RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047904.3

Hoxd4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Hoxd4, Length 2,560 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Atp7aQ64430 1491 aa22.42■■□□□ 1.18
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mast1Q9R1L5 1570 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ak9G3UYQ4 1894 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Clstn2Q9ER65 966 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pde4cQ3UEI1 686 aa22.39■■□□□ 1.17
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Chrna2Q91X60 512 aa22.37■■□□□ 1.17
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 4933402E13RikQ9D4D2 429 aa22.37■■□□□ 1.17
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Chmp5Q9D7S9 219 aa22.36■■□□□ 1.17
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Paxip1Q6NZQ4 1056 aa22.35■■□□□ 1.17
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kidins220E9Q9B7 1793 aa22.34■■□□□ 1.17
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tarbp1E9Q368 1579 aa22.34■■□□□ 1.17
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa22.32■■□□□ 1.16
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Q7TT23 1179 aa22.31■■□□□ 1.16
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Neurl4Q5NCX5 1563 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Znf316Q6PGE4 1016 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zmym3Q9JLM4 1370 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Hecw1Q8K4P8 1604 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ttc41Q692V3 1318 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rock1P70335 1354 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zfyve16Q80U44 1528 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa22.27■■□□□ 1.16
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Polr3aB2RXC6 1390 aa22.27■■□□□ 1.16
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kif3bQ61771 747 aa22.27■■□□□ 1.16
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tex2Q6ZPJ0 1128 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Sall3Q62255 1320 aa22.26■■□□□ 1.15
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Dusp27Q148W8 1138 aa22.25■■□□□ 1.15
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zfp91Q62511 572 aa22.25■■□□□ 1.15
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ipo8Q7TMY7 1010 aa22.25■■□□□ 1.15
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Spryd3E9Q9B3 442 aa22.24■■□□□ 1.15
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ak7Q9D2H2 614 aa22.24■■□□□ 1.15
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tmc1Q8R4P5 757 aa22.23■■□□□ 1.15
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Robo2Q7TPD3 1470 aa22.23■■□□□ 1.15
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Abca9Q8K449 1623 aa22.23■■□□□ 1.15
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 ShprhQ7TPQ3 1674 aa22.21■■□□□ 1.15
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Lemd3Q9WU40 921 aa22.21■■□□□ 1.15
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 PogkQ80TC5 607 aa22.2■■□□□ 1.14
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Adamts13Q769J6 1426 aa22.19■■□□□ 1.14
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Trim30dE9PWL0 497 aa22.18■■□□□ 1.14
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rwdd1Q9CQK7 243 aa22.18■■□□□ 1.14
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa22.17■■□□□ 1.14
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Nom1Q3UFM5 854 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 CatipB9EKE5 520 aa22.16■■□□□ 1.14
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm6268A2A3U9 297 aa22.14■■□□□ 1.14
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kdm2aP59997 1161 aa22.14■■□□□ 1.14
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cep170Q6A065 1588 aa22.14■■□□□ 1.13
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kif16bB1AVY7 1312 aa22.14■■□□□ 1.13
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Dcaf11Q91VU6 549 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ccdc183A2AJB1 534 aa22.12■■□□□ 1.13
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Irf5P56477 497 aa22.11■■□□□ 1.13
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Abca17E9PX95 1733 aa22.1■■□□□ 1.13
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Stk24Q99KH8 431 aa22.1■■□□□ 1.13
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 IbspQ61711 324 aa22.07■■□□□ 1.12
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mcm4P49717 862 aa22.04■■□□□ 1.12
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