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lhx8O35652 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lhx8O35652 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lhx8O35652 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lhx8O35652 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Lhx8O35652 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lhx8O35652 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Lhx8O35652 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lhx8O35652 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Lhx8O35652 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Lhx8O35652 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lhx8O35652 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Lhx8O35652 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lhx8O35652 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lhx8O35652 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lhx8O35652 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lhx8O35652 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lhx8O35652 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lhx8O35652 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lhx8O35652 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lhx8O35652 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lhx8O35652 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lhx8O35652 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lhx8O35652 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Lhx8O35652 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lhx8O35652 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lhx8O35652 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lhx8O35652 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lhx8O35652 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lhx8O35652 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lhx8O35652 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lhx8O35652 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lhx8O35652 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lhx8O35652 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lhx8O35652 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Lhx8O35652 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lhx8O35652 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lhx8O35652 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lhx8O35652 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lhx8O35652 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lhx8O35652 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lhx8O35652 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lhx8O35652 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lhx8O35652 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lhx8O35652 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Lhx8O35652 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lhx8O35652 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lhx8O35652 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lhx8O35652 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lhx8O35652 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lhx8O35652 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Lhx8O35652 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lhx8O35652 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lhx8O35652 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lhx8O35652 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Lhx8O35652 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lhx8O35652 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Lhx8O35652 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lhx8O35652 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Lhx8O35652 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lhx8O35652 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lhx8O35652 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lhx8O35652 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lhx8O35652 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Lhx8O35652 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lhx8O35652 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lhx8O35652 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lhx8O35652 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lhx8O35652 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lhx8O35652 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Lhx8O35652 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Lhx8O35652 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Lhx8O35652 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lhx8O35652 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lhx8O35652 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lhx8O35652 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lhx8O35652 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lhx8O35652 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lhx8O35652 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lhx8O35652 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lhx8O35652 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lhx8O35652 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lhx8O35652 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lhx8O35652 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lhx8O35652 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lhx8O35652 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lhx8O35652 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms