RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047904.3

Hoxd4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Hoxd4, Length 2,560 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Atp7aQ64430 1491 aa22.42■■□□□ 1.18
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cfap74Q3UY96 1578 aa22.42■■□□□ 1.18
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zscan21Q07231 555 aa22.41■■□□□ 1.18
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mast1Q9R1L5 1570 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ak9G3UYQ4 1894 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Clstn2Q9ER65 966 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pde4cQ3UEI1 686 aa22.39■■□□□ 1.17
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 AI481877A2ALV5 1481 aa22.37■■□□□ 1.17
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Chrna2Q91X60 512 aa22.37■■□□□ 1.17
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 4933402E13RikQ9D4D2 429 aa22.37■■□□□ 1.17
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Igf1rQ60751 1373 aa22.36■■□□□ 1.17
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Chmp5Q9D7S9 219 aa22.36■■□□□ 1.17
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Paxip1Q6NZQ4 1056 aa22.35■■□□□ 1.17
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kidins220E9Q9B7 1793 aa22.34■■□□□ 1.17
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tarbp1E9Q368 1579 aa22.34■■□□□ 1.17
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Prdm16A2A935 1275 aa22.33■■□□□ 1.17
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa22.32■■□□□ 1.16
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Htatsf1Q8BGC0 757 aa22.32■■□□□ 1.16
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Erich6D3Z6S9 713 aa22.31■■□□□ 1.16
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Q7TT23 1179 aa22.31■■□□□ 1.16
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Neurl4Q5NCX5 1563 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Znf316Q6PGE4 1016 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zmym3Q9JLM4 1370 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Hecw1Q8K4P8 1604 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ttc41Q692V3 1318 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rock1P70335 1354 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zfyve16Q80U44 1528 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa22.27■■□□□ 1.16
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Polr3aB2RXC6 1390 aa22.27■■□□□ 1.16
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kif3bQ61771 747 aa22.27■■□□□ 1.16
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tex2Q6ZPJ0 1128 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Sall3Q62255 1320 aa22.26■■□□□ 1.15
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Dusp27Q148W8 1138 aa22.25■■□□□ 1.15
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zfp91Q62511 572 aa22.25■■□□□ 1.15
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ipo8Q7TMY7 1010 aa22.25■■□□□ 1.15
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Spryd3E9Q9B3 442 aa22.24■■□□□ 1.15
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ak7Q9D2H2 614 aa22.24■■□□□ 1.15
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tmc1Q8R4P5 757 aa22.23■■□□□ 1.15
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Robo2Q7TPD3 1470 aa22.23■■□□□ 1.15
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Iqgap1Q9JKF1 1657 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rbm10Q99KG3 930 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Abca9Q8K449 1623 aa22.23■■□□□ 1.15
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rrp12Q6P5B0 1295 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 ShprhQ7TPQ3 1674 aa22.21■■□□□ 1.15
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Lemd3Q9WU40 921 aa22.21■■□□□ 1.15
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 PogkQ80TC5 607 aa22.2■■□□□ 1.14
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Adamts13Q769J6 1426 aa22.19■■□□□ 1.14
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Trim30dE9PWL0 497 aa22.18■■□□□ 1.14
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rwdd1Q9CQK7 243 aa22.18■■□□□ 1.14
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa22.17■■□□□ 1.14
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Nom1Q3UFM5 854 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 CatipB9EKE5 520 aa22.16■■□□□ 1.14
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm6268A2A3U9 297 aa22.14■■□□□ 1.14
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kdm2aP59997 1161 aa22.14■■□□□ 1.14
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cep170Q6A065 1588 aa22.14■■□□□ 1.13
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kif16bB1AVY7 1312 aa22.14■■□□□ 1.13
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Dcaf11Q91VU6 549 aa22.13■■□□□ 1.13
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Nos1Q9Z0J4 1429 aa22.12■■□□□ 1.13
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ccdc183A2AJB1 534 aa22.12■■□□□ 1.13
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Irf5P56477 497 aa22.11■■□□□ 1.13
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Esx1O88933 382 aa22.1■■□□□ 1.13
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Il4rP16382 810 aa22.1■■□□□ 1.13
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa22.1■■□□□ 1.13
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Abca17E9PX95 1733 aa22.1■■□□□ 1.13
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa22.1■■□□□ 1.13
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm156Q58A37 223 aa22.1■■□□□ 1.13
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Stk24Q99KH8 431 aa22.1■■□□□ 1.13
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Nsd2Q8BVE8 1365 aa22.1■■□□□ 1.13
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Antxr1Q9CZ52 562 aa22.09■■□□□ 1.13
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Clcn1Q64347 994 aa22.09■■□□□ 1.13
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tpm2P58774 284 aa22.08■■□□□ 1.13
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa22.08■■□□□ 1.13
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cul9Q80TT8 1865 aa22.08■■□□□ 1.13
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tulp4Q9JIL5 1547 aa22.07■■□□□ 1.12
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 IbspQ61711 324 aa22.07■■□□□ 1.12
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 CrbnQ8C7D2 445 aa22.07■■□□□ 1.12
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 ArxO35085 564 aa22.06■■□□□ 1.12
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Plekhh1Q80TI1 1356 aa22.06■■□□□ 1.12
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ttc21bQ0HA38 1315 aa22.06■■□□□ 1.12
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Apbb1Q9QXJ1 710 aa22.05■■□□□ 1.12
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ptch1Q61115 1434 aa22.04■■□□□ 1.12
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mcm4P49717 862 aa22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 8.9 ms